Outils bioinformatiques appliquées à la biologie

Outils bioinformatiques appliquées à la biologie

  • ECTS

    2 crédits

  • Composante

    Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)

  • Volume horaire

    19,5h

Description

Description du cours et modalités pédagogiques : 

 

Cette unité complète les connaissances acquises en biologie moléculaire en permettant d’explorer et d’utiliser les séquences présentes dans les nombreuses bases de données. Plusieurs outils de bioinformatique seront utilisés pour analyser ces données, notamment par l’identification de gènes, de mutations, de domaines ou motifs, pouvant permettre de proposer des fonctions aux protéines et des phénotypes aux organismes étudiés.  

 

Le cours se compose des 4 chapitres suivants : 

 

I- Introduction de la Bioinformatique 

II- Les Bases de Données 

III- Les Formats 

IV- L’Alignement de Séquences 

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Objectifs

À la fin de cette UE, vous serez capable de :  

  • Rechercher et récupérer de l’information dans les bases de données. 
  • Convertir les données dans le format approprié 
  • Faire des alignements et comparaisons de séquences. 
  • Déterminer et Identifier des motifs ou domaines conservés 
  • Prédire à partir de séquences des fonctions ou phénotypes attendus. 
  • Choisir les logiciels et la démarche appropriée pour répondre à une problématique donnée 
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Heures d'enseignement

  • Outils bioinformatiques appliquées à la biologie - CMCours Magistral4,5h
  • Outils bioinformatiques appliquées à la biologie - TPTravaux Pratique15h

Pré-requis obligatoires

Connaissances solides en Biologie Moléculaire, avoir suivi les modules de Biologie Moléculaire (S3) et de Biologie Moléculaire Pratique (S5) 

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Contrôle des connaissances

1ère session : 

  • 100% contrôle continu écrit


2ème session : 

  • 100% examen Terminal écrit
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Compétences acquises

Compétences

Niveau d'acquisition

Communiquer et collaborerMaîtrise des outils numériquesx
Elaborer une démarche scientifiqueConcevoir et mettre en œuvre une démarche scientifique x
Modéliser un phénomène biologiquex
Analyser en se reposant sur un socle de connaissances scientifiquesDévelopper une argumentation avec esprit critiquex
Relier un phénomène macroscopique aux processus microscopiquesx