ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Description
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette unité complète les connaissances acquises en biologie moléculaire en permettant d’explorer et d’utiliser les séquences présentes dans les nombreuses bases de données. Plusieurs outils de bioinformatique seront utilisés pour analyser ces données, notamment par l’identification de gènes, de mutations, de domaines ou motifs, pouvant permettre de proposer des fonctions aux protéines et des phénotypes aux organismes étudiés.
Le cours se compose des 4 chapitres suivants :
I- Introduction de la Bioinformatique
II- Les Bases de Données
III- Les Formats
IV- L’Alignement de Séquences
Objectifs
À la fin de cette UE, vous serez capable de :
- Rechercher et récupérer de l’information dans les bases de données.
- Convertir les données dans le format approprié
- Faire des alignements et comparaisons de séquences.
- Déterminer et Identifier des motifs ou domaines conservés
- Prédire à partir de séquences des fonctions ou phénotypes attendus.
- Choisir les logiciels et la démarche appropriée pour répondre à une problématique donnée
Heures d'enseignement
- Outils bioinformatiques appliquées à la biologie - CMCours Magistral4,5h
- Outils bioinformatiques appliquées à la biologie - TPTravaux Pratique15h
Pré-requis obligatoires
Connaissances solides en Biologie Moléculaire, avoir suivi les modules de Biologie Moléculaire (S3) et de Biologie Moléculaire Pratique (S5)
Contrôle des connaissances
1ère session :
- 100% contrôle continu écrit
2ème session :
- 100% examen Terminal écrit
Compétences acquises
Compétences | Niveau d'acquisition | |
---|---|---|
Communiquer et collaborer | Maîtrise des outils numériques | x |
Elaborer une démarche scientifique | Concevoir et mettre en œuvre une démarche scientifique | x |
Modéliser un phénomène biologique | x | |
Analyser en se reposant sur un socle de connaissances scientifiques | Développer une argumentation avec esprit critique | x |
Relier un phénomène macroscopique aux processus microscopiques | x |