•  Méthodes analytiques 

• Électrophorèse : SDS PAGE, focalisation isoélectrique, électrophorèse bi-dimensionnelle, 
• Méthodes spectroscopiques : absorption UV visible, fluorescence, 
• Méthodes immunologiques : marquage des anticorps, western-blot, immunoprécipitation, dosages immunologiques. 

•  Méthodes préparatives : purification des protéines 

• Les sources de protéines : protéines recombinantes, 
• Extraction des protéines,
• Méthodes de séparation des protéines : chromatographie.  

• TP : Purification et caractérisation de la protéase chaperon Lon. 

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À travers des exemples concrets, apprentissage théorique et pratique des techniques de Biologie Moléculaire couramment utilisées dans un laboratoire.  

• Le cours se compose des 5 Chapitres suivants : 

I. Rappels sur la composition et la structure des acides nucléiques,  
II. Techniques de base de Biologie Moléculaire,  
III. Techniques d’amplification par PCR, 
IV. Techniques de clonage,  
V. Techniques de séquençage. 

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Cette UE est une initiation à la virologie.

Les virus sont le plus souvent associés à des maladies qu’elles soient humaines, animales ou végétales. Cet aspect sera abordé, ainsi que les méthodes permettant d’étudier les virus et leur classification.

De plus, l’importance des virus dans le fonctionnement des écosystèmes et l’évolution des êtres vivants sera également étudiée au travers de différents exemples.

Afin de compléter le cours, les étudiants travailleront sur une publication de recherche en virologie qui sera présentée au reste de la promotion. 

• Plan du cours : 

1- Historique et définition des virus, 

2- Structure des virus,  

3- Classification des virus,  

4- Cycles de multiplication des virus,  

5- Méthodes d’étude des virus,  

6- Interactions virus-virus et virus-hôte,  

7- Un modèle d’étude : le bactériophage,  

8- Défense contre les virus,  

9- Les provirus et les prophages,  

10- Les virus et le Cancer,  

11- Interactions virus-organismes,  

12- Les prions,  

13- Les virus végétaux et les viroïdes,  

14- La grippe,  

15- VIH-1,  

16- Covid19,  

17- Virus et environnement.  

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L’UE de génétique bactérienne présente les grands principes des bases moléculaires et génétiques permettant l'étude des mécanismes moléculaires chez les bactéries. Les différents types de mutations et les facteurs qui conduisent à leur apparition chez ces microorganismes ainsi que les différents mécanismes de recombinaison et transferts génétiques seront adressés. Quelques exemples des applications de la génétique bactérienne seront également présentés avec des exemples d’utilisation des différents mécanismes moléculaires vus tout au long du cours.

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Description du cours et modalités pédagogiques : 

Présenter la problématique des tests statistiques à partir d'exemples simples tirés de la biologie (tests d'ajustements, comparaison de moyennes et de fréquences) et leur mise en oeuvre avec le logiciel R. Les notions suivantes seront abordées : 

• Fluctuations d'échantillonnage. 
• Intervalles de confiance. 
• Principe des tests statistiques. 

• Tests d'ajustements à des lois de distribution. 
• Lien entre variables (Chi2 et corrélation) 
• Comparaison de moyennes. 
• Comparaison de variances. 
• Régression linéaire. 

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Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce cinquième semestre l’accent sera mis sur une introduction à la préparation à la certification en anglais, Test of English for International Communication (TOEIC).

Le TOEIC mesure les compétences de compréhension écrite et orale pour les niveaux débutant à avancé et détermine si une personne peut communiquer en anglais efficacement et avec aisance dans un contexte professionnel.

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Plus d'informations à la page suivante : https://formation.univ-pau.fr/fr/scolarite/ue-transverses.html

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Description du cours et modalités pédagogiques : 

Il s'agit ici de construire un projet de poursuite d’études ou professionnel, de définir votre plan d'action puis le mettre en œuvre en préparant vos candidatures. 

A cet effet, le parcours en ligne PEP'S 3 est composé des trois étapes proposant chacune des pistes audio, des diaporamas ou des infographies et des activités.  

Plan (simplifié) du cours :  

• Introduction  

• Avant de commencer : retour sur l’UE PEP’S 2 : Projet d’études et professionnel dans le supérieur en deuxième année de licence 
• Connaitre ses atouts et ses compétences 
• Explorer les possibles 
• Plan d’action : candidater 
• Que faire en cas de refus : propose des informations concernant la procédure à suivre en cas de refus d'admission en master. 

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Cette UE permet de compléter l’étude des grandes fonctions biologiques commencée avec l’UE physiologie animale 1.

La fonction de nutrition au sens large et les échanges entre l’organisme et son environnement seront au cœur de cette UE (Prise alimentaire et digestion, respiration, Excrétion, osmorégulation, thermorégulation).

L’objectif de cette UE de fin de licence est de donner une compréhension de l’organisme dans sa globalité en appréhendant notamment l’interaction entre les systèmes. Ces interactions et le système endocrine sont abordés en conclusion. 

• Plan du cours : 

I- Prise alimentaire et digestion,  

II- La respiration,  

III- Excrétion,  

IV- Thermorégulation. 

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Ce cours présente les différentes étapes du développement des plantes à fleurs, de la plantule à la plante sénescente. L’influence des facteurs environnementaux et hormonaux contrôlant la croissance et la reproduction des végétaux supérieurs sera étudiée en insistant sur les processus cellulaires et moléculaires impliqués. 

Les techniques de biotechnologie végétale (culture in vitro et utilisation des phytohormones, génie génétique, transgenèse) utilisées en amélioration des plantes sont également abordées. 

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• Ce cours aborde les notions suivantes :

• Le geste microbiologique,
• Isolement et caractérisation de souches pures,
• La croissance,
• Les bactéries d’intérêt sanitaire. 

• Plan du cours : 

• Méthodes de dénombrement des bactéries hétérotrophes aérobies d’un échantillon d’eau, 
• Identification de souches bactériennes, 
• Contrôle sanitaire d’un prélèvement d’eau,  
• Croissance et activité enzymatique d’une souche bactérienne pure. 

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• Plan du cours : 

• Partie 1 : Interaction rayonnement/matière,
• Partie 2 : Spectroscopiques IR : interprétation des spectres et dosage (analyse qualitative et quantitative),
• Partie 3 : Spectroscopie RMN : analyse qualitative.

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• Ce cours aborde les notions suivantes : 

• Introduction au développement d’un programme informatique, 
• Notions de bases pour l’écriture des programmes, 
• Compléments sur les types de données, 
• Fichiers, 
• Module, librairie, bibliothèque. 

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Certification Voltaire

Améliorer et certifier le niveau de français pour un usage professionnel. Le niveau visé à la certification Voltaire est un score de 800 validant une très bonne maîtrise de l’orthographe. La certification est préparée en ligne au cours de la 3eme année sur la plateforme du projet Voltaire.

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