Voir la page complète

Cette UE de remise à niveau (en chimie ou biologie selon les prérequis de l’étudiant(e)) a lieu sur les deux premières semaines du semestre impair afin de revoir, dans ces disciplines, les bases indispensables aux autres UE des parcours du Master.

Remise à niveau en Chimie :

• Rappels d’atomistique : structure de l’atome, configuration électronique des atomes et des molécules, géométrie des molécules ; lien vers la spectroscopie et la spectrométrie
• En solution aqueuse : rappels et applications environnementales ou analytiques des réactions acide-base, d’oxydo-réduction, de précipitation et de complexation.

Ou

Remise à niveau en Biologie :

• Biologie moléculaire : structure des acides nucléiques, constitution des génomes, réplication, transcription, traduction, séquençage, comparaison des gènes et applications, PCR et applications en microbiologie environnementale, hybridation in situ.
• Microbiologie : introduction aux grands domaines du vivant, structure et métabolisme des microorganismes procaryotes et eucaryotes inférieurs, notions des techniques en microbiologie
• Écologie microbienne : grands cycles biogéochimiques, notions de techniques en écologie microbienne.

Voir la page complète

L’objectif de ce cours est de permettre aux étudiants n’ayant peu ou pas de connaissance en statistique d’acquérir rapidement les bases de l’analyse statistique appliquée à la chimie et aux sciences du vivant. Les notions suivantes seront abordées :

• Fluctuations d'échantillonnage.
• Estimateurs usuels
• Intervalles de confiance.
• Principe des tests statistiques.
• Comparaison de moyennes.
• Régression linéaire.

Il se peut que les enseignants de l’UE estiment qu’un étudiant a le niveau suffisant pour ne pas avoir besoin de suivre l’UE. Dans ce cas précis, l’étudiant pourra être dispensé de cours mais devra mener à bien un projet d’analyse de donnée qui sera évalué par le rendu d’un rapport écrit en fin de semestre.

Voir la page complète

Course summary :

• Sampling: definition and environmental context, different types of samples, strategies, Quality control and errors, sampling techniques, sampling for analysis of various elements, stability and storage of the samples.

• Sample preparation: liquid samples (filtration, extraction), solid samples (grinding, sieving, freeze-drying, stabilization), solubilization of the sample (mineralization, extraction).
• On-site and basic analyses: Field measurements and analyses, Physical and physico-chemical measurements, Water inorganic composition, Overall organic pollution parameters, Nitrogen and phosphorus pollution.
• One-day field work.

_____________________________________________________________________________________

Sommaire du cours :

• Echantillonnage: définition et contexte environnemental, les différents types d’échantillons, les stratégies, la contrôle qualité et les erreurs, les techniques d’échantillonnage, échantillonnage pour analyse de divers éléments, stabilité et stockage des échantillons prélevés.
• Préparation des échantillons : échantillons liquides (filtration, extraction), échantillons solides (broyage, tamisage, lyophilisation, stabilisation), mise en solution de l’échantillon (minéralisation, extraction).
• Analyses sur site et analyses de base : Mesures et analyses de terrain, Mesures physiques et physico-chimiques, Les titres de l’eau, Les paramètres globaux de pollution organique, Pollutions azotée et phosphorée.
• Sortie terrain

Voir la page complète

Préparation à la certification en anglais, Test of English for International Communication (TOEIC).

Le TOEIC mesure les compétences de compréhension écrite et orale pour les niveaux débutant à avancé et détermine si une personne peut communiquer en anglais efficacement et avec aisance dans un contexte professionnel.

Voir la page complète

Voir la page complète

1-     Concepts introductifs

Notions de boucle microbienne, chaîne trophique, flux entre les compartiments, étapes clés d’un cycle biogéochimique

2-     Cycle du carbone

Présentation et illustration au travers d’exemples, cycle du carbone dans différents environnements

3-     Cycle de l’azote

         Assimilation et production des composés azotés, cycle dans écosystèmes naturels

4-     Cycle du soufre

         Production des sulfures et sulfates, cycle dans écosystèmes naturels

5-     Cycle des métaux

Cycle du fer et du manganèse

6-     Cycle du phosphore

Applications, exemple milieu marin

Les cours abordent les notions et concepts sur le rôle des microorganismes dans les cycles biogéochimiques.

Ces notions sont également abordées par l’étude de cas et analyses de publications, dont la préparation et le rendu oral seront l’objet du contrôle continu de l’UE. La réflexion autour des notions et concepts acquis, ainsi que l’esprit critique et de synthèse, seront évalués par un examen écrit.

Voir la page complète

Voir la page complète

Voir la page complète

• Méthodes, modèles et grandeurs des procédés séparatifs :

- Définition, principe, historique et domaine d’application

- Grandeurs (constantes d’équilibre, rétention, sélectivité, efficacité)

• Approche thermodynamique et cinétique des équilibres aux interfaces gaz/liquide/solide :

- Isothermes de sorption

- Thermodynamique des échanges

• Analyse de données obtenues par procédés séparatifs :

-Analyse qualitative

-Analyse quantitative

• La chromatographie en phase gazeuse :

- Appareillage (injecteur, four, détecteur…)

- Grandeurs spécifiques

- Type de chromatographie (colonne remplie ou capillaire, adsorption ou partage…)

- Domaine d’application

• La chromatographie en phase liquide :

- Appareillage (injecteur, four, détecteur…)

- Grandeurs spécifiques

- Type de chromatographie (Phase inverse, phase normale, Echange d’ions, Appariement d’ions, Chiralité, Affinité, Exclusion stérique…)

- Domaine d’application

• Methods, models and sizes of separation processes:

- Definition, principle, history and field of application

- Quantities (equilibrium constants, retention, selectivity, efficiency)

• Thermodynamic and kinetic approach to balances at gas/liquid/solid interfaces:

- Sorption isotherms

- Thermodynamics of exchanges

• Analysis of data obtained by separation processes:

-Qualitative analysis

-Quantitative analysis

• Gas phase chromatography:

- Equipment (injector, oven, detector, etc.)

- Specific quantities

- Type of chromatography (packed or capillary column, adsorption or partition, etc.)

- Application domain

• Liquid phase chromatography:

- Equipment (injector, oven, detector, etc.)

- Specific sizes

- Type of chromatography (reverse phase, normal phase, ion exchange, ion pairing, chirality, affinity, steric exclusion, etc.)

- Application domain

Voir la page complète

Voir la page complète

Voir la page complète

Voir la page complète

Voir la page complète

This course focuses on the study of the localization and speciation of chemical elements in environmental and biological samples using so-called direct techniques, i.e. which do not require chemical extraction step(s). It is thus possible to work directly on the solid phase. Part of the course is dedicated to techniques for obtaining localization information by chemical imaging (electron microscopies, X-ray microfluorescence...), and speciation by X-ray absorption spectroscopy (XANES, EXAFS) and X-ray diffraction. The other part of the course is dedicated to the conditions of sample preparation and analysis, which is a key factor in this approach. The course is accompanied by TD/TP. Concrete examples of the application of these techniques in the field of the environment illustrate the course.

Voir la page complète

• Introduction à la chimie environnementale des micropolluants organiques en milieu aquatique,
• Analyse des micropolluants organiques : prétraitement de l’échantillon et méthodes d’analyse,
• Etude de quelques familles de micropolluants : pesticides, HAP, organométalliques, détergents, perturbateurs endocriniens.

Voir la page complète

Travail pratique sur une étude de cas :

• Analyses microbiologiques d'un cours d'eau (transect amont-aval)
• Mise en place d’une colonne de Winogradsky, étude du fonctionnement de cette colonne. Impact d’une contamination organique.
• Rédaction d'un mémoire sur la base des résultats acquis

Voir la page complète

Voir la page complète

Voir la page complète

Préparation à la certification en anglais, Test of English for International Communication (TOEIC).

Le TOEIC mesure les compétences de compréhension écrite et orale pour les niveaux débutant à avancé et détermine si une personne peut communiquer en anglais efficacement et avec aisance dans un contexte professionnel.

Voir la page complète

• Définition d’un projet
• Composantes d’un projet
• Management de projet
• Logique de déroulement d’un projet

Voir la page complète

Voir la page complète

Voir la page complète

Voir la page complète

Voir la page complète

• Introduction sur l’unité de mesure, la masse monoisotopique, les abondances isotopiques et la résolution spectrale
• Définition de la spectrométrie de masse moléculaire

Schémas de principe (source d’ionisation, analyseur, détecteur) ; origine et spécificité du signal et présentation des particularités des spectres de masse moléculaires (caractérisation des profils isotopiques multi-élémentaires, espèces multichargées, ions fragments et adduits)

• Les sources d’ionisation

Description des différents types d’ionisation; applications et préparation adaptée de l’échantillon 

• Sélection et séparation des espèces ionisées : principe de fonctionnement des analyseurs.

Importance de la génération du vide ; principe, spécificité et avantages des différents types d’analyseur (quadripolaire, à trappe ionique, à temps de vol, à secteur magnétique et à transformée de Fourier)    

• Analyse structurale des espèces ionisées par l’étude de leur fragmentation

Techniques de fragmentation; Principe de fonctionnement de la spectrométrie de masse par tandem (MS/MS, MSn) et présentation des analyseurs hybrides (Q-TOF, IT-FTICR…).

• Introduction to the unit of measurement, monoisotopic mass, isotopic abundances and spectral resolution
• Definition of molecular mass spectrometry

Description (ionization source, analyzer, detector); origin and specificity of the signal and presentation of the peculiarities of molecular mass spectra (characterization of multi-element isotopic profiles, multi-charged species, fragment ions and adducts)

• Sources of ionization

Description of the different types of ionization; applications and appropriate sample preparation

• Selection and separation of ionized species: operating principle of analyzers.

Importance of vacuum generation; principle, specificity and advantages of the different types of analyzer (quadripole, ion trap, time of flight, magnetic sector and Fourier transform)

• Structural analysis of ionized species by studying their fragmentation

Fragmentation techniques; Operating principle of tandem mass spectrometry (MS/MS, MSn) and presentation of hybrid analyzers (Q-TOF, IT-FTICR, etc.).

Voir la page complète

Voir la page complète

Voir la page complète

Voir la page complète

Voir la page complète

Voir la page complète

Voir la page complète

Voir la page complète

Course summary :

Carbon accounting :

• Overview, global, energy and regulatory issues,
• Sources, emission factors and scope of accounting,
• Methodology and implementation,
• Feedback,
• Practical case: realization of the Bilan carbone® of a university.

LCA :

• Introduction : historical context, environmental issues,
• Principle, method, definition, conceptual and normative framework (ISO 14040 to 14044), tools, applications, limits.

__________________________________________________________________________

Sommaire du cours :

Comptabilité Carbone :

• Présentation générale, enjeux mondiaux, énergétiques, règlementaires.
• Sources, facteurs d’émission et périmètres de comptabilisation.
• Méthodologie et réalisation.
• Retours d’expériences.
• Cas pratique : réalisation du Bilan Carbone® d’une université.

ACV :

• Introduction : rappels historiques, enjeux environnementaux,
• Principe, méthode, définition, cadre conceptuel et normatif (les normes ISO 14040 à 14044), outils, applications, limites.
• Retours d’expériences.

Voir la page complète

• Introduction : rappels sur la répartition des formes de carbone inorganique dans les eaux, équilibres à considérer, définitions (eaux agressives, entartrantes, à l’équilibre), données nécessaires aux calculs, distinction éléments fondamentaux/caractéristiques,
• Méthodes graphiques : diagrammes de Tillmans-Guigues, Hallopeau-Dupin et, Legrand-Poirier.

Voir la page complète

• Les différents modes de corrosion en milieu humide,
• Conditions de protection,
• Prévision de la corrosion (diagramme E= pH, cinétique de corrosion).

Voir la page complète

Les polluants organiques de l’air (V. Desauziers 7.5h C, 7.5h TD)

1. Généralités : définitions, nature, sources des Composés organiques volatils (COV)
2. Les émissions de sources fixes : réglementation, mise en place d’un prélèvement, mesure des COV totaux, mesure des COV individuels (échantillonnage par adsorption et analyse chromatographique).

III. Air ambiant : réglementation, échantillonnages passif et actif.

1. Air des lieux de travail : adaptation des principes d’échantillonnage et d’analyse au cas particulier des ambiances de travail.
2. Air intérieur : contexte, démarche réglementaire, méthode d’analyse des polluants réglementés (dont l’analyse spécifique des aldéhydes), caractérisation des émissions de matériaux (essai d’émission en chambre environnementale).

Aérosol atmosphériques – Systèmes de mesures (V. Pont, 3h C, 3h TD)

I-Introduction

II-Définition de l’aérosol et domaines de dimension : Gamme de dimension, Gamme de concentration, densité volumique

III-Caractérisation granulométrique : Distribution log-normale: en nombre, masse, surface et volume, granulométrie liée au comportement: diamètre équivalent, diamètre de Stokes, diamètre aérodynamique

IV- Mécanismes élémentaires de transfert, propriétés et contraintes de la mesure : Diffusion brownienne, Inertie (Impaction, diffusion turbulente, centrifugation), Champ extérieur (sédimentation, électrophorèse, thermophorèse), Comportement caractéristique du domaine moléculaire au domaine continu

V- Systèmes de mesures des propriétés de l’aérosol atmosphérique : composition chimique (filtration, analytique, chimie en ligne (ACSM, SP2)), granulométrie (impacteurs, APS, OPS, SMPS), concentration en masse (pesée, TEOM), propriétés optiques (aethalomètre, néphélomètre, photomètre).

Voir la page complète

Voir la page complète

• La métrologie : définition, organisation
• Assurance qualité pour l’analyse : Principes généraux.
• Validation des méthodes analytiques au laboratoire: blancs, dopages, échantillons de contrôle qualité, étalons et  matériaux de référence
• Validation externe : Cartes de contrôle, essais interlaboratoires
• Accréditation

 ____________________________________________________________________

• Metrology : definition, organization
• General principles of quality assurance for analysis
• Laboratory validation of analytical techniques (blanks, spike, quality
• control samples, Reference materials and standards…)
• External validation: control charts, proficiency testing
• Accreditation

Plenary lectures and workgroup on publications illustrating the different items to prepare an oral presentation

Voir la page complète

Caractérisation et validation d'une méthode de mesure physico-chimique : Notions de contrôle statistique dans un laboratoire – Définitions normalisées- Evaluation des caractéristiques d'une méthode et/ ou d'un appareil de mesure. En cours/TD intégrés : présentation et illustration des notions fondamentales sur la base des normes ISO 31, 5725 et NF 90-210 utilisées dans les laboratoires accrédités; Mise en pratique au travers d’exemples et d’exercices pouvant utiliser des outils tels que EXCEL

--------------------------------------------------------------------------------------------
Characterisation and validation of a physico-chemical measurement method: Notions of statistical control in a laboratory - Standardised definitions - Evaluation of the characteristics of a method and/or a measuring device. In integrated courses/DD: presentation and illustration of the fundamental notions based on the ISO 31, 5725 and NF 90-210 standards used in accredited laboratories; Practical application through examples and exercises using tools such as EXCEL

Voir la page complète

Présentation du concept de cycles et des sources et puits de polluants, des cycles aquatiques et atmosphériques, des cycles continentaux et du transport colloïdal. Illustrations via des études de cas.

--------------------------------------------------------------------------------------------
Presentation of the concept of cycles and sources and sinks of pollutants, aquatic and atmospheric cycles, continental cycles and colloidal transport. Illustrations through case studies.

Voir la page complète

Présentation des concepts de spéciation et fractionnement, et des méthodes et techniques permettant d’aborder ces deux volets

--------------------------------------------------------------------------------------------
Presentation of the concepts of speciation and fractionation, and the methods and techniques for dealing with these two aspects

Voir la page complète

Voir la page complète

This course provides an overview of analytical techniques applied to the analysis of trace organic contaminants in environmental and/or food matrices, with an emphasis on families of current toxic contaminants.

It deals with methods of sample preparation and separation, and analysis of trace compounds (in particular methods based on mass spectrometry). One part is devoted to regulatory aspects related to the validation of quantitative multi-residue analysis methods. In a prospective way, a last part deals with the latest developments in the non-targeted analysis of trace compounds using high-resolution mass spectrometry methods.

In particular, students will be required to describe and evaluate the interest of scientific publications in the field of analysis of organic contaminants.

Voir la page complète

Introduction

                1/ Rappels des notions de base de l’électrochimie analytique (si nécessaire)

                2/ Principales méthodes d’électroanalyse

                3/ Microcapteurs, capteurs électrochimiques : Principe, conception et rôle dans la miniaturisation des analyses (microfluidique, lab-on-chip et µTAS). Applications à des analyses de cibles biologiques et aux mesures à l’échelle de la cellule

                4/ Capteurs/microcapteurs électrochimiques : Applications à la détection de polluants dans l’environnement et aux analyses sur site.

--------------------------------------------------------------------------------------------

Introduction

                1/ Summary of the basis of analytical electrochemistry (if necessary)

                2/ Description of common electroanalytical methods

                3/ Electrochemical sensors/microsensors: theoretical and experimental aspects, impact in the miniaturization of the analyzes (microfluidics, lab-on-chips and µTAS…). Application to biological targets and to the electrochemical monitoring at cell’s scale.

                4/ Electrochemical sensors/microsensors: application to the detection of pollutants in environmental samples, and to on-site analyzes.

Voir la page complète

Présentation des techniques spectrométriques (AAS, AFS, ICP-AES et ICP-MS et des techniques de couplage de ces détecteurs avec la chromatographie en phase liquide permettant les analyses de spéciation, ou par ablation laser pour l’analyse de solides

--------------------------------------------------------------------------------------------
Presentation of spectrometric techniques (AAS, AFS, ICP-AES and ICP-MS) and techniques for coupling these detectors with liquid chromatography for speciation analysis, or by laser ablation for solids analysis

Voir la page complète

During this teaching unit, the students will firstly follow a course on the characterization of complex matrices (in particular Bio-Oils or micro/nanoplastics) with a presentation of the advanced separation technqiues used for this type of analysis.

The techniques covered are: GC GC, Py GC, SFC, FFF, HPTLC,…

Following this introductory course, students will be involved in a group project (by group of two) with, if the techniques are available at IPREM lab, access to instruments in order to carry out an analysis program (choice of sample and its preparation, analysis program, etc.).

Voir la page complète

Voir la page complète

Introduction into proteomics and the related modern analytical methods (including proteomic mass spectrometry) for proteome analysis of biological organisms. Brief introduction into DNA sequencing, genomics and the related analytical methods. Hot topics will be integrated such as corona virus sequencing and Covid-19 tests.

The following topics are covered:

• Peptides and proteins; their structure and functions; post-translational modifications
• DNA sequencing and genomics
• The proteomic workflow
• Sample preparation (fractionation, centrifugation, extraction, interferences, denaturation, reduction, alkylation, enzymatic digestion etc.)
• Peptide and protein separation methods, gel electrophoresis
• Proteomic mass spectrometry (ESI and MALDI, high resolution mass analyzers, tandem mass spectrometry, collision induced fragmentation)
• Data treatment (fingerprint, peptide and protein sequencing, de novo sequencing)
• Data bases
• Bottom-up and top-down approaches
• Exercises: analyses of spectra, peptide sequencing

Analysis, presentation and discussion of scientific articles

Voir la page complète

1-En présentiel : management des processus

Cours

• Présentation d’une démarche de management qualité/environnementale (processus),
• Présentation simplifiée des référentiels associés,
• Présentation d’exemples illustratifs,
• Présentation d’outils d’analyse systémique, d’amélioration (audits, etc.)

TD

• TD par groupe : description complète d’une activité et de son pilotage, avec analyse des risques associés,
• Présentation aux autres groupes et discussion

2-En présentiel : analyse fonctionnelle et de la valeur

Cours

• Présentation d’une démarche d’analyse
• Présentation des référentiels associés,
• Présentation d’exemples illustratifs,

TD

• TD par groupe : mise en œuvre du processus d’analyse à travers un produit jusqu’aux solutions techniques de réponse aux fonctions identifiées,
• Présentation aux autres groupes et discussion

3-En présentiel, à chaque séance

• Questions / réponses par rapport au contenu des séances précédentes.

Voir la page complète

Sommaire du cours :

• Notions fondamentales en droit de l’environnement et ICPE
• Le management environnemental en entreprise : principes généraux, présentation et mise en œuvre de la norme ISO 14001
• Présentation des métiers HSE : prévention et surveillance de la pollution atmosphérique, protection des milieux aquatiques, les déchets, prévention et surveillance des nuisances sonores et des vibrations.

Voir la page complète

Cette unité enseignement est menée en étroite collaboration avec l’APESA, centre technologique au service de la transition écologique. Il est proposé aux étudiants, dans le cadre de ce module, de travailler en autonomie sur des sujets concrets de problématiques environnementales, un référent de l’APESA étant associé à chacun des sujets. Sur une période d’environ 3 mois (de mi-octobre à mi-janvier approximativement), les étudiants auront à :

• Rechercher les documents scientifiques sur la thématique traitée
• Rédiger un document technique de synthèse
• Restituer oralement le travail effectué

Voir la page complète

Lecture, résumé et commentaire de plusieurs types de documents scientifiques et techniques : publication, rapport, norme et mode d’emploi

--------------------------------------------------------------------------------------------
Reading, summarising and commenting on several types of scientific and technical documents: publications, reports, standards and instructions for use

Voir la page complète

Introduction into imaging techniques with a focus of those techniques and expertise, which are available at UPPA, presented by six experts working in UPPA labs. Applications from recent research projects will be discussed.

The following topics are covered:

• Light and electron microscopy
• Secondary ion mass spectrometry: ToF-SIMS and NanoSIMS
• X-ray techniques: X-ray tomography and Synchrotron radiation X-ray techniques
• Neutron tomography
• Laser Ablation with Inductively Coupled Plasma Mass Spectrometry (LA ICPMS)
• Principles and different modes of the techniques
• Challenges for sample preparation
• Data acquisition and data treatment

Visiting of the different imaging techniques and laboratories at UPPA.

Voir la page complète

• Elaboration d'un diaporama servant de support à une présentation scientifique. 
• Apprentissage de vocabulaire de spécialité. 
• Présentation orale de documents en rapport avec la spécialité 

Voir la page complète

Voir la page complète

Students will gain knowledge on environmental applications of microbial metabolism. It will be addressed by some examples of biodegradation and biotransformation of organic and metallic compounds, the application of the microbial metabolic capacities as an environmental tool, and bio-depollution and / or bioremediation tools. Students will design a project, based on a bibliographic study.

Voir la page complète

Voir la page complète

Une durée de 4 à 6 mois sera réalisé au deuxième semestre dans une entreprise ou un laboratoire dans les domaines de compétences dispensés dans la formation de master.

L'étudiant à travers cette expérience sera dans une situation équivalente à celle qu'il rencontrera après l'obtention du diplôme.

Voir la page complète

Practical work: the students have to define in group a protocol for the preparation of an environmental sample (soil or sediment or vegetal...) to then determine the concentrations of 3 metallic trace elements by 3 different elemental analysis techniques. The results are transmitted in the form of an analysis report on the basis of which a z-score is calculated. After returning this z-score to the students, they have to comment individually on the results of their own group and those of the other groups.

Voir la page complète

Voir la page complète

Voir la page complète

Voir la page complète

Le Risque Industriel : Prévention/Prévision des risques ; Protection ; Information et Formation. L’enseignement est découpé selon le plan suivant :

• Typologie du risque industriel et retour d’expérience des grands accidents industriels
• Modélisation des phénomènes accidentels (débit de fuite, dispersion, incendie explosion)
• Les méthodes d’analyse de risques
• Etude de cas
  • Détermination des termes sources
  • Calcul de conséquences
  • Détermination des zones de sécurité
• Plan d’Opération Interne (POI)

Voir la page complète

Sommaire du cours :

• Introduction au droit et au droit de l’environnement
• Les principes du droit de l’environnement et du développement durable
• Les installations classées pour la protection de l’environnement
• La gestion des risques

Voir la page complète

Voir la page complète

• La métrologie : définition, organisation
• Assurance qualité pour l’analyse : Principes généraux.
• Validation des méthodes analytiques au laboratoire: blancs, dopages, échantillons de contrôle qualité, étalons et  matériaux de référence
• Validation externe : Cartes de contrôle, essais interlaboratoires
• Accréditation

 ____________________________________________________________________

• Metrology : definition, organization
• General principles of quality assurance for analysis
• Laboratory validation of analytical techniques (blanks, spike, quality
• control samples, Reference materials and standards…)
• External validation: control charts, proficiency testing
• Accreditation

Plenary lectures and workgroup on publications illustrating the different items to prepare an oral presentation

Voir la page complète

• Elaboration d'un diaporama servant de support à une présentation scientifique. 
• Apprentissage de vocabulaire de spécialité. 
• Présentation orale de documents en rapport avec la spécialité 

Voir la page complète

Voir la page complète

This course provides an overview of analytical techniques applied to the analysis of trace organic contaminants in environmental and/or food matrices, with an emphasis on families of current toxic contaminants.

It deals with methods of sample preparation and separation, and analysis of trace compounds (in particular methods based on mass spectrometry). One part is devoted to regulatory aspects related to the validation of quantitative multi-residue analysis methods. In a prospective way, a last part deals with the latest developments in the non-targeted analysis of trace compounds using high-resolution mass spectrometry methods.

In particular, students will be required to describe and evaluate the interest of scientific publications in the field of analysis of organic contaminants.

Voir la page complète

Introduction

                1/ Rappels des notions de base de l’électrochimie analytique (si nécessaire)

                2/ Principales méthodes d’électroanalyse

                3/ Microcapteurs, capteurs électrochimiques : Principe, conception et rôle dans la miniaturisation des analyses (microfluidique, lab-on-chip et µTAS). Applications à des analyses de cibles biologiques et aux mesures à l’échelle de la cellule

                4/ Capteurs/microcapteurs électrochimiques : Applications à la détection de polluants dans l’environnement et aux analyses sur site.

--------------------------------------------------------------------------------------------

Introduction

                1/ Summary of the basis of analytical electrochemistry (if necessary)

                2/ Description of common electroanalytical methods

                3/ Electrochemical sensors/microsensors: theoretical and experimental aspects, impact in the miniaturization of the analyzes (microfluidics, lab-on-chips and µTAS…). Application to biological targets and to the electrochemical monitoring at cell’s scale.

                4/ Electrochemical sensors/microsensors: application to the detection of pollutants in environmental samples, and to on-site analyzes.

Voir la page complète

Présentation des techniques spectrométriques (AAS, AFS, ICP-AES et ICP-MS et des techniques de couplage de ces détecteurs avec la chromatographie en phase liquide permettant les analyses de spéciation, ou par ablation laser pour l’analyse de solides

--------------------------------------------------------------------------------------------
Presentation of spectrometric techniques (AAS, AFS, ICP-AES and ICP-MS) and techniques for coupling these detectors with liquid chromatography for speciation analysis, or by laser ablation for solids analysis

Voir la page complète

During this teaching unit, the students will firstly follow a course on the characterization of complex matrices (in particular Bio-Oils or micro/nanoplastics) with a presentation of the advanced separation technqiues used for this type of analysis.

The techniques covered are: GC GC, Py GC, SFC, FFF, HPTLC,…

Following this introductory course, students will be involved in a group project (by group of two) with, if the techniques are available at IPREM lab, access to instruments in order to carry out an analysis program (choice of sample and its preparation, analysis program, etc.).

Voir la page complète

Caractérisation et validation d'une méthode de mesure physico-chimique : Notions de contrôle statistique dans un laboratoire – Définitions normalisées- Evaluation des caractéristiques d'une méthode et/ ou d'un appareil de mesure. En cours/TD intégrés : présentation et illustration des notions fondamentales sur la base des normes ISO 31, 5725 et NF 90-210 utilisées dans les laboratoires accrédités; Mise en pratique au travers d’exemples et d’exercices pouvant utiliser des outils tels que EXCEL

--------------------------------------------------------------------------------------------
Characterisation and validation of a physico-chemical measurement method: Notions of statistical control in a laboratory - Standardised definitions - Evaluation of the characteristics of a method and/or a measuring device. In integrated courses/DD: presentation and illustration of the fundamental notions based on the ISO 31, 5725 and NF 90-210 standards used in accredited laboratories; Practical application through examples and exercises using tools such as EXCEL

Voir la page complète

Présentation du concept de cycles et des sources et puits de polluants, des cycles aquatiques et atmosphériques, des cycles continentaux et du transport colloïdal. Illustrations via des études de cas.

--------------------------------------------------------------------------------------------
Presentation of the concept of cycles and sources and sinks of pollutants, aquatic and atmospheric cycles, continental cycles and colloidal transport. Illustrations through case studies.

Voir la page complète

Présentation des concepts de spéciation et fractionnement, et des méthodes et techniques permettant d’aborder ces deux volets

--------------------------------------------------------------------------------------------
Presentation of the concepts of speciation and fractionation, and the methods and techniques for dealing with these two aspects

Voir la page complète

Voir la page complète

Lecture, résumé et commentaire de plusieurs types de documents scientifiques et techniques : publication, rapport, norme et mode d’emploi

--------------------------------------------------------------------------------------------
Reading, summarising and commenting on several types of scientific and technical documents: publications, reports, standards and instructions for use

Voir la page complète

1-En présentiel : management des processus

Cours

• Présentation d’une démarche de management qualité/environnementale (processus),
• Présentation simplifiée des référentiels associés,
• Présentation d’exemples illustratifs,
• Présentation d’outils d’analyse systémique, d’amélioration (audits, etc.)

TD

• TD par groupe : description complète d’une activité et de son pilotage, avec analyse des risques associés,
• Présentation aux autres groupes et discussion

2-En présentiel : analyse fonctionnelle et de la valeur

Cours

• Présentation d’une démarche d’analyse
• Présentation des référentiels associés,
• Présentation d’exemples illustratifs,

TD

• TD par groupe : mise en œuvre du processus d’analyse à travers un produit jusqu’aux solutions techniques de réponse aux fonctions identifiées,
• Présentation aux autres groupes et discussion

3-En présentiel, à chaque séance

• Questions / réponses par rapport au contenu des séances précédentes.

Voir la page complète

Sommaire du cours :

• Notions fondamentales en droit de l’environnement et ICPE
• Le management environnemental en entreprise : principes généraux, présentation et mise en œuvre de la norme ISO 14001
• Présentation des métiers HSE : prévention et surveillance de la pollution atmosphérique, protection des milieux aquatiques, les déchets, prévention et surveillance des nuisances sonores et des vibrations.

Voir la page complète

Introduction into imaging techniques with a focus of those techniques and expertise, which are available at UPPA, presented by six experts working in UPPA labs. Applications from recent research projects will be discussed.

The following topics are covered:

• Light and electron microscopy
• Secondary ion mass spectrometry: ToF-SIMS and NanoSIMS
• X-ray techniques: X-ray tomography and Synchrotron radiation X-ray techniques
• Neutron tomography
• Laser Ablation with Inductively Coupled Plasma Mass Spectrometry (LA ICPMS)
• Principles and different modes of the techniques
• Challenges for sample preparation
• Data acquisition and data treatment

Visiting of the different imaging techniques and laboratories at UPPA.

Voir la page complète

Students will gain knowledge on environmental applications of microbial metabolism. It will be addressed by some examples of biodegradation and biotransformation of organic and metallic compounds, the application of the microbial metabolic capacities as an environmental tool, and bio-depollution and / or bioremediation tools. Students will design a project, based on a bibliographic study.

Voir la page complète

Après avoir suivi l’UE obligatoire « quality assurance for analysis », les étudiants en alternance doivent collecter différentes informations sur le système d’assurance qualité pour l’analyse mis en œuvre au sein du laboratoire dans lequel ils effectuent leur alternance puis le présenter sous forme d’un rapport écrit dont l’organisation est discutée et décidée en concertation avec l’enseignante du module selon le type de système et les informations collectées au sein de l’entreprise

Voir la page complète

Introduction into proteomics and the related modern analytical methods (including proteomic mass spectrometry) for proteome analysis of biological organisms. Brief introduction into DNA sequencing, genomics and the related analytical methods. Hot topics will be integrated such as corona virus sequencing and Covid-19 tests.

The following topics are covered:

• Peptides and proteins; their structure and functions; post-translational modifications
• DNA sequencing and genomics
• The proteomic workflow
• Sample preparation (fractionation, centrifugation, extraction, interferences, denaturation, reduction, alkylation, enzymatic digestion etc.)
• Peptide and protein separation methods, gel electrophoresis
• Proteomic mass spectrometry (ESI and MALDI, high resolution mass analyzers, tandem mass spectrometry, collision induced fragmentation)
• Data treatment (fingerprint, peptide and protein sequencing, de novo sequencing)
• Data bases
• Bottom-up and top-down approaches
• Exercises: analyses of spectra, peptide sequencing

Analysis, presentation and discussion of scientific articles

Voir la page complète

Voir la page complète

Formation en entreprise à 100%

Stage en alternance dans une entreprise ou un laboratoire dans les domaines de compétences dispensés dans la formation de master. L'étudiant à travers cette expérience sera dans une situation équivalente à celle qu'il rencontrera après l'obtention du diplôme.

Voir la page complète

Practical work: the students have to define in group a protocol for the preparation of an environmental sample (soil or sediment or vegetal...) to then determine the concentrations of 3 metallic trace elements by 3 different elemental analysis techniques. The results are transmitted in the form of an analysis report on the basis of which a z-score is calculated. After returning this z-score to the students, they have to comment individually on the results of their own group and those of the other groups.

Voir la page complète

Voir la page complète

Sommaire du cours :

• Introduction au droit et au droit de l’environnement
• Les principes du droit de l’environnement et du développement durable
• Les installations classées pour la protection de l’environnement
• La gestion des risques

Voir la page complète

Le Risque Industriel : Prévention/Prévision des risques ; Protection ; Information et Formation. L’enseignement est découpé selon le plan suivant :

• Typologie du risque industriel et retour d’expérience des grands accidents industriels
• Modélisation des phénomènes accidentels (débit de fuite, dispersion, incendie explosion)
• Les méthodes d’analyse de risques
• Etude de cas
  • Détermination des termes sources
  • Calcul de conséquences
  • Détermination des zones de sécurité
• Plan d’Opération Interne (POI)

Voir la page complète

Travaux expérimentaux encadrés (4 semaines consécutives ou fractionnées) au laboratoire de chimie analytique de l’UPPA sur un sujet proposé par un membre de l’équipe pédagogique ou en lien avec le sujet de stage de l’alternant et co-défini avec le tuteur en entreprise.

Voir la page complète