Analyse de données écologiques complexes

Analyse de données écologiques complexes

  • ECTS

    2 crédits

  • Volume horaire

    18h

Description

Les cours permettront de vous familiariser avec la visualisation et le traitement des données spatio-temporelles en écologie. Au-delà de certaines approches spécifiques, le cours met l'accent sur des méthodes analytiques générales pouvant également servir hors cadre spatio-temporel. Certaines méthodologies seront également succinctement introduites afin d'élargir votre boite à outils analytique. Toutes les notions abordées seront constamment appliquées à l'aide de données biologiques/environnementales réelles en salle informatique (temps limité) ou dans le cadre de travaux personnels (temps plus long). 

Le cours porte sur les notions suivantes : 

 

Approche générale & Data Mining 

 

 

Linear (Mixed) Models 

Generalized Linear (Mixed) Models 

Generalized Additive(Mixed) Models 

 

 

 

 

 

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Objectifs

À la fin de cette UE/EC, vous serez capable de :  

  • Manipuler et visualiser des données spatio-temporelles. 
  • Identifier les principales approches statistiques spatio-temporelles et choisir la plus appropriée. 
  • Appliquer et interpréter les résultats associés. 
  • Réaliser tout cela à l'aide du logiciel R. 
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Pré-requis obligatoires

Analyses univariées et multivariées (M1) 

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Contrôle des connaissances

Session 1 : 100% contrôle continu

Session 2 : 100% oral

Type d'évaluations : Le contrôle continu se base sur l'analyse de données biologiques /environnementales dans le cadre de travaux personnels à la maison (travail en groupe possible). 

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Bibliographie

  • Generalized additive models : an introduction with R (2017) Simon N. Wood. Chapman & Hall/CRC (ISBN : 978-1-4987-2833-1). 
  • Extending the linear model with R : generalized linear, mixed effects and nonparametric regression models (2006) Julian J. Faraway. Chapman and Hall/CRC (ISBN : 978-1-58488-424-8). 
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Compétences acquises

Compétences

Niveau d'acquisition

Usages avancés et spécialisés des outils numériquesRecueillir données dans des bases de données appropriéesx
Traiter des données dans des logiciels génériques (R) et spécifiquesx
Exploiter des données dans un système d'information géographiquex
Développement et intégration de savoirs hautement spécialisésDéfinir une stratégie de collecte et d'analyse des données environnementalesx
Communication spécialisée pour le transfert de connaissancesSélectionner et analyser des ressources spécialisées de manière synthétique et critiquex
Communiquer autour de connaissances scientifiques avec des publics variés, à l'oral et l'écrit, en Français et en Anglaisx