• La métrologie : définition, organisation
• Assurance qualité pour l’analyse : Principes généraux.
• Validation des méthodes analytiques au laboratoire: blancs, dopages, échantillons de contrôle qualité, étalons et  matériaux de référence
• Validation externe : Cartes de contrôle, essais interlaboratoires
• Accréditation

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• Metrology : definition, organization
• General principles of quality assurance for analysis
• Laboratory validation of analytical techniques (blanks, spike, quality
• control samples, Reference materials and standards…)
• External validation: control charts, proficiency testing
• Accreditation

Plenary lectures and workgroup on publications illustrating the different items to prepare an oral presentation

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Caractérisation et validation d'une méthode de mesure physico-chimique : Notions de contrôle statistique dans un laboratoire – Définitions normalisées- Evaluation des caractéristiques d'une méthode et/ ou d'un appareil de mesure. En cours/TD intégrés : présentation et illustration des notions fondamentales sur la base des normes ISO 31, 5725 et NF 90-210 utilisées dans les laboratoires accrédités; Mise en pratique au travers d’exemples et d’exercices pouvant utiliser des outils tels que EXCEL

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Characterisation and validation of a physico-chemical measurement method: Notions of statistical control in a laboratory - Standardised definitions - Evaluation of the characteristics of a method and/or a measuring device. In integrated courses/DD: presentation and illustration of the fundamental notions based on the ISO 31, 5725 and NF 90-210 standards used in accredited laboratories; Practical application through examples and exercises using tools such as EXCEL

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Présentation du concept de cycles et des sources et puits de polluants, des cycles aquatiques et atmosphériques, des cycles continentaux et du transport colloïdal. Illustrations via des études de cas.

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Presentation of the concept of cycles and sources and sinks of pollutants, aquatic and atmospheric cycles, continental cycles and colloidal transport. Illustrations through case studies.

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Présentation des concepts de spéciation et fractionnement, et des méthodes et techniques permettant d’aborder ces deux volets

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Presentation of the concepts of speciation and fractionation, and the methods and techniques for dealing with these two aspects

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This course provides an overview of analytical techniques applied to the analysis of trace organic contaminants in environmental and/or food matrices, with an emphasis on families of current toxic contaminants.

It deals with methods of sample preparation and separation, and analysis of trace compounds (in particular methods based on mass spectrometry). One part is devoted to regulatory aspects related to the validation of quantitative multi-residue analysis methods. In a prospective way, a last part deals with the latest developments in the non-targeted analysis of trace compounds using high-resolution mass spectrometry methods.

In particular, students will be required to describe and evaluate the interest of scientific publications in the field of analysis of organic contaminants.

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Introduction

                1/ Rappels des notions de base de l’électrochimie analytique (si nécessaire)

                2/ Principales méthodes d’électroanalyse

                3/ Microcapteurs, capteurs électrochimiques : Principe, conception et rôle dans la miniaturisation des analyses (microfluidique, lab-on-chip et µTAS). Applications à des analyses de cibles biologiques et aux mesures à l’échelle de la cellule

                4/ Capteurs/microcapteurs électrochimiques : Applications à la détection de polluants dans l’environnement et aux analyses sur site.

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Introduction

                1/ Summary of the basis of analytical electrochemistry (if necessary)

                2/ Description of common electroanalytical methods

                3/ Electrochemical sensors/microsensors: theoretical and experimental aspects, impact in the miniaturization of the analyzes (microfluidics, lab-on-chips and µTAS…). Application to biological targets and to the electrochemical monitoring at cell’s scale.

                4/ Electrochemical sensors/microsensors: application to the detection of pollutants in environmental samples, and to on-site analyzes.

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Présentation des techniques spectrométriques (AAS, AFS, ICP-AES et ICP-MS et des techniques de couplage de ces détecteurs avec la chromatographie en phase liquide permettant les analyses de spéciation, ou par ablation laser pour l’analyse de solides

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Presentation of spectrometric techniques (AAS, AFS, ICP-AES and ICP-MS) and techniques for coupling these detectors with liquid chromatography for speciation analysis, or by laser ablation for solids analysis

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During this teaching unit, the students will firstly follow a course on the characterization of complex matrices (in particular Bio-Oils or micro/nanoplastics) with a presentation of the advanced separation technqiues used for this type of analysis.

The techniques covered are: GC GC, Py GC, SFC, FFF, HPTLC,…

Following this introductory course, students will be involved in a group project (by group of two) with, if the techniques are available at IPREM lab, access to instruments in order to carry out an analysis program (choice of sample and its preparation, analysis program, etc.).

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Introduction into proteomics and the related modern analytical methods (including proteomic mass spectrometry) for proteome analysis of biological organisms. Brief introduction into DNA sequencing, genomics and the related analytical methods. Hot topics will be integrated such as corona virus sequencing and Covid-19 tests.

The following topics are covered:

• Peptides and proteins; their structure and functions; post-translational modifications
• DNA sequencing and genomics
• The proteomic workflow
• Sample preparation (fractionation, centrifugation, extraction, interferences, denaturation, reduction, alkylation, enzymatic digestion etc.)
• Peptide and protein separation methods, gel electrophoresis
• Proteomic mass spectrometry (ESI and MALDI, high resolution mass analyzers, tandem mass spectrometry, collision induced fragmentation)
• Data treatment (fingerprint, peptide and protein sequencing, de novo sequencing)
• Data bases
• Bottom-up and top-down approaches
• Exercises: analyses of spectra, peptide sequencing

Analysis, presentation and discussion of scientific articles

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1-En présentiel : management des processus

Cours

• Présentation d’une démarche de management qualité/environnementale (processus),
• Présentation simplifiée des référentiels associés,
• Présentation d’exemples illustratifs,
• Présentation d’outils d’analyse systémique, d’amélioration (audits, etc.)

TD

• TD par groupe : description complète d’une activité et de son pilotage, avec analyse des risques associés,
• Présentation aux autres groupes et discussion

2-En présentiel : analyse fonctionnelle et de la valeur

Cours

• Présentation d’une démarche d’analyse
• Présentation des référentiels associés,
• Présentation d’exemples illustratifs,

TD

• TD par groupe : mise en œuvre du processus d’analyse à travers un produit jusqu’aux solutions techniques de réponse aux fonctions identifiées,
• Présentation aux autres groupes et discussion

3-En présentiel, à chaque séance

• Questions / réponses par rapport au contenu des séances précédentes.

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Sommaire du cours :

• Notions fondamentales en droit de l’environnement et ICPE
• Le management environnemental en entreprise : principes généraux, présentation et mise en œuvre de la norme ISO 14001
• Présentation des métiers HSE : prévention et surveillance de la pollution atmosphérique, protection des milieux aquatiques, les déchets, prévention et surveillance des nuisances sonores et des vibrations.

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Cette unité enseignement est menée en étroite collaboration avec l’APESA, centre technologique au service de la transition écologique. Il est proposé aux étudiants, dans le cadre de ce module, de travailler en autonomie sur des sujets concrets de problématiques environnementales, un référent de l’APESA étant associé à chacun des sujets. Sur une période d’environ 3 mois (de mi-octobre à mi-janvier approximativement), les étudiants auront à :

• Rechercher les documents scientifiques sur la thématique traitée
• Rédiger un document technique de synthèse
• Restituer oralement le travail effectué

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Lecture, résumé et commentaire de plusieurs types de documents scientifiques et techniques : publication, rapport, norme et mode d’emploi

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Reading, summarising and commenting on several types of scientific and technical documents: publications, reports, standards and instructions for use

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Introduction into imaging techniques with a focus of those techniques and expertise, which are available at UPPA, presented by six experts working in UPPA labs. Applications from recent research projects will be discussed.

The following topics are covered:

• Light and electron microscopy
• Secondary ion mass spectrometry: ToF-SIMS and NanoSIMS
• X-ray techniques: X-ray tomography and Synchrotron radiation X-ray techniques
• Neutron tomography
• Laser Ablation with Inductively Coupled Plasma Mass Spectrometry (LA ICPMS)
• Principles and different modes of the techniques
• Challenges for sample preparation
• Data acquisition and data treatment

Visiting of the different imaging techniques and laboratories at UPPA.

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• Elaboration d'un diaporama servant de support à une présentation scientifique. 
• Apprentissage de vocabulaire de spécialité. 
• Présentation orale de documents en rapport avec la spécialité 

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Students will gain knowledge on environmental applications of microbial metabolism. It will be addressed by some examples of biodegradation and biotransformation of organic and metallic compounds, the application of the microbial metabolic capacities as an environmental tool, and bio-depollution and / or bioremediation tools. Students will design a project, based on a bibliographic study.

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