Description du cours et modalités pédagogiques : 

A travers des exemples concrets, apprentissage théorique et pratique des techniques de Biologie Moléculaire couramment utilisées dans un laboratoire.  

Le cours se compose des 5 Chapitres suivants : 

I. Rappels sur la composition et la structure des acides nucléiques 
II. Techniques de base de Biologie Moléculaire
III. Techniques d’amplification par PCR
IV. Techniques de clonage
V. Techniques de séquençage 

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Description du cours et modalités pédagogiques : 

Cette UE est une initiation à la virologie. Les virus sont le plus souvent associés à des maladies qu’elles soient humaines, animales ou végétales. Cet aspect sera abordé, ainsi que les méthodes permettant d’étudier les virus et leur classification. De plus, l’importance des virus dans le fonctionnement des écosystèmes et l’évolution des êtres vivants sera également étudiée au travers de différents exemples. Afin de compléter le cours, les étudiants travailleront sur une publication de recherche en virologie qui sera présentée au reste de la promotion. 

Plan du cours : 

1- Historique et définition des virus 

2- Structure des virus 

3- Classification des virus 

4- Cycles de multiplication des virus 

5- Méthodes d’étude des virus 

6- Interactions virus-virus et virus-hôte 

7- Un modèle d’étude : le bactériophage 

8- Défense contre les virus 

9- Les provirus et les prophages 

10- Les virus et le Cancer 

11- Interactions virus-organismes 

12- Les prions 

13- Les virus végétaux et les viroïdes 

14- La grippe 

15- VIH-1 

16- Covid19 

16- Virus et environnement 

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L’UE de génétique bactérienne présente les grands principes des bases moléculaires et génétiques permettant l'étude des mécanismes moléculaires chez les bactéries. Les différents types de mutations et les facteurs qui conduisent à leur apparition chez ces microorganismes ainsi que les différents mécanismes de recombinaison et transferts génétiques seront adressés. Quelques exemples des applications de la génétique bactérienne seront également présentés avec des exemples d’utilisation des différents mécanismes moléculaires vus tout au long du cours.

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Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce cinquième semestre l’accent sera mis sur une introduction à la préparation à la certification en anglais, Test of English for International Communication (TOEIC).

Le TOEIC mesure les compétences de compréhension écrite et orale pour les niveaux débutant à avancé et détermine si une personne peut communiquer en anglais efficacement et avec aisance dans un contexte professionnel.

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Plus d'informations à la page suivante : https://formation.univ-pau.fr/fr/scolarite/ue-transverses.html

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Description du cours et modalités pédagogiques : 

Il s'agit ici de construire un projet de poursuite d’études ou professionnel, de définir votre plan d'action puis le mettre en œuvre en préparant vos candidatures. 

A cet effet, le parcours en ligne PEP'S 3 est composé des trois étapes proposant chacune des pistes audio, des diaporamas ou des infographies et des activités.  

Plan (simplifié) du cours :  

• Introduction  

• Avant de commencer : retour sur l’UE PEP’S 2 : Projet d’études et professionnel dans le supérieur en deuxième année de licence 
• Connaitre ses atouts et ses compétences 
• Explorer les possibles 
• Plan d’action : candidater 
• Que faire en cas de refus : propose des informations concernant la procédure à suivre en cas de refus d'admission en master. 

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Description du cours et modalités pédagogiques : 

Cette UE permet de compléter l’étude des grandes fonctions biologiques commencée avec l’UE physiologie animale 1. La fonction de nutrition au sens large et les échanges entre l’organisme et son environnement seront au cœur de cette UE (Prise alimentaire et digestion, respiration, Excrétion, osmorégulation, thermorégulation). L’objectif de cette UE de fin de licence est de donnée une compréhension de l’organisme dans sa globalité en appréhendant notamment l’interaction entre les systèmes. Ces interactions et le système endocrine sont abordés en conclusion. 

I- Prise alimentaire et digestion 

II- La respiration 

III- Excrétion 

IV- Thermorégulation 

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Description du cours et modalités pédagogiques : 

Ce cours présente les différentes étapes du développement des plantes à fleurs, de la plantule à la plante sénescente. L’influence des facteurs environnementaux et hormonaux contrôlant la croissance et la reproduction des végétaux supérieurs sera étudiée en insistant sur les processus cellulaires et moléculaires impliqués. 

Les techniques de biotechnologie végétale (culture in vitro et utilisation des phytohormones, génie génétique, transgenèse) utilisées en amélioration des plantes sont également abordées. 

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L'UE Roches endogènes 1 poursuit les objectifs de l’UE Roches et Chronologie de première année. Elle pose les principes de la reconnaissance au microscope des principaux minéraux silicatés afin de caractériser les roches magmatiques et métamorphiques.

Le cours aborde les notions indispensables sur la composition des silicates, sur leur organisation structurale et les propriétés physiques qui en résultent. Il traite aussi d’optique cristalline pour ce qu’elle va permettre d’identifier les minéraux au microscope. Le cours se termine sur la gitologie des roches magmatiques.

Les 5 séances de TP sont consacrées à l'identification des minéraux silicatés classiques des roches endogènes (minéraux ferro-magnésiens, quartz, feldspaths et feldspathoïdes, calcite). Ils abordent (1) les principes de la reconnaissance des minéraux au microscope, l’identification (2) des roches plutoniques, (3) volcaniques et (4) métamorphiques. La dernière séance est dédiée à l’examen.

Cette approche est réalisée conjointement au travail sur le terrain à Héas pour les biologistes et au Pic du Midi d’Ossau pour les géologues.

Contenu de l’enseignement :

• Cours magistral sur la structure des silicates et leur propriétés cristallines, sur l’optique cristalline et sur la gitologie des roches magmatiques (C : 13h30)
• Séance de révision des roches endogènes vues en Roches et Chronologie en S1 (TP : 1h30)
• TP de microscopie (15h)
• Étude de cas : le magmatisme d’Héas et le volcanisme d’Ossau (TP terrain : 6h, 1 jour)

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Cette unité d’enseignement vise à donner à l’étudiant les grandes lignes de la structuration d’une marge et d’une chaine de montagne.

On présente les grandes étapes du cycle de Wilson, les éléments géométriques des différentes marges et des chaines de montagne.

L’application de toutes ses connaissances sera faite en s’appuyant sur l’orogène pyrénéen où toutes les phases du Cycle de Wilson sont présentes, et où, de surcroit, la marge initiale présente une géométrie originale avec des éléments du manteau incorporés.

Une série de TP est prévue avec des constructions de coupes géologiques dans les Pyrénées pour approfondir des éléments géométriques vus en cours. Une journée de terrain complète les observations.

Contenu du cours :

• Le cycle de WILSON ; du rift à l’accrétion.
• Les marges océaniques classiques et volcaniques.
• Les chaines de montagnes.
• Cas d’application ; les Pyrénées. D’une marge hyper étirée à la collision.
• Cartographie – travaux pratiques. Une journée de terrain illustrant les concepts vus en cours.

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Description du cours et modalités pédagogiques : 

Présenter la problématique des tests statistiques à partir d'exemples simples tirés de la biologie (tests d'ajustements, comparaison de moyennes et de fréquences) et leur mise en oeuvre avec le logiciel R. Les notions suivantes seront abordées : 

• Fluctuations d'échantillonnage. 
• Intervalles de confiance. 
• Principe des tests statistiques. 

• Tests d'ajustements à des lois de distribution. 
• Lien entre variables (Chi2 et corrélation) 
• Comparaison de moyennes. 
• Comparaison de variances. 
• Régression linéaire. 

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