ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Description
Cette unité complète les connaissances acquises en biologie moléculaire en permettant d’explorer et d’utiliser les séquences présentes dans les nombreuses bases de données.
Plusieurs outils de bioinformatique seront utilisés pour analyser ces données, notamment par l’identification de gènes, de mutations, de domaines ou motifs, pouvant permettre de proposer des fonctions aux protéines et des phénotypes aux organismes étudiés.
Le cours se compose des 4 chapitres suivants :
I- Introduction de la Bioinformatique,
II- Les Bases de Données,
III- Les Formats,
IV- L’Alignement de Séquences.
Objectifs
À la fin de cette UE, vous serez capable de :
- Rechercher et récupérer de l’information dans les bases de données,
- Convertir les données dans le format approprié,
- Faire des alignements et comparaisons de séquences,
- Déterminer et Identifier des motifs ou domaines conservés,
- Prédire à partir de séquences des fonctions ou phénotypes attendus,
- Choisir les logiciels et la démarche appropriée pour répondre à une problématique donnée.
Heures d'enseignement
- CMCours Magistral4,5h
- TPTravaux Pratique15h
Pré-requis obligatoires
Connaissances solides en Biologie Moléculaire, avoir suivi les modules de Biologie Moléculaire (S3) et de Biologie Moléculaire Pratique (S5)
Contrôle des connaissances
100% Contrôle Continu
L’évaluation se fait en contrôle continu intégral. Elle comprend des évaluations courtes durant les TP qui peuvent être des questions de cours ou des exercices notés et une épreuve sur ordinateur d’une durée de 1,5h à 2h sous forme d’un problème à résoudre nécessitant l’utilisation des logiciels vus en cours et en TP.
Compétences acquises
Compétences | Niveau d'acquisition | |
---|---|---|
Analyser en se reposant sur un socle de connaissances scientifiques | Relier un phénomène macroscopique aux processus microscopiques | x |
Développer un esprit critique sur des données expérimentales | x | |
Elaborer une démarche scientifique | Modéliser un phénomène biologique | x |
Concevoir et mettre en œuvre une démarche scientifique | x | |
Communiquer et collaborer | Maîtrise des outils numériques | x |