Outils Bioinformatiques

Outils Bioinformatiques

  • ECTS

    2 crédits

  • Composante

    Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)

  • Volume horaire

    19,5h

Description

Cette unité complète les connaissances acquises en biologie moléculaire en permettant d’explorer et d’utiliser les séquences présentes dans les nombreuses bases de données.

Plusieurs outils de bioinformatique seront utilisés pour analyser ces données, notamment par l’identification de gènes, de mutations, de domaines ou motifs, pouvant permettre de proposer des fonctions aux protéines et des phénotypes aux organismes étudiés.

Le cours se compose des 4 chapitres suivants :

 

I-            Introduction de la Bioinformatique,

II-           Les Bases de Données,

III-          Les Formats,

IV-         L’Alignement de Séquences.

Lire moins

Objectifs

À la fin de cette UE, vous serez capable de :

  • Rechercher et récupérer de l’information dans les bases de données,
  • Convertir les données dans le format approprié,
  • Faire des alignements et comparaisons de séquences,
  • Déterminer et Identifier des motifs ou domaines conservés,
  • Prédire à partir de séquences des fonctions ou phénotypes attendus,
  • Choisir les logiciels et la démarche appropriée pour répondre à une problématique donnée.
Lire moins

Heures d'enseignement

  • CMCours Magistral4,5h
  • TPTravaux Pratique15h

Pré-requis obligatoires

Connaissances solides en Biologie Moléculaire, avoir suivi les modules de Biologie Moléculaire (S3) et de Biologie Moléculaire Pratique (S5)

Lire moins

Contrôle des connaissances

100% Contrôle Continu

L’évaluation se fait en contrôle continu intégral. Elle comprend des évaluations courtes durant les TP qui peuvent être des questions de cours ou des exercices notés et une épreuve sur ordinateur d’une durée de 1,5h à 2h sous forme d’un problème à résoudre nécessitant l’utilisation des logiciels vus en cours et en TP. 

Lire moins

Compétences acquises

Compétences

Niveau d'acquisition

Analyser en se reposant sur un socle de connaissances scientifiquesRelier un phénomène macroscopique aux processus microscopiquesx
Développer un esprit critique sur des données expérimentalesx
Elaborer une démarche scientifiqueModéliser un phénomène biologiquex
Concevoir et mettre en œuvre une démarche scientifique x
Communiquer et collaborerMaîtrise des outils numériquesx