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Licence Sciences de la Vie
Niveau d'étude visé
BAC +3
ECTS
180 crédits
Durée
2 ans
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Présentation
Promotion L1 2022/2023
Campus d'Anglet : 106 étudiants inscrits
Campus de Pau : 193 étudiants inscrits
Objectifs
Cette licence vise à assurer une formation de base dans les différents domaines de la biologie, en mettant l’accent sur les concepts et les développements méthodologiques les plus récents. Elle étudie l'ensemble des organismes vivants (êtres humains, animaux, végétaux, levures) dans des enseignements de biologie animale et végétale, biologie cellulaire et moléculaire, biologie génétique, physiologie végétale et animale, immunologie, écologie, biologie structurale et biochimie. Elle s’appuie aussi sur d’autres disciplines scientifiques.
Pour réussir dans cette licence, il faut être à l’aise dans l’ensemble des disciplines scientifiques et avoir des compétences rédactionnelles.
Compétences
Analyser en se reposant sur un socle de connaissances scientifiques
Elaborer une démarche scientifique
Communiquer et collaborer
Travailler dans le cadre des projets pluridisciplinaires, de recherche, d'innovation et internationaux
Communiquer en contexte professionnel
Appui à la transformation en contexte professionnel
Construire son projet
S’exprimer et communiquer à l’oral, à l’écrit, et dans au moins une langue étrangère
Maîtriser les disciplines scientifiques et les concepts fondamentaux des Géosciences
Analyser, interpréter et synthétiser des données en géosciences
Positionnement vis à vis d’un champ professionnel
Maîtriser une Langue Vivante
Se positionner vis à vis d’un champ professionnel
Tableau des compétences
| Semestre | Semestre 1 | Semestre 2 | Semestre 3 | Semestre 4 | Semestre 5 | Semestre 6 | Semestre 1 | Semestre 2 | Semestre 3 | Semestre 4 | Semestre 5 | Semestre 6 | Semestre 1 | Semestre 2 | Semestre 3 | Semestre 4 | Semestre 5 | Semestre 6 | Semestre 1 | Semestre 2 | Semestre 3 | Semestre 4 | Semestre 5 | Semestre 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Unité d'Enseignement | Ecologie, Evolution, Environnement | Biologie Cellulaire 1 | Probabilités Statistiques | Physique-Chimie pour la Biologie 1 | Introduction aux Géosciences | Anglais L1 - S1 | Méthodologie du travail universitaire | Embryologie | Mathématiques pour Sciences de la Vie | Histoire des Sciences | Chimie Organique (avancé) | Informatique et certification PIX | Animation Scientifique | Biologie Animale | Biologie Végétale | Biostatistiques | Physique Chimie pour la Biologie 2 | PEP'S 1 | Anglais L1 - S2 | Mathématiques 2 | Parasitologie | Anatomie Comparée | Sols et Paysages | TP Chimie | Enseignement Scientifique en école | Chimie des solutions (avancée) | UE Transverse | Physiologie Animale | Biochimie | Écologie des Populations | Biologie Moléculaire | Biostatistiques 2 | Anglais L2 - S3 | Hydrologie | Sols et Agronomie | Perception Sensorielle | Chimie des solutions 2 | Informatique et certification PIX | Stage | Ethologie 1 | Stratégies de Reproduction | UE Transverse | Génétique | Microbiologie | Physiologie Végétale | Biologie Cellulaire 2 | Traitements statistiques des données 1 | PEP'S 2 | Anglais L2 - S4 | Ecologie Appliquée | Biologie de la Conservation | Immunology | Sciences Environnementales | Chimie organique 2 | Enseignement Scientifique en école | Stage | Ethologie 2 | UET Changements Globaux | Physiologie animale 2 | Diversité génétique | Génétique moléculaire | Structure et fonctionnement des écosystèmes | Systèmes évolution des végétaux | Biostatistique 3 | Anglais L3 - S5 | UE Transverse | Biologie Evolutive 2 | Biologie Expérimentale | Génétique des Populations | Travaux de recherche encadrés | Traitement statistiques des données 2 | PEP'S 3 | Stage | Perception Sensorielle en milieu aquatique | Virologie | Anglais L1 - S1 | Évolution et Diversité | Biologie cellulaire | Macromolécules | Chimie organique et des solutions pour SDV | Mathématiques générales | Méthodologie du travail universitaire | PIX | Roches et Chronologie | Introduction à la physique générale pour SDV | Introduction à la chimie générale pour SDV | Écologie et Écosystèmes | Biologie végétale 1 | Biologie animale 1 | Microbiologie 1 | Anglais L1 - S2 | UE Transverse | PEP'S 1 | UE CMI Théâtre 1 : prendre la parole en public | Expression écrite et orale 1 | Structures géologiques | Chimie organique et solutions 2 | Anglais L2 - S3 | Biologie moléculaire | Biochimie générale | Biologie végétale 2 | Biologie cellulaire | Anatomie Comparée et Développement de Vertébrés | Outils pour la modélisation en biologie 1 | Expression écrite et oral | PEP'S 2 | UET Changements Globaux | Physique du globe 1 | Chimie des solutions 3 | Anglais L2 - S4 | Génétique | Microbiologie 2 | Physiologie végétale 1 : Nutrition et métabolisme | Physiologie animale 1 | Outils pour la modélisation en biologie 2 | UE Transverse | Milieux sédimentaires 1 | Chimie organique fonctionnelle, mécanisme réactionnel | UE CMI : Préparation à l'international | Biologie moléculaire pratique | Virologie | Génétique bactérienne | Anglais L3 - S5 | UE Transverse | PEP'S 3 | Physiologie animale 2 | Physiologie végétale 2 : Croissance et Développement | Roches endogènes 1 | Marges et Chaines de montagnes | Outils pour la modélisation en biologie 3 | Biologie moléculaire 3 | Immunologie | Écologie des populations | Anglais L3 - S6 | Génétique des populations | Travail d'initiative en Biologie | Stage professionnel 2 mois | Outils bibliographiques | Microbiologie environnementale | Milieux sédimentaires 2 | Étude de la biodiversité sur le terrain | Biochimie des protéines | Anglais L1 - S1 | Évolution et Diversité | Biologie cellulaire | Macromolécules | Chimie organique et des solutions pour SDV | Mathématiques générales | Méthodologie du travail universitaire | PIX | Roches et Chronologie | Introduction à la physique générale pour SDV | Introduction à la chimie générale pour SDV | Écologie et Écosystèmes | Biologie végétale 1 | Biologie animale 1 | Microbiologie 1 | Anglais L1 - S2 | UE Transverse | Expression écrite et orale | PEP'S 1 | UE CMI Théâtre 1 : prendre la parole en public | Structures géologiques | Chimie organique et solutions 2 | Anglais L2 - S3 | Biologie moléculaire | Biochimie générale | Biologie végétale 2 | Biologie cellulaire | Anatomie Comparée et Développement de Vertébrés | Outils pour la modélisation en biologie 1 | Expression écrite et oral | PEP'S 2 | UET Changements Globaux | Physique du globe 1 | Chimie des solutions 3 | Anglais L2 - S4 | Génétique | Microbiologie 2 | Physiologie végétale 1 : Nutrition et métabolisme | Physiologie animale 1 | Outils pour la modélisation en biologie 2 | UE Transverse | Milieux sédimentaires 1 | Chimie organique fonctionnelle, mécanisme réactionnel | UE CMI : Préparation à l'international | Biochimie expérimentale | Biologie moléculaire pratique | Virologie | Génétique bactérienne | Outils pour la modélisation en biologie 3 | Anglais L3 - S5 | UE Transverse | PEP'S 3 | Physiologie animale 2 | Physiologie végétale 2 : Croissance et Développement | Microbiologie pratique | Chimie analytique 1 | Technique de programmation appliquée à la biologie | UE CMI : Certification Voltaire | Biochimie des protéines | Biologie moléculaire 3 | Immunologie | Anglais L3 - S6 | Outils Bioinformatiques | Travail d'initiative en Biologie | Stage professionnel 2 mois | Outils bibliographiques | Microbiologie environnementale | Étude de la biodiversité sur le terrain | Génétique des populations | Chimie Analytique 2 pour SDV | Évolution et Diversité | Biologie cellulaire | Macromolécules | Chimie organique et des solutions pour SDV | Mathématiques générales | Anglais L1 - S1 | Santé 1 | Introduction à la physique générale pour SDV | Méthodologie du travail universitaire | Écologie et Écosystèmes | Microbiologie 1 | Biologie végétale 1 | Biologie animale 1 | Anglais L1 - S2 | Santé 2 | Santé 3 | Structures géologiques | Chimie organique fondamentale et Chimie des solutions 2 | Biologie moléculaire | Biochimie générale | Biologie cellulaire | Biologie végétale 2 | Anatomie Comparée et Développement de Vertébrés | Outils pour la modélisation en biologie 1 | Anglais L2 - S3 | Expression écrite et oral | PEP'S 2 | UET Changements Globaux | Chimie des solutions 3 | Santé | Physique du globe 1 | Génétique | Microbiologie 2 | Physiologie végétale 1 : Nutrition et métabolisme | Physiologie animale 1 | Outils pour la modélisation en biologie 2 | Anglais L2 - S4 | 1 UE au choix | Milieux sédimentaires 1 | Chimie organique fonctionnelle, mécanisme réactionnel | Santé | Biologie moléculaire pratique | Virologie | Génétique bactérienne | Anglais L3 - S5 | PEP'S 3 | Biochimie expérimentale | Outils pour la modélisation en biologie 3 | 1 UE au choix | Physiologie animale 2 | Physiologie végétale 2 : Croissance et Développement | Microbiologie pratique | Chimie analytique 1 | Technique de programmation appliquée à la biologie | Biochimie des protéines | Biologie moléculaire 3 | Immunologie | Anglais L3 - S6 | Outils Bioinformatiques | Stage professionnel 2 mois | Outils bibliographiques | Microbiologie environnementale | Génétique des populations | Travail d'initiative en Biologie | Étude de la biodiversité sur le terrain | Chimie Analytique 2 pour SDV | |
| Analyser en se reposant sur un socle de connaissances scientifiques | Mobiliser les concepts mathématiques dans les domaines physico-chimiques | 1 - Notion | 1 - Notion | 2 - Application | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Développer un esprit critique sur des données expérimentales | 1 - Notion | 1 - Notion | 1 - Notion | 1 - Notion | 1 - Notion | 2 - Application | 2 - Application | 3 - Maitrise | 2 - Application | 1 - Notion | 1 - Notion | x | 1 - Notion | x | 2 - Application | x | x | x | 1 - Notion | x | x | x | x | x | x | x | x | 1 - Notion | 3 - Maitrise | x | 3 - Maitrise | 2 - Application | 1 - Notion | 1 - Notion | x | 1 - Notion | x | 2 - Application | x | x | x | x | 1 - Notion | x | x | x | x | x | x | x | x | 1 - Notion | 3 - Maitrise | x | 3 - Maitrise | 1 - Notion | 1 - Notion | 1 - Notion | x | x | 2 - Application | x | x | x | 1 - Notion | x | x | x | x | x | x | x | x | 1 - Notion | x | x | 3 - Maitrise | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Relier un phénomène macroscopique aux processus microscopiques | 1 - Notion | 1 - Notion | 1 - Notion | 2 - Application | 2 - Application | 1 - Notion | 1 - Notion | x | 1 - Notion | x | 2 - Application | x | x | x | 1 - Notion | x | x | x | 1 - Notion | 3 - Maitrise | x | 1 - Notion | 1 - Notion | x | 1 - Notion | x | 2 - Application | x | x | x | x | 1 - Notion | x | x | x | x | x | 1 - Notion | 3 - Maitrise | 1 - Notion | 1 - Notion | 1 - Notion | x | x | 2 - Application | x | x | x | 1 - Notion | x | x | x | x | x | 1 - Notion | x | 3 - Maitrise | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mobiliser les concepts et les outils des mathématiques, de la physique, de la chimie et de l'informatique dans le cadre des problématiques des sciences du vivant. | 1 - Notion | x | 1 - Notion | x | 2 - Application | x | x | x | x | x | x | x | x | 1 - Notion | x | 2 - Application | x | x | x | x | x | x | x | 1 - Notion | x | 2 - Application | x | x | x | x | x | x | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mobiliser les concepts et les outils des mathématiques, de la physique, de la chimie, des sciences de la vie et de l'informatique dans le cadre des problématiques des sciences de la Terre. | 3 - Maitrise | 3 - Maitrise | 3 - Maitrise | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mobiliser les concepts disciplinaires fondamentaux pour traiter une problématique du domaine ou analyser un document de recherche ou de présentation. | 3 - Maitrise | 2 - Application | x | 2 - Application | x | x | x | 2 - Application | x | x | x | x | x | x | 2 - Application | x | 3 - Maitrise | x | 2 - Application | x | 2 - Application | x | x | x | x | 2 - Application | x | x | x | 3 - Maitrise | x | x | 2 - Application | x | 3 - Maitrise | 2 - Application | 2 - Application | x | x | x | x | 2 - Application | x | x | x | x | 3 - Maitrise | x | x | 2 - Application | x | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mobiliser des concepts mathématiques dans les domaines physico-chimiques | 1 - Notion | 1 - Notion | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Manipuler les mécanismes fondamentaux à l'échelle microscopique, modéliser les phénomènes macroscopiques, relier un phénomène macroscopique aux processus microscopiques. | x | x | x | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Elaborer une démarche scientifique | Concevoir et mettre en œuvre une démarche scientifique | 1 - Notion | 1 - Notion | 1 - Notion | 1 - Notion | 1 - Notion | 1 - Notion | 2 - Application | 2 - Application | 1 - Notion | 1 - Notion | x | x | x | x | x | x | x | 3 - Maitrise | 1 - Notion | x | x | x | x | x | x | 3 - Maitrise | x | x | 3 - Maitrise | 1 - Notion | x | x | x | x | x | x | 3 - Maitrise | x | x | 3 - Maitrise | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modéliser un phénomène physico-chimique | 1 - Notion | 1 - Notion | 2 - Application | 2 - Application | 2 - Application | 2 - Application | 2 - Application | 2 - Application | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modéliser un phénomène biologique | 1 - Notion | x | 2 - Application | x | x | x | x | x | x | x | x | x | 2 - Application | x | x | x | x | x | x | x | x | x | x | 2 - Application | x | x | x | x | x | x | x | x | x | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Maîtriser les techniques et les appareils de laboratoire | 2 - Application | x | x | x | x | x | x | 3 - Maitrise | x | x | x | x | x | x | x | x | 3 - Maitrise | x | x | x | x | x | x | x | 3 - Maitrise | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identifier les réglementations spécifiques et mettre en œuvre les principales mesures de prévention en matière d'hygiène et de sécurité. | 3 - Maitrise | 3 - Maitrise | 3 - Maitrise | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identifier et mener en autonomie les différentes étapes d'une démarche expérimentale. | x | x | x | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Développer un esprit critique sur des données expérimentales | 2 - Application | 2 - Application | 2 - Application | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Collaborer et communiquer dans le cadre d'un projet scientifique | x | x | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Communiquer et collaborer | Maîtriser les outils numériques | x | 1 - Notion | 1 - Notion | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Collaborer et communiquer dans le cadre d'un projet scientifique | 1 - Notion | 1 - Notion | 1 - Notion | 1 - Notion | 2 - Application | 1 - Notion | x | 2 - Application | x | x | x | x | 3 - Maitrise | 2 - Application | x | 1 - Notion | x | 2 - Application | x | x | x | x | 3 - Maitrise | x | x | x | x | x | 3 - Maitrise | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Utiliser les outils numériques de référence et les règles de sécurité informatique pour acquérir, traiter, produire et diffuser de l'information ainsi que pour collaborer en interne et en externe. | 3 - Maitrise | 3 - Maitrise | 3 - Maitrise | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Développer la pratique d'une langue étrangère dans les domaines scientifiques | 1 - Notion | 2 - Application | 1 - Notion | 2 - Application | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Se servir aisément des différents registres d'expression écrite et orale de la langue française. | x | x | x | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modéliser un phénomène biologique | x | x | x | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Maîtrise des outils numériques | x | x | x | x | x | x | x | x | x | x | x | x | x | x | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Travailler dans le cadre des projets pluridisciplinaires, de recherche, d'innovation et internationaux | Communiquer en plusieurs langues et être capable de s'adapter à un monde ouvert | 2 - Application | 3 - Maitrise | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Communiquer en contexte professionnel | Communiquer à des fins de formation ou de transfert de connaissances, par oral et par écrit, en français et dans au moins une langue étrangère | 2 - Application | 3 - Maitrise | 2 - Application | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Appui à la transformation en contexte professionnel | Conduire un projet ou une étude pouvant mobiliser des compétences pluridisciplinaires dans un cadre collaboratif | 2 - Application | 3 - Maitrise | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Conduire un projet ou une étude pouvant mobiliser des compétences pluridisciplinaires dans un cadre collaboratif | 2 - Application | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Construire son projet | Identifier sa responsabilité individuelle et collective au sein d'une stucture professionnelle | 1 - Notion | 1 - Notion | 1 - Notion | 1 - Notion | 2 - Application | 1 - Notion | 2 - Application | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Explorer le monde professionnel pour orienter son projet | 1 - Notion | 1 - Notion | 1 - Notion | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Travailler en équipe et en réseau ainsi qu'en autonomie et responsabilité au service d'un projet | 3 - Maitrise | 3 - Maitrise | 3 - Maitrise | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| S’exprimer et communiquer à l’oral, à l’écrit, et dans au moins une langue étrangère | Communiquer par oral et par écrit, de façon claire et non-ambiguë, en anglais. | x | x | x | x | x | x | x | x | x | x | x | x | x | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Maîtriser les disciplines scientifiques et les concepts fondamentaux des Géosciences | Manipuler et mobiliser les disciplines et les concepts fondamentaux des géosciences (minéralogie, pétrologie, sédimentologie, pétrographie, géophysique, géotechnique, paléontologie…), des échelles microscopiques aux échelles macroscopiques. | x | 1 - Notion | 2 - Application | x | x | x | x | 1 - Notion | x | 1 - Notion | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mobiliser les concepts et les outils des mathématiques, de la physique, de la chimie, des sciences de la vie et de l'informatique dans le cadre des problématiques des sciences de la Terre. | x | 1 - Notion | x | x | x | x | 1 - Notion | x | 1 - Notion | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Analyser, interpréter et synthétiser des données en géosciences | Savoir utiliser les appareils et les techniques de mesure nécessaires à l'observation et la description des objets et phénomènes géologiques sur le terrain ou en laboratoire | x | 1 - Notion | 2 - Application | x | x | 1 - Notion | x | 1 - Notion | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Savoir interpréter et valider des résultats expérimentaux et des observations géologiques et géophysiques | 2 - Application | x | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Positionnement vis à vis d’un champ professionnel | Identifier le processus de production, de diffusion et de valorisation des savoirs | 1 - Notion | 1 - Notion | 2 - Application | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Caractériser et valoriser son identité, ses compétences et son projet professionnel en fonction d'un contexte | 1 - Notion | 1 - Notion | 2 - Application | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identifier et situer les champs professionnels potentiellement en relation avec les acquis de la mention ainsi que les parcours possibles pour y accéder | 1 - Notion | 1 - Notion | 2 - Application | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Maîtriser une Langue Vivante | Communiquer par oral et par écrit, de façon claire et non ambigue, dans au moins une langue étrangère | x | x | x | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Communiquer des données sociologiques à des fins de formation ou de transfert de connaissances, par oral et par écrit, en français et dans au moins une langue étrangère | x | x | x | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Se positionner vis à vis d’un champ professionnel | Identifier et situer les champs professionnels potentiellement en relation avec les acquis de la discipline ainsi que les parcours possibles pour y accéder | 2 - Application | 2 - Application | 2 - Application | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identifier le processus de production, de diffusion et de valorisation des savoirs | 2 - Application | 2 - Application | 2 - Application | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Caractériser et valoriser son identité, ses compétences et son projet professionnel en fonction d'un contexte | 2 - Application | 2 - Application | 2 - Application | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Programme
Sélectionnez un programme
L1, L2, L3 Parcours biologie des organismes (Anglet)
La Licence de Biologie des Organismes est destinée aux étudiants intéressés par la biologie des organismes, des populations et des écosystèmes et, dans un cadre plus général, par les sciences environnementales.
Les unités d'enseignements dispensées au cours des 3 années d'études apportent les connaissances fondamentales de biochimie, de biologie cellulaire et moléculaire, de génétique, de microbiologie et de physiologie animale et végétale.
Les enseignements de statistique apportent la maîtrise des traitements et de l'analyse des données biologiques.
Les étudiants de 3ème année acquièrent une expérience professionnelle (en France, ou à l'étranger) dans le cadre d'un stage de 2 mois minimum.
Ecologie, Evolution, Environnement
4 crédits39hBiologie Cellulaire 1
4 crédits39hProbabilités Statistiques
2 crédits9hPhysique-Chimie pour la Biologie 1
4 crédits39hIntroduction aux Géosciences
2 crédits19,5hAnglais L1 - S1
2 crédits19,5hMéthodologie du travail universitaire
2 créditsEmbryologie
2 crédits19,5hMathématiques pour Sciences de la Vie
4 crédits39hAu choix : 2 à 3 parmi 4
Histoire des Sciences
2 crédits19,5hChimie Organique (avancé)
2 crédits39hInformatique et certification PIX
2 crédits13,5hAnimation Scientifique
2 crédits12h
Biologie Animale
6 crédits51hBiologie Végétale
6 crédits51hBiostatistiques
2 crédits19,5hPhysique Chimie pour la Biologie 2
4 crédits39hPEP'S 1
1 crédits12hAnglais L1 - S2
2 crédits19,5hMathématiques 2
1 crédits12hAu choix : 3 parmi 6
Parasitologie
2 crédits19,5hAnatomie Comparée
2 crédits19,5hSols et Paysages
2 crédits19,5hTP Chimie
2 crédits15hEnseignement Scientifique en école
2 crédits4hChimie des solutions (avancée)
2 crédits19,5h
UE Transverse
2 crédits19,5h
Physiologie Animale
6 crédits51hBiochimie
6 crédits51hÉcologie des Populations
4 crédits39hBiologie Moléculaire
4 crédits39hBiostatistiques 2
2 crédits19,5hAnglais L2 - S3
2 crédits19,5hAu choix : 1 à 2 parmi 8
Hydrologie
2 crédits19,5hSols et Agronomie
2 crédits19,5hPerception Sensorielle
2 crédits19,5hChimie des solutions 2
4 crédits39hInformatique et certification PIX
2 crédits13,5hStage
2 créditsEthologie 1
2 crédits19,5hStratégies de Reproduction
2 crédits19,5h
UE Transverse
2 crédits19,5h
Génétique
5 crédits51hMicrobiologie
4 crédits39hPhysiologie Végétale
6 crédits51hBiologie Cellulaire 2
4 crédits39hTraitements statistiques des données 1
2 crédits19,5hPEP'S 2
1 crédits12hAnglais L2 - S4
2 crédits19,5hAu choix : 1 à 2 parmi 8
Ecologie Appliquée
2 crédits24hBiologie de la Conservation
2 crédits19,5hImmunology
2 crédits19,5hSciences Environnementales
2 crédits19,5hChimie organique 2
4 crédits47hEnseignement Scientifique en école
2 crédits4hStage
2 créditsEthologie 2
2 crédits10,5h
UET Changements Globaux
2 crédits
Physiologie animale 2
4 crédits39hDiversité génétique
4 crédits39hGénétique moléculaire
4 crédits39hStructure et fonctionnement des écosystèmes
6 crédits51hSystèmes évolution des végétaux
4 crédits39hBiostatistique 3
4 crédits39hAnglais L3 - S5
2 crédits18hUE Transverse
2 crédits19,5h
Biologie Evolutive 2
4 crédits39hBiologie Expérimentale
4 crédits12hGénétique des Populations
4 crédits39hTravaux de recherche encadrés
4 crédits46,5hTraitement statistiques des données 2
4 crédits39hPEP'S 3
1 crédits12hStage
7 créditsAu choix : 1 parmi 2
Perception Sensorielle en milieu aquatique
2 crédits19,5hVirologie
2 crédits19,5h
L1 et L2 communes, L3 Parcours biologie générale et sciences de la Terre (Pau)
Cette licence Sciences et Technologies Santé, mention Sciences de la Vie, vise à assurer une formation de base dans les différents domaines de la biologie, en mettant l’accent sur les concepts et les développements méthodologiques les plus récents, afin de permettre aux étudiants
- d’intégrer un Master Recherche ou Professionnel d’une université française ou européenne,
- d'intégrer un Master préparant aux concours de l'enseignement,
- de se présenter sur dossier dans les grandes écoles scientifiques,
- de s’insérer dans la vie active, via par exemple, une des licences professionnelles proposées dans le domaine par l’UPPA.
A l'issue de la licence, l'étudiant sera capable de développer une approche pluridisciplinaire et de travailler à différents niveaux d'intégration du monde vivant (molécule, cellule, organisme, population, écosystème).
Vous trouverez des informations sur la licence, les inscriptions pédagogiques et le choix des unités d'enseignement ici.
Anglais L1 - S1
2 crédits19,5hÉvolution et Diversité
4 crédits39hBiologie cellulaire
4 crédits39hMacromolécules
4 crédits39hChimie organique et des solutions pour SDV
4 crédits39hChimie des solutions 1 pour SDV
2 crédits19,5hChimie organique structure des molécules pour SDV
2 crédits19,5h
Mathématiques générales
4 crédits39hMéthodologie du travail universitaire
2 crédits19,5hPIX
2 crédits18hAu choix : 1 parmi 3
Roches et Chronologie
4 crédits39hIntroduction à la physique générale pour SDV
4 crédits39hIntroduction à la chimie générale pour SDV
4 crédits39h
Écologie et Écosystèmes
5 crédits39hBiologie végétale 1
5 crédits39hBiologie animale 1
5 crédits36hMicrobiologie 1
5 crédits34,5hAnglais L1 - S2
2 crédits19,5hUE Transverse
2 crédits19,5hPEP'S 1
1 crédits12hUE CMI Théâtre 1 : prendre la parole en public
2 crédits19,5hExpression écrite et orale 1
1 crédits9hAu choix : 1 parmi 2
Structures géologiques
4 crédits39hChimie organique et solutions 2
4 crédits39hChimie organique fondamentale
2 crédits19,5hChimie des Solutions 2 SDV
2 crédits19,5h
Anglais L2 - S3
2 crédits19,5hBiologie moléculaire
4 crédits39hBiochimie générale
4 crédits71hBiologie végétale 2
4 crédits39,5hBiologie cellulaire
2 crédits19,5hAnatomie Comparée et Développement de Vertébrés
4 crédits37,5hOutils pour la modélisation en biologie 1
2 crédits19,5hExpression écrite et oral
1 crédits9hPEP'S 2
1 crédits12hUET Changements Globaux
2 créditsAu choix : 1 parmi 2
Physique du globe 1
5 crédits39hChimie des solutions 3
4 crédits39h
Anglais L2 - S4
2 crédits19,5hGénétique
4 crédits39hMicrobiologie 2
4 crédits39hPhysiologie végétale 1 : Nutrition et métabolisme
6 crédits62hPhysiologie animale 1
6 crédits66hOutils pour la modélisation en biologie 2
2 crédits19,5hUE Transverse
2 crédits19,5hAu choix : 1 parmi 2
Milieux sédimentaires 1
4 crédits39hChimie organique fonctionnelle, mécanisme réactionnel
4 crédits39h
Au choix : 1 à 5 parmi 1
UE CMI : Préparation à l'international
2 crédits24h
Biologie moléculaire pratique
3 crédits55hVirologie
4 crédits39hGénétique bactérienne
2 crédits19,5hAnglais L3 - S5
2 crédits19,5hUE Transverse
2 crédits19,5hPEP'S 3
1 crédits0hAu choix : 4 parmi 5
Physiologie animale 2
4 crédits39hPhysiologie végétale 2 : Croissance et Développement
4 crédits39hRoches endogènes 1
4 crédits36hMarges et Chaines de montagnes
4 crédits36hOutils pour la modélisation en biologie 3
4 crédits40h
Biologie moléculaire 3
5 crédits39hImmunologie
5 crédits39hÉcologie des populations
4 crédits39hAnglais L3 - S6
2 crédits19,5hGénétique des populations
4 crédits39hAu choix : 3 à 5 parmi 7
Travail d'initiative en Biologie
3 crédits19,5hStage professionnel 2 mois
2 créditsOutils bibliographiques
4 crédits35hMicrobiologie environnementale
4 crédits39hMilieux sédimentaires 2
4 crédits39hÉtude de la biodiversité sur le terrain
3 crédits38hBiochimie des protéines
6 crédits34,5h
L1 et L2 communes, L3 Parcours biologie cellulaire et moléculaire (Pau)
Cette licence Sciences et Technologies Santé, mention Biologie, vise à assurer une formation de base dans les différents domaines de la biologie, en mettant l’accent sur les concepts et les développements méthodologiques les plus récents, afin de permettre aux étudiants.
- d’intégrer un Master Recherche ou Professionnel d’une Université française ou européenne,
- d'intégrer un Master préparant aux concours de l'enseignement,
- de se présenter sur dossier dans les grandes écoles scientifiques,
- de s’insérer dans la vie active, via par exemple, une des licences professionnelles proposées dans le domaine par l’UPPA.
A l'issue de la licence, l'étudiant sera capable de développer une approche pluridisciplinaire et de travailler à différents niveaux d'intégration du monde vivant (molécule, cellule, organisme, population, écosystème).
Vous trouverez des informations sur la licence, les inscriptions pédagogiques et le choix des unités d'enseignement ici.
Anglais L1 - S1
2 crédits19,5hÉvolution et Diversité
4 crédits39hBiologie cellulaire
4 crédits39hMacromolécules
4 crédits39hChimie organique et des solutions pour SDV
4 crédits39hChimie des solutions 1 pour SDV
2 crédits19,5hChimie organique structure des molécules pour SDV
2 crédits19,5h
Mathématiques générales
4 crédits39hMéthodologie du travail universitaire
2 crédits19,5hPIX
2 crédits18hAu choix : 1 parmi 3
Roches et Chronologie
4 crédits39hIntroduction à la physique générale pour SDV
4 crédits39hIntroduction à la chimie générale pour SDV
4 crédits39h
Écologie et Écosystèmes
5 crédits39hBiologie végétale 1
5 crédits39hBiologie animale 1
5 crédits36hMicrobiologie 1
5 crédits34,5hAnglais L1 - S2
2 crédits19,5hUE Transverse
2 crédits19,5hExpression écrite et orale
1 crédits9hPEP'S 1
1 crédits12hUE CMI Théâtre 1 : prendre la parole en public
2 crédits19,5hAu choix : 1 parmi 2
Structures géologiques
4 crédits39hChimie organique et solutions 2
4 crédits39hChimie organique fondamentale
2 crédits19,5hChimie des Solutions 2 SDV
2 crédits19,5h
Anglais L2 - S3
2 crédits19,5hBiologie moléculaire
4 crédits39hBiochimie générale
4 crédits71hBiologie végétale 2
4 crédits39,5hBiologie cellulaire
2 crédits19,5hAnatomie Comparée et Développement de Vertébrés
4 crédits37,5hOutils pour la modélisation en biologie 1
2 crédits19,5hExpression écrite et oral
1 crédits9hPEP'S 2
1 créditsUET Changements Globaux
2 créditsAu choix : 1 parmi 2
Physique du globe 1
5 crédits39hChimie des solutions 3
4 crédits39h
Anglais L2 - S4
2 crédits19,5hGénétique
4 crédits39hMicrobiologie 2
4 crédits39hPhysiologie végétale 1 : Nutrition et métabolisme
6 crédits62hPhysiologie animale 1
6 crédits66hOutils pour la modélisation en biologie 2
2 crédits19,5hUE Transverse
2 crédits19,5hAu choix : 1 parmi 2
Milieux sédimentaires 1
4 crédits39hChimie organique fonctionnelle, mécanisme réactionnel
4 crédits39h
Au choix : 1 à 5 parmi 1
UE CMI : Préparation à l'international
2 crédits24h
Biochimie expérimentale
4 crédits58hBiologie moléculaire pratique
3 crédits55hVirologie
4 crédits39hGénétique bactérienne
2 crédits19,5hOutils pour la modélisation en biologie 3
4 crédits40hAnglais L3 - S5
2 crédits19,5hUE Transverse
2 crédits19,5hPEP'S 3
1 crédits0hAu choix : 4 parmi 5
Physiologie animale 2
4 crédits39hPhysiologie végétale 2 : Croissance et Développement
4 crédits39hMicrobiologie pratique
2 crédits25hChimie analytique 1
2 crédits19,5hTechnique de programmation appliquée à la biologie
2 crédits19,5h
UE CMI : Certification Voltaire
2 crédits
Biochimie des protéines
6 crédits34,5hBiologie moléculaire 3
5 crédits39hImmunologie
5 crédits39hAnglais L3 - S6
2 crédits19,5hOutils Bioinformatiques
2 crédits19,5hAu choix : 3 à 5 parmi 7
Travail d'initiative en Biologie
3 crédits19,5hStage professionnel 2 mois
2 créditsOutils bibliographiques
4 crédits35hMicrobiologie environnementale
4 crédits39hÉtude de la biodiversité sur le terrain
3 crédits38hGénétique des populations
4 crédits39hChimie Analytique 2 pour SDV
4 crédits
Accès santé (LAS)
La licence Sciences de la vie propose un parcours Accès Santé (LAS) sur le campus de Pau. Cette LAS est construite à partir du parcours Santé proposé par l’Université de Bordeaux.
Évolution et Diversité
4 crédits39hBiologie cellulaire
4 crédits39hMacromolécules
4 crédits39hChimie organique et des solutions pour SDV
4 crédits39hChimie des solutions 1 pour SDV
2 crédits19,5hChimie organique structure des molécules pour SDV
2 crédits19,5h
Mathématiques générales
4 crédits39hAnglais L1 - S1
2 crédits19,5hSanté 1
2 créditsIntroduction à la physique générale pour SDV
4 crédits39hMéthodologie du travail universitaire
2 crédits19,5h
Écologie et Écosystèmes
5 crédits39hMicrobiologie 1
5 crédits34,5hBiologie végétale 1
5 crédits39hBiologie animale 1
5 crédits36hAnglais L1 - S2
2 crédits19,5hSanté 2
2 créditsSanté 3
2 créditsAu choix : 1 parmi 2
Structures géologiques
4 crédits39hChimie organique fondamentale et Chimie des solutions 2
4 créditsFacultatif
Chimie des Solutions 2 SDV
2 crédits19,5hChimie organique fondamentale
2 crédits19,5h
Biologie moléculaire
4 crédits39hBiochimie générale
4 crédits71hBiologie cellulaire
2 crédits19,5hBiologie végétale 2
4 crédits39,5hAnatomie Comparée et Développement de Vertébrés
4 crédits37,5hOutils pour la modélisation en biologie 1
2 crédits19,5hAnglais L2 - S3
2 crédits19,5hExpression écrite et oral
1 crédits9hPEP'S 2
1 crédits12hUET Changements Globaux
2 créditsAu choix : 1 parmi 3
Chimie des solutions 3
4 crédits39hSanté
4 créditsPhysique du globe 1
5 crédits39h
Génétique
4 crédits39hMicrobiologie 2
4 crédits39hPhysiologie végétale 1 : Nutrition et métabolisme
6 crédits62hPhysiologie animale 1
6 crédits66hOutils pour la modélisation en biologie 2
2 crédits19,5hAnglais L2 - S4
2 crédits19,5h1 UE au choix
2 créditsUE Transverse
2 crédits19,5hSanté
2 crédits
Au choix : 1 parmi 3
Milieux sédimentaires 1
4 crédits39hChimie organique fonctionnelle, mécanisme réactionnel
4 crédits39hSanté
4 crédits
Biologie moléculaire pratique
3 crédits55hVirologie
4 crédits39hGénétique bactérienne
2 crédits19,5hAnglais L3 - S5
2 crédits19,5hPEP'S 3
1 crédits0hBiochimie expérimentale
4 crédits58hOutils pour la modélisation en biologie 3
4 crédits40h1 UE au choix
2 créditsUE Transverse
2 crédits19,5hSanté
2 crédits
Au choix : 4 parmi 5
Physiologie animale 2
4 crédits39hPhysiologie végétale 2 : Croissance et Développement
4 crédits39hMicrobiologie pratique
2 crédits25hChimie analytique 1
2 crédits19,5hTechnique de programmation appliquée à la biologie
2 crédits19,5h
Biochimie des protéines
6 crédits34,5hBiologie moléculaire 3
5 crédits39hImmunologie
5 crédits39hAnglais L3 - S6
2 crédits19,5hOutils Bioinformatiques
2 crédits19,5hAu choix : 3 à 5 parmi 7
Stage professionnel 2 mois
2 créditsOutils bibliographiques
4 crédits35hMicrobiologie environnementale
4 crédits39hGénétique des populations
4 crédits39hTravail d'initiative en Biologie
3 crédits19,5hÉtude de la biodiversité sur le terrain
3 crédits38hChimie Analytique 2 pour SDV
4 crédits
Ecologie, Evolution, Environnement
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Ecologie, Evolution, Environnement - CM, Ecologie, Evolution, Environnement - TD
L'UE présente les bases (sémantiques, théoriques et mécanistiques) de l’écologie scientifique utiles à la compréhension de la structure et du fonctionnement des écosystèmes. Elle aborde également en TD des enjeux sociétaux contemporains et s'organise globalement selon les axes suivants :
- Introduction à l'écologie.
- Interactions organismes et environnements.
- Énergie et matière dans les écosystèmes.
- Écologie des populations.
- Interactions entre populations.
- Écologie des communautés.
Biologie Cellulaire 1
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biologie Cellulaire 1 - CM, Biologie Cellulaire 1 - TD
L’objectif de l’UE est de décrire l’organisation structuro-fonctionnelle de la cellule et de comprendre la situation de la cellule parmi les différents niveaux de l’organisation d’un organisme vivant. C’est pourquoi, le premier chapitre portera sur le niveau "amont" : les biomolécules et le dernier chapitre portera sur le niveau "aval" : les tissus.
En TD, les étudiant seront amenés à travailler sur des exercices de réflexion pour asseoir des connaissances théoriques abordées en cours et pour aborder les méthodes de d’étude en biologie cellulaire. Une partie des TD sera consacrée à la présentation orale par les étudiants de petits travaux de recherche bibliographique
Probabilités Statistiques
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
9h
Heures d'enseignement
Probabilités Statistiques - CM, TD
Statistique descriptive univariée à l’aide d’un tableur
- Variable quantitative, variable qualitative,
- Répartition par modalités ou par intervalles de valeurs,
- Représentations graphiques,
- Valeurs caractéristiques d’une distribution statistique (indicateurs de position et dispersion).
Probabilités
- Expérience aléatoire, évènements,
- Variables aléatoires,
- Loi de probabilité (discrète, continue), Fonction de répartition,
- Espérance mathématique, variance,
- Lois de probabilités usuelles (Bernoulli/binomiale/géométrique, Poisson/exponentielle, uniforme, normale).
Statistique inférentielle
- Fluctuations d’échantillonnage,
- Intervalles de confiance pour les grands échantillons (moyenne, proportion, variance).
L’approche pédagogique, basée sur un cours magistral classique et des travaux dirigés sur ordinateur, privilégie l’engagement des étudiants à travers de nombreux exercices d’application.
Physique-Chimie pour la Biologie 1
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Architecture de la matière - CM, Architecture de la matière - TD
Décrivant la matière au niveau macroscopique par des espèces chimiques aux propriétés physiques et chimiques caractéristiques, le chimiste la modélise au niveau microscopique par des entités chimiques dont la structure électronique permet de rendre compte et de prévoir diverses propriétés.
Description microscopique
L’étude proposée dans cette UE est centrée sur la classification périodique des éléments, outil essentiel du chimiste, dans l’objectif de développer les compétences relatives à son utilisation : extraction des informations qu’elle contient, prévision de la réactivité des corps simples, prévision de la nature des liaisons chimiques dans les corps composés, etc. On se limite aux principales caractéristiques de la liaison chimique, à l’exclusion de modèles plus élaborés comme la théorie des orbitales moléculaires qui sera étudiée en seconde année.
Ce module permet une introduction aux notions de base de chimie quantique (introduction de l’équation de Schrödinger, et des nombres quantiques caractérisant un électron au sein d’un atome ou d’un ion monoatomique).
Description macroscopique
La finalité de ce module est de faire le lien entre certaines propriétés macroscopiques d’une espèce chimique moléculaire ou atomique (température de changement d’état, solubilité, …) et la description microscopique des entités chimiques qui la composent (polarité, polarisabilité…).
Les liaisons intermoléculaires sont décrites et la notion de solvant est abordée (en relation avec l’UE de chimie organique)
Ce module est complété par des travaux pratiques (UE Physique et Chimie Expérimentale 1).
Contenus des enseignements :
- L’atome
Les modèles historiques – Le modèle quantique – Retour sur l’atome d’hydrogène et la quantification de l’énergie.
Description des orbitales atomiques (nombres quantiques, formes des OA, énergie …).
Configuration électronique (règle de remplissage) électrons de cœur et électrons de valence.
2. Classification périodique
Architecture et lecture du tableau périodique – Evolution des propriétés au sein de la classification…- Modèle de Slater.
3. Molécule et entité polyatomique
Le modèle de Lewis – Géométrie et modèle de Gillespie (méthode VSEPR) – Théorie de l’hybridation (méthode CLOA) – Polarité – Moment dipolaire – Polarisabilité.
4. Interactions intermoléculaires – Propriétés de la matière - Solvants
Interactions de Van der Waals – Liaison hydrogène - Grandeurs caractéristiques des solvants : moment dipolaire et permittivité relative.
Introduction aux Géosciences
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Géologie 1 - CM, Géologie 1 - TD
À travers différentes disciplines relevant de la géologie (datation, géochimie, sismologie, cartographie…), l’objectif est d’acquérir à la fois des connaissances de base sur la nature et la structure du globe ainsi que des méthodes d’analyse essentielles.
Les séances de TD porteront sur la mise en œuvre de méthodes de datation, d’analyse des données de sismogrammes, et d’analyse de données cartographiques.
Principaux thèmes abordés :
- Du minéral à la roche : Systèmes cristallins, familles de minéraux ; les différents types de roches exogènes et endogènes.
- Dater et ordonner les roches : Datation relative (principes de datation relative ; notion de fossile stratigraphique, biozone), radiochronologie (principaux couples d’éléments et leur utilisation ; âge radiométrique d’une roche).
- Tableau chronostratigraphique : corrélations stratigraphiques, stratotypes d’unité et de limite (GSSP).
- Sismologie et établissement du modèle PREM : discontinuités majeures, LVZ.
- Les données d’une carte géologique ; première approche d’une coupe géologique.
Anglais L1 - S1
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais L1 - S1 - TD
Course Description and Pedagogical Methods:
The students are organised in level-groups following the results of a placement test at the beginning of the year. In this course, the students will practice the four main skills for communication with a focus on reading comprehension, and will review some basic grammar concepts. The students will work with up-to-date materials from journals and magazines, internet articles, videos, etc. Students will improve their comprehension, fluency, and confidence in spoken and written English through individual practice and regular participation in pair and group work, oral activities, reading and listening comprehension exercises, and general classwork.
Class activities will include listening, reading, writing, and informal/formal speaking to understand, learn, remember, and explain information from both written and spoken materials. Also,to help you improve your grammar and writing, we will have online grammar practice with mini-reviews when necessary.
You will have:
- Classwork, pop quizzes and online homework that are part of the grade,
- A midterm exam level-based on the grammar and vocabulary studied in class,
- A final exam common to all levels to check your progression. The final will focus on reading comprehension.
Méthodologie du travail universitaire
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Heures d'enseignement
CM, TD
Embryologie
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Embryologie - CM, Embryologie - TD
L’objectif est de connaître les modalités de la mise en place, au cours du développement embryonnaire, du plan d’organisation chez quelques grands groupes animaux, ainsi que d’acquérir des notions de biologie du développement qui trouveront leur suite logique en biologie et physiologie animales, en anatomie comparée, en phylogénie…
Contenu :
Cours magistral : embryologie descriptive de différents représentants des métazoaires : détails des étapes de fécondation, segmentation, gastrulation, et organogenèse ; stades larvaires, métamorphose.
TD : analyse d’observations et de résultats expérimentaux, comprenant un aspect historique des découvertes en embryologie, pour caractériser certains aspects du développement par la pratique d’un raisonnement scientifique rigoureux.
Mathématiques pour Sciences de la Vie
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
CM, TD
Histoire des Sciences
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Histoire des Sciences -CM, Histoire des Sciences - TD
À travers de nombreux exemples tirés des domaines de la Physique, de la Chimie, de la Biologie et de la Géologie, les étudiants replaceront chronologiquement les différentes avancées scientifiques au cours de l’Histoire.
Deux méthodes de construction des connaissances scientifiques (inductivisme et falsificationnisme) et le concept de révolution scientifique seront présentés, avec leurs limites.
Enfin, à l’aide d’exemples historiques et actuels, les étudiants seront amenés à s’interroger sur les liens entre Science et Société et sur les implications éthiques de la Science.
Chimie Organique (avancé)
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
CM, TD
Contenus des Enseignements
- La nomenclature des composés organique ou « comment nommer les molécules »,
- La représentation spatiale des molécules et leur importance dans la réactivité,
- Ce qui provoque les réactions chimiques : effets électroniques, réactivité,
- Quelques mécanismes de bases : la substitution nucléophile et l’élimination,
- Quelques réactions des alcools et leur application en synthèse.
Informatique et certification PIX
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
13,5h
Heures d'enseignement
Informatique et certification PIX - CM, Informatique et certification PIX - TP
Préparation à la certification PIX, 8 compétences traitées dans les 5 domaines proposés :
- Partager et publier
- Résoudre des problèmes techniques
- Mener une recherche et une veille d'information
- Sécuriser l'environnement numérique
- Protéger les données personnelles et la vie privée
- Adapter les documents à leur finalité
- Traiter des données - Développer des documents textuels
Animation Scientifique
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
12h
Heures d'enseignement
Animation Scientifique - TD
L’objectif de cette UE est de réaliser une action de communication scientifique à destination d’une classe de primaire.
En groupe de 3 à 4, les étudiants produiront un support et animeront une séance de médiation scientifique avec les élèves d’une classe de primaire, en lien avec les programmes.
Biologie Animale
ECTS
6 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
51h
Heures d'enseignement
Biologie Animale - CM, Biologie Animale - TD, Biologie Animale - TP
Pour les grands embranchements d’invertébrés, nous verrons les différentes classes et leurs principales fonctions biologiques (systèmes locomoteur, respiratoire, excréteur, reproducteur, digestif, nerveux…). Les vertébrés seront principalement abordés à travers les systèmes locomoteur et respiratoire. Une attention particulière sera portée à l’évolution de ces fonctions.
Biologie Végétale
ECTS
6 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
51h
Heures d'enseignement
Biologie Végétale - CM, Biologie Végétale - TD, Biologie Végétale - TP
Objectif :
Acquérir les connaissances de base sur la phylogénie, les plans d’organisation, les cycles biologiques et la biologie des grands groupes végétaux, en particulier la biologie de la reproduction.
Contenu :
Qu’est-ce qu’un végétal ?
Données phylogénétiques et biologiques sur les grands groupes du monde « végétal » (cyanobactéries, bryophytes, trachéophytes, spermatophytes, Angiospermes…)
Description de l’appareil végétatif (cellules, tissus, organes), de l’appareil reproducteur, cycles biologiques. Aspect adaptatif et évolutif de la biologie des végétaux.
Biostatistiques
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Biostatistiques - CM, Biostatistiques - TD
Probabilités
- Processus de Bernoulli et lois associées (révisions),
- Processus de Poisson et lois associées (révisions),
- Approximation de lois :
- Du processus de Bernoulli au processus de Poisson,
- La loi normale en biologie (Théorème central limite).
- Loi du Chi2 et loi de Fisher,
- Simulations avec un tableur et le logiciel R.
Statistique descriptive univariée à l’aide d’un logiciel de statistique (logiciel R)
Statistique inférentielle
- Estimation et intervalles de confiance pour les grands échantillons (révisions),
- Intervalle de confiance : méthodes pour les petits échantillons,
- Introduction aux tests d’hypothèses (risque de première espèce et de seconde espèce, puissance).
L’approche pédagogique, basée sur un cours magistral classique et des travaux dirigés sur ordinateur, privilégie l’engagement des étudiants à travers de nombreux exercices d’application.
Physique Chimie pour la Biologie 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Chimie des Solutions 1 - CM, Chimie des Solutions 1 - TD
PEP'S 1
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
12h
Heures d'enseignement
PEP'S 1 - TD
Cet enseignement non disciplinaire a pour principal objectif de rendre l’étudiant acteur de son orientation. Il oblige l’étudiant à s’interroger sur son avenir professionnel, l’incite à découvrir les réalités professionnelles en lui transmettant une méthode de recherche et de traitement de l’information, et d’aide à la décision afin de construire un projet d’études et de définir un plan d’action.
Anglais L1 - S2
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais L1 - S2 - TD
Course Description and Pedagogical Methods:
The students are organised in level-groups following the results of a placement test at the beginning of the year. In this course, the students will practice the four main skills for communication with a focus on listening comprehension, and will review some basic grammar concepts. The students will work with up-to-date materials from journals and magazines, internet articles, videos, etc. Students will improve their comprehension, fluency, and confidence in spoken and written English through individual practice and regular participation in pair and group work, oral activities, reading and listening comprehension exercises, and general classwork.
Class activities will include listening, reading, writing, and informal/formal speaking to understand, learn, remember, and explain information from both written and spoken materials. Also,to help you improve your grammar and writing, we will have online grammar practice with mini-reviews when necessary.
You will have:
- Classwork, pop quizzes and online homework that are part of the grade,
- A midterm exam level-based on the grammar and vocabulary studied in class,
- A final exam common to all levels to check your progression. The final will focus on listening comprehension.
Mathématiques 2
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
12h
Heures d'enseignement
TD
Conçue comme une U.E. de consolidation, les Mathématiques 2 permettent d’approfondir les connaissances acquises lors du premier semestre.
Les séances de TD porteront sur la mise en œuvre de ces méthodes dans des situations classiques relevant du cadre de la biologie et de la géologie.
Principaux thèmes abordés :
- Étude d’évolutions de populations.
- Modèle de Leslie.
- Calcul de l’épaisseur du Moho.
- Amplitude d’habitat.
Parasitologie
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Parasitologie - CM, Parasitologie - TD
L'UE permet d'acquérir les connaissances de base en parasitologie (sémantiques, taxonomique et théoriques) et vise à largement illustrer la diversité parasitaire, ainsi que ses effets sur les populations/communautés hôtes. Les aspects écologiques y étant bien plus développés que les aspects épidémiologiques et/ou vétérinaires. L'UE est structurée autour des axes suivants :
- Introduction au parasitisme (diversité et mode de vie)
- Les stratégies d’exploitation du parasite (favorisation, manipulation).
- Les stratégies de résistance de l’hôte (évitement, résistance).
- Écologie parasitaire.
Anatomie Comparée
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anatomie Comparée - CM, Anatomie Comparée - TD
A travers l’étude de différents exemples, les étudiants découvriront l’anatomie générale d’un Vertébré : squelette, tégument et phanères, appareil digestif, appareil respiratoire, appareil cardiovasculaire, appareil excréteur, système nerveux, appareil reproducteur.
Lors des différentes séances de TD, ils pourront ainsi explorer la diversité anatomique des Vertébrés, en lien avec les contraintes de leur milieu de vie et leur histoire évolutive.
Les 2 dernières séances de TD seront consacrées à des exposés réalisés en groupe où les étudiants ré-investiront les connaissances acquises pendant le cours sur un Vertébré au choix.
Sols et Paysages
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Sols et Paysages - CM, Sols et Paysages - TD, Sols et Paysages - TP
Objectif :
Acquérir des notions de base en pédologie pour mieux cerner l’importance des sols d’un point de vue écologique. L’étude des sols, en particulier sur le terrain, est par ailleurs un moyen de favoriser la mise en relation des connaissances dans des domaines scientifiques variés : géologie, biologie (en particulier végétale), climatologie, chimie…
Contenu :
-Cours magistral : Structures macroscopiques (horizons) et microscopiques d’un sol ; formation (altération des roches, climatologie, interactions avec le vivant) et évolution des sols.
Données physico-chimiques (porosité, pH, …).
-TP : Étude intégrée sur le terrain (2 sorties)
-TD : exploitation des données recueillies sur le terrain à l’aide d’outils numériques spécifiques (cartographie, …)
TP Chimie
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
15h
Heures d'enseignement
TP Chimie des Solutions - TP
L’objectif de cette UE est d’acquérir un savoir-faire théorique et expérimental dans le domaine de la chimie analytique. Les différents principes de dosage volumétriques (dosages directs, dosages indirects, dosages en retour), ainsi que diverses techniques de dosage en chimie analytique (indicateurs colorés, pHmétrie, conductimétrie, potentiométrie) sont abordés sur le plan fondamental puis mis en application pour analyser des composés dans des produits alimentaires, des produits commerciaux ou d’usage courant.
L’enseignement s’organise autour de 5 séances de travaux pratiques permettant aux étudiants de devenir autonomes, aussi bien vis-à-vis des manipulations, que vis-à-vis de la présentation des résultats, l’interprétation des résultats et l’élaboration d’un compte-rendu scientifique.
Ces 5 séances se déclinent comme suit :
. Préparation d’une solution étalon – Dosages acido-basiques par colorimétrie ;
. Dosage acido-basiques de produits d’usage courant par pH-métrie ;
. Comparaison des techniques de pH-métrie et conductimétrie pour des dosages acido-basiques ;
. Dosages d’oxydo-réduction (directs et indirects) par colorimétrie et potentiométrie.
. Résolution d’une problématique en totale autonomie.
Enseignement Scientifique en école
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
4h
Heures d'enseignement
Enseignement Scientifique en école - TD
L’objectif de cette UE est de découvrir le monde de l’enseignement au cours d’un stage de 6 demi-journées avec un(e) enseignant(e) au sein d’une classe de l’enseignement primaire ou secondaire.
Chaque étudiant devra trouver un enseignant tuteur, faire valider leur convention de stage, observer une ou plusieurs séances en classe, réaliser une progression en lien avec les programmes de Sciences de l’Éducation nationale en collaboration avec leur enseignant tuteur et enfin animer une ou plusieurs séances en classe (en présence de leur enseignant tuteur).
À la suite de ce stage, l’étudiant remettra un rapport de stage et effectuera une soutenance orale.
Chimie des solutions (avancée)
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD
UE Transverse
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Plus d'informations à la page suivante : https://formation.univ-pau.fr/fr/scolarite/ue-transverses.html
Physiologie Animale
ECTS
6 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
51h
Heures d'enseignement
Physiologie Animale - CM, Physiologie Animale - TD, Physiologie Animale - TP
- Physiologie cellulaire : mécanismes des transports membranaires.
- Système nerveux : neurone, déclenchement et propagation du potentiel d’action, synapses électrique et chimique, système nerveux autonome
- Mécanisme réflexe : exemple de la posture et de l’équilibration
- Fonctionnement du muscle squelettique
- Système cardio-vasculaire : cœur et système vasculaire, régulation de la pression artérielle.
- Thermorégulation
Biochimie
ECTS
6 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
51h
Heures d'enseignement
Biochimie - CM, Biochimie - TD, Biochimie - TP
Lors des cours et des TD, les étudiants travailleront sur les notions suivantes :
- Structure, propriété et fonction des molécules biologiques (protéines, glucides, lipides, acides nucléiques)
- Enzymologie (catalyse et cinétique enzymatiques, inhibiteurs compétitifs, non compétitifs et incompétitifs, allostérie)
- Bioénergétique (variation d’énergie libre, potentiels d’oxydo-réduction, couplages énergétiques)
- Métabolisme énergétique (glycolyse et fermentations, oxydation des acides gras, cycle de Krebs, chaîne respiratoire et phosphorylation oxydative)
En TP, les étudiants mesureront l’activité d’une enzyme (détermination KM et Vmax), utiliseront une technique de séparation des protéines (colonne de chromatographie) et réaliseront une électrophorèse d’ADN. En travaux pratiques, les étudiants devront développer leur réflexion et leur autonomie en utilisant les connaissances acquises en cours et en TD pour résoudre un problème scientifique.
Écologie des Populations
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Ecologie des Populations - CM, Ecologie des Populations - TD
Le but de ce cours est d’étudier certains aspects fondamentaux de l'écologie des populations (croissance et extinction) et des interactions entre espèces et leur environnement. Cet enseignement demande un effort sérieux et une réelle motivation pour les statistiques, les équations et les modèles mathématiques.
Les travaux dirigés ont pour objectif 1/d’illustrer l'exemple vu en cours magistral et 22/ s'approprier les concepts et techniques calculatoires en réalisant les exercices proposés.
Chaque support de TD commence en général par l'exemple donné et traité en détail en Cours (avec solution détaillée donnée), de façon à ce que l'étudiant.e puisse comprendre les éléments de Cours par l'exemple; ensuite, des exercices nouveaux (traités en présentiel à la fin des TDs mais sans que la solution soit fournie sous forme de document mis à disposition sur eLearn!) permettent à l'étudiant.e de comprendre et trouver la solution par la réflexion personnelle et l'adaptation (sachant qu’il y a plusieurs alternatives possibles en général). Sous le contrôle de l'enseignant qui aide à la réflexion et oriente, les TDs sont l'occasion de travailler, apprendre, comprendre, et progresser seul, en binôme ou en petits groupes. Plusieurs approches pouvant exister et les échanges entre étudiant.e.s sont fortement encouragés de manière à partager les différentes options de résolution des exercices. L’approche pédagogique encourage véritablement la réflexion personnelle et le développement de l’expertise nécessaire au futur professionnel, tout en décourageant les tendances au copier-coller et au plagiat.
Biologie Moléculaire
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biologie Moléculaire - CM, Biologie Moléculaire - TD
Lors des cours, les étudiants découvriront les notions suivantes :
- Organisation de l’information génétique chez les procaryotes et les eucaryotes (structure des chromosomes et des plasmides)
- Réplication de l’ADN (structure et fonctionnement de la fourche de réplication)
- Transcription (promoteurs, élongation, terminateurs, ARN polymérases)
- Traduction (ribosomes, ARMm, ARNt, code génétique, maturation des ARNm)
- Régulation de l’expression des gènes (opéron lactose, répression catabolique, atténuation, les différents niveaux de régulation eucaryotes)
- Techniques de Biologie moléculaire : électrophorèse, enzymes de restriction, plasmide recombiné, Southern blot, Northern blot, Western blot, Séquençage, PCR …
Lors des TD, les étudiants pourront utiliser ces connaissances pour analyser des résultats expérimentaux issus d’articles scientifiques. Ils devront également être de choisir la technique de biologie moléculaire adaptée en fonction du problème posé.
Biostatistiques 2
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Biostatistiques 2 - CM, Biostatistiques 2 - TD
Objectif :
Acquérir des notions de probabilités conditionnelles et maîtriser la statistique descriptive et inférentielle appliquée à un ou deux échantillons.
Contenu :
Probabilités
- Probabilités conditionnelles
- Indépendance
- Loi de Bayes
Statistique descriptive bivariée à l’aide d’un tableur et d’un logiciel statistique (logiciel R)
- Tableaux de contingence
- Représentations graphiques bivariées
- Calcul d’indicateurs numériques pour différentes sous-parties d’un jeu de données
Statistique inférentielle
- Tests de comparaison d’une valeur observée à une valeur théorique (moyenne, variance, proportion)
- Test d’adéquation à la loi normale
- Intervalles de confiances d’une différence de moyennes et de proportions
- Tests de comparaison de deux valeurs observées (moyenne, variance, proportion)
Ce cours combine des cours magistraux, des exercices théoriques et des mises en application sur ordinateur.
Anglais L2 - S3
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais L2 - S3 - TD
The students are organised in level-groups following the results of a placement test in L1. If at the end of the first year their average score of both semesters equals 15 or above, they will be promoted to the next level group
In this course, the students will practice the four main skills for communication with a focus on written expression, and will review some basic grammar concepts. The students will work with up-to-date materials from journals and magazines, internet articles, videos, etc. Students will improve their comprehension, fluency, and confidence in spoken and written English through individual practice and regular participation in pair and group work, oral activities, reading and listening comprehension exercises, and general classwork.
Class activities will include listening, reading, writing, and informal/formal speaking to understand, learn, remember, and explain information from both written and spoken materials. Also,to help you improve your grammar and writing, we will have online grammar practice with mini-reviews when necessary.
You will have:
- Classwork, pop quizzes and online homework that are part of the grade,
- A midterm exam level-based on the grammar and vocabulary studied in class,
- A final exam common to all levels to check your progression. The final will focus on written expression
Hydrologie
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Géologie 3 - CM, Géologie 3 - TD, Géologie 3 - TP
L’objectif est d’acquérir des connaissances dans les domaines du métamorphisme et de la géodynamique interne, champs complémentaires de ceux développés dans l’UE Géologie 2 de L1 S2 (phénomène sédimentaire et magmatisme), afin de développer une vision globale de la dynamique du globe. Une sortie sur le terrain permet d’appréhender la réalité de phénomènes géologiques étudiés précédemment (L1) ou abordés durant cette UE.
Principaux thèmes abordés :
- Déformation et métamorphisme de la lithosphère
- Données pétrogénétiques et structurales (macro et microstructures), paragenèses, faciès métamorphiques, chemins P-T
- Séries métamorphiques, métamorphisme de contact, métamorphisme régional
- Mouvements tectoniques et géodynamique interne, modèle de la convection mantellique
- Chaleur interne, conduction, convection, subduction, collision, accrétion océanique
Sols et Agronomie
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Géologie 4 - CM, Géologie 4 - TD, Géologie 4 - TP
L’objectif est de réinvestir les compétences dans les domaines sédimentaires, magmatiques, métamorphiques et géodynamiques acquises en partie dans les UE précédentes de géologie (Géologie 1, 2 et 3) pour comprendre l’évolution de grands ensembles structuraux dont on étudiera quelques exemples (bassin sédimentaire, chaîne de montagne…).
Une sortie sur le terrain sera l’occasion d’établir une reconstitution de l’histoire régionale à partir d’observations réelles (géomorphologiques, pétrologiques, structurales…).
Perception Sensorielle
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Perception Sensorielle - CM, Perception Sensorielle - TD
Perception et communication chimique, sonore, tactile et visuelle chez les animaux terrestres.
Emission des signaux sensoriels et mécanismes de perception. Réponses comportementales.
Chimie des solutions 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Chimie des solutions 2 - CM, Chimie des solutions 2 - TD
Contenu de l’enseignement
Le contenu de l’enseignement se répartit sur les deux premières années universitaires (L1PC et L2PC).
Le contenu du programme de L2PC est le suivant :
- Les équilibres de complexation ; dosages complexométriques ;
- Les équilibres de précipitation – dissolution ; dosages par précipitation ;
- Les diagrammes Potentiel – pH (diagrammes E-pH de Pourbaix) ;
- Application aux études de corrosion uniforme – domaines de corrosion, de passivation ou d’immunité ;
- La potentiométrie à courant nul.
Informatique et certification PIX
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
13,5h
Heures d'enseignement
Informatique et certification PIX - CM, Informatique et certification PIX - TP
Préparation à la certification PIX, 8 compétences traitées dans les 5 domaines proposés :
- Partager et publier
- Résoudre des problèmes techniques
- Mener une recherche et une veille d'information
- Sécuriser l'environnement numérique
- Protéger les données personnelles et la vie privée
- Adapter les documents à leur finalité
- Traiter des données - Développer des documents textuels
Stage
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Le stage s’effectue généralement lors de l’été précédant l’entrée en L2 Biologie. Il se déroule en France ou à l’étranger, dans une structure d’accueil privée, publique ou parapublique avec laquelle une convention de stage est signée.
L’étudiant effectue l’ensemble des démarches, depuis la recherche de l’entreprise d’accueil jusqu’à la signature de la convention. Il est immergé dans le monde professionnel pendant 2 à 8 semaines et peut établir ses premiers contacts professionnels.
Ethologie 1
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Ethologie 1 - CM, Ethologie 1 - TD
Le cours explore l'étude scientifique du comportement animal, en mettant l'accent sur les différents types de questions pouvant être traitées, ainsi que la démarche théorique et expérimentale permettant d'y répondre. Au-delà du comportement animal, il met en avant des méthodes scientifiques partagées par de nombreuses disciplines. Les travaux dirigés consistent à construire un programme informatique simulant le comportement collectif d'animaux sociaux.
Stratégies de Reproduction
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Stratégies de Reproduction - CM, Stratégies de Reproduction - TD
L'enseignement est structuré autour des questions principales liées à l'évolution des stratégies de reproduction chez les animaux. Chaque question est traitée du point de vue proximal (physiologie) et ultime (évolutif), et une synthèse est proposée. Les concepts sont illustrés avec des document tirés directement de la littérature scientifique primaire, que les étudiant.e.s apprennent à commenter, en participant en cours (sinon, les enseignants le font eux-mêmes, mais c'est plus ennuyeux).
UE Transverse
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Plus d'informations à la page suivante : https://formation.univ-pau.fr/fr/scolarite/ue-transverses.html
Génétique
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
51h
Heures d'enseignement
Génétique - CM, Génétique - TD, Génétique - TP
- La génétique mendélienne et ses extensions (dominance/récessivité́, allèles multiples, épistasie ...)
- Théorie chromosomique de l'hérédité́ (hérédité́ liée au sexe)
- Liaison génétique et cartographie
- Analyse de tétrades (liaison au centromère, cartographie, conversion génique)
- Structure fine du gène (complémentation, recombinaison et cartographie intragéniques)
- Mutations, aberrations chromosomiques
- Génétique du développement (gènes embryonnaires précoces et tardifs, mise en place des axes embryonnaires et du plan d'organisation, gènes homéotiques)
Microbiologie
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Microbiologie - CM, Microbiologie - TD, Microbiologie - TP
Objectif :
Connaître la systématique des bactéries et des champignons, les modes de nutrition et de reproduction des microorganismes et le rôle des microorganismes dans le fonctionnement des écosystèmes.
Contenu :
Bactériologie
- Biodiversité bactérienne
- Nutrition et métabolismes bactériens
- Croissance et contrôle des bactéries
- Bases d’écologie microbienne
- Génétique bactérienne : conjugaison, transformation, transduction
Mycologie
- Classification des champignons (myxomycotines, eumycotines, …)
- Modes de vie et de reproduction des champignons
- Relations trophiques (décomposeurs, symbiotes, pathogènes…)
Physiologie Végétale
ECTS
6 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
51h
Heures d'enseignement
Physiologie Végétale - CM, Physiologie Végétale - TD, Physiologie Végétale - TP
Le but est d’acquérir les connaissances de base concernant la nutrition, la croissance et le développement des végétaux (Trachéophytes principalement), tout en développant ses capacités d’analyse, son sens critique et la rigueur de son raisonnement.
Principaux thèmes abordés :
- Nutrition hydrique : rôles de l’eau, circulation de l’eau chez les Trachéophytes, adaptations physiologiques (sécheresse …)
- Nutrition minérale : mécanismes d’absorption et rôles des principaux éléments minéraux, assimilation et métabolisme de l’azote, symbiose Rhizobium-Légumineuse.
- Nutrition carbonée : photosynthèse en C3, en C4 et métabolisme CAM ; Photorespiration.
- Les phytohormones et leurs rôles dans la croissance et le développement
Les TD sont l’occasion d’une analyse rigoureuse et raisonnée d’observations pour établir les caractéristiques de processus physiologiques. Les TP permettent la mise en œuvre d’une démarche expérimentale : suivi d’un protocole, puis relevé, analyse et critique des résultats, et leur mise en perspective dans le cadre théorique étudié en cours magistral et en TD.
Biologie Cellulaire 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biologie Cellulaire 2 - CM, Biologie Cellulaire 2 - TD
L’UE Biologie cellulaire 2, décrit les différentes fonctions cellulaires (adressage cellulaire, signalisation cellulaires, régulation du cycle cellulaire, apoptose…) et l’interaction entre ces fonctions. Elle aborde aussi les mécanismes de dérégulation des processus responsables de pathologies telle que la carcinogénèse.
Pour asseoir des connaissances théoriques abordées en cours, une partie des TD se fera par l’analyse et l’interprétation de résultats issus de publications scientifiques et l’autre partie de TD sera consacrée à des présentations orales (en binômes ou trinômes) de travaux de recherche bibliographique ou d’une analyse d’article
Traitements statistiques des données 1
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Traitements statistiques des données 1 - TD
Objectif :
Application des notions de base de la statistique descriptive (graphes, tableaux et indicateurs numériques) et inférentielle (intervalles de confiance, tests d’hypothèses) afin de résoudre un problème statistique.
Contenu :
Les notions de statistique descriptive et inférentielle dans les UE précédentes sont mises en application à l’aide d’un tableur et du logiciel R pour le traitement statistique de jeux de données biologiques.
L’intégralité de l’enseignement se fait dans une approche par projet, en groupes de 5-6 étudiants. Ce travail abouti à la rédaction collective d’un rapport.
PEP'S 2
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
12h
Cet enseignement non disciplinaire a pour principal objectif de rendre l’étudiant acteur de son orientation. Il oblige l’étudiant à s’interroger sur son avenir professionnel, l’incite à découvrir les réalités professionnelles en lui transmettant une méthode de recherche et de traitement de l’information, et d’aide à la décision afin de construire un projet d’études et de définir un plan d’action.
Anglais L2 - S4
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais L2 - S4 - TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce quatrième semestre l’accent sera mis sur la compréhension de l’oral à partir de documents de vulgarisation scientifique, et expression orale (phonétique et accentuation de mots)
Ecologie Appliquée
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
24h
Heures d'enseignement
Ecologie Appliquée - TD, Ecologie Appliquée - TP
L'enseignement est structuré autour de 4 sorties de terrain. Chaque sortie porte sur un milieu et un groupe taxonomique différent (algues et invertébrés benthiques de l'estran rocheux, oiseaux des barthes, poissons de ruisseaux, flore dans une mosaïque d'habitat), et est animée par des intervenants employés dans différentes structures (université, Conservatoire d'Espaces Naturels, Centre Permanent d'Initiative pour l'Environnement, IFREMER, INRAE). Avant chaque sortie, l'intervenant présente le contexte et les méthodes qui seront utilisées. A l'issue de chaque sortie, les binômes d'étudiant.e.s rédigent un rapport rendant compte du contexte, des méthodes appliquées et des résultats obtenus. La note de l'UE est la moyenne des 4 rapports.
Biologie de la Conservation
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Biologie de la Conservation - CM, Biologie de la Conservation - TD
Ce cours d'introduction à la biologie de la conservation/restauration permet de contextualiser/approfondir des notions déjà abordées dans d'autres UE et s'organise de la façon suivante :
- Introduction à la biologie de la conservation
- Biodiversité
- Perte de la biodiversité
- Persistance des populations - Facteurs évolutifs
- Persistance des populations - Facteurs démographiques
- Où et quoi conserver ?
Immunology
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Immunology - CM, Immunology - TD
The language used during this course (lectures, tutorials and evaluations) is English.
This course aims to acquire the fundamental notions of Immunology.
During the lectures, the students will learn the basics of immunology:
- Lymphoid organs, immune cells and molecules.
- Immune response (innate and adaptive)
- Structure, functions, diversity and genetics of antibodies
- Structure, functions, diversity and genetics of MHC
- Immunological techniques
During the tutorials, the students apply these notions by analysis documents (alone or in groups): experimental results or medical cases.
At the end of this course, each group of students will analyze a scientific paper and present it to the class.
Sciences Environnementales
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Sciences Environnementales - CM, Sciences Environnementales - TD
Au croisement de différents champs disciplinaires tels que la chimie, la biologie, les sciences de la Terre ou encore la santé, l’enseignement dispensé dans l’UE Sciences Environnementales aborde des problématiques environnementales liées aux activités humaines. Cet enseignement permet de découvrir l’impact des rejets de contaminants dans l’environnement en lien avec l’urbanisation et les pratiques industrielles, agricoles, d’élevage et de la santé. Les exemples traités concernent des problématiques locales (estuaire de l’Adour, estuaire de la Gironde…) et globale (e.g. réchauffement climatique, cycles géochimiques). Des méthodes permettant de retracer l’évolution historique des activités humaines à travers l’enregistrement dans les sols ou dans des organismes aquatiques sont abordées en regard avec l’évolution des réglementations et des besoins de la société. Le comportement des contaminants dans l’environnement est étudié en fonction de leurs propriétés physico-chimiques. Les notions de concentration dans le milieu et les organismes, de transformations abiotique et biotique et de transfert entre les différents compartiments de l’environnement permettent de quantifier les sources, d’estimer l’impact des polluants sur l’environnement et de communiquer sur les risques potentiels.
Chimie organique 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
47h
Heures d'enseignement
Chimie organique 2 - CM, Chimie organique 2 - TD, Chimie organique 2 - TP
Partie théorique
Passage en revue des réactions typiques des composés selon leur fonction organique : alcène, alcool, amines, dérivés carbonyles, acides et dérivés.
Appliquer ces réactions à des synthèses multi-étapes de composés organiques divers : arôme, pesticide, hormones, médicaments… etc
Partie expérimentale : travaux pratiques
Approfondissement des techniques de synthèse classiques en laboratoire tel : montage à reflux, distillation, hydro distillation, recristallisation, extraction, piège à gaz.
Approfondissement des techniques de caractérisations : ccm, Tf, IR, nD.
Mise en œuvre de techniques séparatives analytiques plus précises : analyse CPG et HPLC.
Enseignement Scientifique en école
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
4h
Heures d'enseignement
Enseignement Scientifique en école - TD
L’objectif de cette UE est de découvrir le monde de l’enseignement au cours d’un stage de 6 demi-journées avec un(e) enseignant(e) au sein d’une classe de l’enseignement primaire ou secondaire.
Chaque étudiant devra trouver un enseignant tuteur, faire valider leur convention de stage, observer une ou plusieurs séances en classe, réaliser une progression en lien avec les programmes de Sciences de l’Éducation nationale en collaboration avec leur enseignant tuteur et enfin animer une ou plusieurs séances en classe (en présence de leur enseignant tuteur).
À la suite de ce stage, l’étudiant remettra un rapport de stage et effectuera une soutenance orale.
Stage
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Le stage s’effectue entre janvier et mai, pour les étudiants ayant déjà validé des UE du semestre 4. Il se déroule en France ou à l’étranger, dans une structure d’accueil privée, publique ou parapublique avec laquelle une convention de stage est signée.
L’étudiant effectue l’ensemble des démarches, depuis la recherche de l’entreprise d’accueil jusqu’à la signature de la convention. Il est immergé dans le monde professionnel pendant 2 à 8 semaines et peut établir ses premiers contacts professionnels.
Ethologie 2
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
10,5h
Heures d'enseignement
TD
Cet enseignement est entièrement basé sur des projets d'étudiant.e.s. En concertation avec l'enseignant, des groupes d'étudiant.e.s choisissent un thème d'étude comportementale. Ils réalisent ensuite des observations en suivant les règles méthodologiques de l'éthologie, et rendent-compte de leur travail dans un rapport dont le format suit celui d'articles scientifiques.
UET Changements Globaux
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Physiologie animale 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Physiologie animale 2 - CM, Physiologie animale 2 - TD, Physiologie animale 2 - TP
- Systèmes d’échanges gazeux chez les animaux terrestres et aquatiques, physiologie respiratoire chez les mammifères
- Physiologie du système digestif chez les mammifères
- Mécanismes d’osmorégulation chez les animaux terrestres et aquatiques
- Systèmes excréteurs chez les animaux, physiologie rénale
Diversité génétique
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Diversité génétique - CM, Diversité génétique - TD, Diversité génétique - TP
Les marqueurs moléculaires polymorphes (Isoenzymes, RFLP, RAPD, VNTR, SNP, ...) et leurs domaines d'application (diagnostic, génotypage, systématique, phylogénie, ...). Les méthodes de mesure de l'expression des gênes au niveau transcriptionnel et au niveau traductionnel. En TP, l’étudiant mettra en œuvre l’ensemble des étapes expérimentales permettant de révéler la biodiversité génétique de biofilms microbiens, depuis l’extraction d’ADN et l’amplification de gènes ribosomiques par PCR (au laboratoire), jusqu’à l’analyse phylogénétique des espèces microbiennes identifiées (en salle informatique).
Génétique moléculaire
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Génétique moléculaire - CM, Génétique moléculaire - TD
1- Mutabilité de l'ADN : Organisation et variabilité des génomes, altérations de l'ADN
2- Mécanismes de réparation dès lésions de l'ADN : Réparations directes, réparations par excision, tolérance aux lésions
3- Recombinaison génétique : Recombinaison homologue, site spécifique, illégitime et VDJ
4- Transposition : Eléments transposables procaryotes, éléments transposables eucaryotes, mécanismes de transposition, impact des éléments transposables sur les génomes
Structure et fonctionnement des écosystèmes
ECTS
6 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
51h
Heures d'enseignement
Structure et fonctionnement des écosystèmes - CM, Structure et fonctionnement des écosystèmes - TD, Structure et fonctionnement des écosystèmes - TP
Les cours, TD et TP présentent de manière complémentaire les outils scientifiques (concepts, méthodes d'échantillonnage, indicateurs, modèles théoriques) utilisés dans l'étude de la biodiversité :
- Echantillonnage et quantification des différents aspects de la biodiversité
- Processus écologiques générant, maintenant ou altérant la biodiversité
- Lien entre biodiversité, fonctionnement et stabilité des écosystèmes
Systèmes évolution des végétaux
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Systèmes évolution des végétaux - CM, Systèmes évolution des végétaux - TD, Systèmes évolution des végétaux - TP
Connaissances sur l’histoire évolutive des végétaux et la place des grands groupes végétaux dans la biodiversité.
Connaissances sur les principes et les méthodes de la systématique végétale (caractères taxonomiques et hiérarchie botanique ; espèces et spéciation ; construction d’une phylogénie et d’une classification ; nomenclature botanique ; établissement des clés d’identification…).
Connaissances sur la classification actuelle des Embryophytes (Marchantiophytes, Anthocérophytes, Bryales, Sphagnales, Trachéophytes à spores, Pinophytes et Magnoliophytes).
Acquisition de quelques principes méthodologiques des analyses de flore et de végétation (méthodes qualitatives : répartition horizontale et verticale de la flore et de la végétation, groupes écologiques, types ou formes biologiques…).
Biostatistique 3
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biostatistique 3 - CM, Biostatistique 3 - TD
Contenu
- Plans d’expérimentation et d’échantillonnage, indépendance des données.
- Manipuler un jeu de données : tri, calcul de nouvelles variables, sous-parties d’un jeu de données.
- Statistique descriptive pour des échantillons uni- et bivariés : Représentations graphiques, paramètres de tendance centrale et de dispersion, tableaux de contingence.
- Estimation ponctuelle et par intervalle de confiance de paramètres.
- Principe des tests statistiques
- Comparaison d’un paramètre observé à une valeur théorique
- Comparaison de plusieurs échantillons (moyenne, variance, proportions) pour des données indépendantes ou appariées (tests de comparaison, analyse de variance à un et à deux facteurs).
- Corrélation et régression linéaire simple et multiple.
Anglais L3 - S5
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
18h
Heures d'enseignement
Anglais L3 - S5 - TD
This course will focus in the first part of the semester on scientific and technical skills related to the student’s field of study. The second part of the semester will deal with work-related items such as CV writing and job interviews.
UE Transverse
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Plus d'informations à la page suivante : https://formation.univ-pau.fr/fr/scolarite/ue-transverses.html
Biologie Evolutive 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biologie Evolutive - CM, Biologie Evolutive - TD, Biologie Evolutive - TP
Cette unité d'enseignement permet d'appréhender les fondamentaux en biologie évolutive, incluant :
- Les principales forces évolutives et leurs éventuelles conséquences adaptatives.
- L'implication adaptative à des échelles infra-individuelles et populationnelles.
- La notion d'espèce ainsi que les modalités de spéciations associées.
Biologie Expérimentale
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
12h
Heures d'enseignement
Biologie Expérimentale - TD
En binôme, les étudiants choisissent une question de recherche sur laquelle ils veulent travailler. A partir de recherches bibliographiques, ils construisent un argumentaire sur l'intérêt de cette question. Ils établissent ensuite un protocole expérimental visant à répondre à cette question. L'argumentaire et le protocole sont enfin présentés dans un document écrit et une soutenance orale. Trois séances de cours donnent quelques outils pour les différentes étapes (argumentaire, protocole, compte-rendu), et les étudiants sont encouragés à solliciter l'aide de personnes ressources pour avancer dans leur projet.
Génétique des Populations
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Génétique des Populations - CM, Génétique des Populations - TD, Génétique des Populations - TP
Cette UE est une introduction à l’analyse génétique des populations. Son objectif est de présenter aux étudiants les termes, les principes, les concepts de la génétique des populations ainsi que les méthodes utilisées et leurs domaines d’application. Les cours magistraux seront illustres par des TD et des TP. Les TD porteront sur des analyses d’articles scientifiques en groupe de 3 ou 4 étudiants.
Ces analyses seront discutées lors de présentations orales à la lumière des notions théoriques abordées en cours. Quant aux TP, ils porteront sur la mise en forme de données génotypiques puis à une initiation a analyse de ces données à l’aide de logiciels de génétique des populations.
Principaux thèmes abordés :
‒ Modèle de Hardy-Weinberg (principes de base et utilisation)
‒ Comment mesurer la variabilité génétique
‒ Outils d’analyse de la variabilité génétique (marqueurs génétiques et outils informatiques)
Travaux de recherche encadrés
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
46,5h
Heures d'enseignement
Travaux de recherche encadrés - TD
Ce travail de groupe porte sur la recherche, l’analyse, et la restitution d'une synthèse bibliographique. Chaque groupe se verra attribué une thématique de recherche (champs disciplinaires multiples : génétique des populations, écotoxicologie, écologie évolutive, écologie générale, génétique moléculaire, etc.) qu'il faudra affiner et dont il faudra faire l'étude bibliographique. Chaque étudiant devra analyser un article scientifique et il faudra faire émerger collectivement le dénominateur commun de tous les articles sélectionnés (principes biologiques fondamentaux, méthodologie, conclusion, perspectives, etc.) dans un travail approfondi, mais néanmoins synthétique.
Ce travail sera ponctuellement supervisé, à la demande des étudiants, par l’enseignant responsable de la discipline choisie, mais les modalités d'organisation tout au long du semestre devront être définies par les étudiants de chacun des groupes, incluant des recherches en dehors du temps universitaire (recherches bibliographiques, concertation collective, rédaction). Les restitutions orales et écrites se feront partiellement en anglais, ce qui est un élément pédagogique faisant intégralement partie de l'UE.
Traitement statistiques des données 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Traitement statistiques des données 2 - TD, Traitement statistiques des données 2 - TP
Partie 1 : Analyse en Composantes Principales et Analyse en Composante Factorielle.
Partie 2 : Cette UE s’appuie ensuite sur les notions théoriques de statistique descriptive et inférentielle déjà acquises. Celles-ci sont mises en application à l’aide des logiciels R et Excel pour le traitement statistique d’un jeu de données biologiques réel issu d’une commande externe.
PEP'S 3
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
12h
Cet enseignement non disciplinaire a pour principal objectif d’accompagner l’étudiant dans son (ses) choix de poursuite d’études après la licence, ou le cas échéant à préparer son insertion dans le monde professionnel. Il a aussi pour but d’aider l’étudiant à formaliser ses candidatures aux masters ou aux écoles d’ingénieurs qu’il souhaite rejoindre.
Stage
ECTS
7 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Le stage s’effectue de début mars à fin mai (8 semaines minimum) mais peut s’étendre jusqu’à fin août (24 semaines). Il se déroule en France ou à l’étranger, dans une structure d’accueil privée, publique ou parapublique avec laquelle une convention de stage est signée.
L’étudiant est mis en situation de recherche d’emploi : il effectue l’ensemble des démarches, depuis la recherche de l’entreprise d’accueil jusqu’à la signature de la convention. Il est immergé dans le monde professionnel de 8 à 24 semaines et peut établir ses premiers contacts professionnels.
Perception Sensorielle en milieu aquatique
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Perception Sensorielle en milieu aquatique - CM, Perception Sensorielle en milieu aquatique - TD
Nous verrons dans ce cours comment les animaux aquatiques perçoivent leur environnement et comment ils communiquent entre eux. Les communications chimique, sonore, tactile et visuelle seront abordées et pour chaque type de communication, nous verrons comment les animaux aquatiques émettent des signaux sensoriels, les perçoivent et quels sont les réponses comportementales associées.
Virologie
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Virologie - CM, Virologie - TD
L’objectif de ce cours est d’acquérir les bases de la virologie : structure et classification des virus, diversité des cycles de réplication intra-cellulaire, diversité des modes de transmission, diversité des méthodes d’analyse des virus (détection, identification, quantification), lutte antivirale (vaccination et antiviraux.
Ces connaissances seront illustrées par différents exemples de virus lors des séances de travaux dirigés : bactériophages, virus infectant les végétaux, virus infectant les animaux, virus infectant l’espèce humaine.
Anglais L1 - S1
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce premier semestre l’accent sera mis sur la compréhension écrite à partir de documents de vulgarisation scientifique.
Évolution et Diversité
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
CM, TD
Évolution
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Evolution - CM, Evolution - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
De l'origine de la vie jusqu'à aujourd'hui, les êtres vivants ont évolué et se sont grandement diversifiés. Cette UE propose de s'intéresser aux grands concepts et mécanismes de l'évolution, aux grandes théories de l'évolution jusqu'à la caractérisation de la diversité des êtres vivants. Les objectifs de l’EC Evolution sont de donner les clés de compréhension des processus tels que la sélection naturelle de Darwin afin d'appréhender les histoires évolutives des êtres vivants et de comprendre la logique de leur classification proposée dans l’EC Diversité (domaine du vivant : bactérie, archées, eucaryotes-protistes végétaux, fungi, animaux...). Il sera aussi proposé une mise en contexte historique pour comprendre le cheminement de ces concepts et la mise en pratique d'outils pour caractériser et mesurer les traits évolutifs.
Le cours sera divisé en trois partie principales :
- Des repères historiques qui montrent le cheminement des concepts liés aux théories de l’évolution
- Comment montrer qu’il y a évolution, faits, expériences indices qui conduisent aux théories
- Mécanismes, interprétations et explications des processus à l’origine des théories de l’évolution
Diversité
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Diversité - CM, Diversité - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Dans la prolongation de l’EC Evolution, cette UE propose d’aborder la diversité résultant des processus évolutifs. Les principes et l’histoire de la classification du vivant seront abordés afin de comprendre le cadre épistémologique permettant d’appréhender la diversité. Différentes méthodes de la systématique phylogénétique seront explorées et comparées lors des travaux dirigés. Dans un second temps on donnera un aperçu de la diversité du vivant au cours des temps géologiques depuis l’origine du vivant jusqu’aux grand domaines actuels. Des exemples d’Eucaryotes unicellulaires notamment parasites ou ayant une importance écologique particulière seront abordés. Enfin cette UE constituera par ailleurs une introduction aux UE du second semestre : Microbiologie, Biologie végétale et Biologie animale.
Chapitre 1 – Classer le vivant
Chapitre 2 – Histoire de la vie sur Terre
Chapitre 3 – Les grands ensembles du vivant
Biologie cellulaire
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biologie cellulaire - CM, Biologie cellulaire - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE a pour but de présenter les bases de l’organisation des cellules, structures fondamentales du vivant.
- Définition du vivant et importance de la cellule. Méthodes microscopiques. Génome, expression génique, protéines
- Cellule procaryote : définitions, morphologies, génome, paroi cellulaire, composants externes de la paroi cellulaire, membrane plasmique, cytoplasme
- Cellule eucaryote : caractéristiques et spécialisations de la membrane plasmique, endo et exocytose
- Noyau des cellules eucaryotes : organisation nucléosomique, réplication des chromosomes, transcription chez les eucaryotes
- Reticulum endoplasmique, synthèse et exportation des protéines et des lipides par le RE, transport vésiculaire, structure et fonction de l'appareil de Golgi, lysosomes
- Organites semi-autonomes : structure et fonction des mitochondries et des chloroplastes
- Cytosquelette
- Cycles cellulaires eucaryotes (mitotique et méiotique)
Macromolécules
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Macromolécules - CM, Macromolécules - TD
Structures, propriétés et rôles biologiques des aminoacides, peptides et protéines, des oses et polyosides, des lipides, des nucléotides et acides nucléiques.
Chimie organique et des solutions pour SDV
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Chimie des solutions 1 pour SDV
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD
Chimie organique structure des molécules pour SDV
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD
Mathématiques générales
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Mathématiques générales 1 - CM, Mathématiques générales 1 - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Toutes les notions traitées dans ce cours sont abordées dans un contexte pratique, tiré de problèmes de la physique de la chimie et de modèles de la biologie. Cette approche dit permettre à l’étudiant de comprendre comment les mathématiques qui peuvent paraître théoriques sont en réalité un outil primordial pour l’ensemble des sciences et pour la biologie en particulier. Les thèmes abordés sont les suivants :
- Pourcentage, accroissement, proportionnalité et règle de trois
- Les suites numériques
- Résolution de systèmes d’équations
- Les fonctions et notion de dérivée
- Erreurs de mesure et incertitudes (moyenne, variance, écart-type, régression linéaire et moindre carrés)
- Intégrales et primitives
- Équations différentielles (chute d’un corps, modèles démographiques, modèles proie-prédateurs…)
Méthodologie du travail universitaire
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE aidera les primo-entrants à l’université à prendre leurs repères dans leur formation afin de réussir au mieux leur licence. Des méthodes élémentaires indispensables au travail d’un biologiste sont travaillées : microscopie, conversions d’unités de mesure, utilisation graphique de données expérimentales.
PIX
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
18h
Heures d'enseignement
PIX - TD
La formation vise la maîtrise des compétences de l'usage des outils numériques et bureautiques, d'internet et de travail collaboratif, indispensables aujourd’hui pour la vie étudiante et l’activité professionnelle. En parallèle, cette formation prépare à la certification PIX.
La formation s’appuie sur un cours en ligne sur la plateforme Elearn avec des tutoriels, exercices avec correction, tests de positionnements sur PIX et forum d’échanges.
Les épreuves évalueront les connaissances mais également les savoir-faire et la capacité à identifier les enjeux du numérique.
Contenus des modules :
|
Module Mener une recherche et une veille informationnelle |
· Retrouver et évaluer la source d'une information ou une image · Formuler une requête élaborée dans un moteur de recherche · Connaître Wikipedia et son processus de publication · Interpréter la présence de publicité dans les résultats d'un moteur de recherche |
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Module Traiter les données |
· Trier et filtrer des données dans une feuille de calcul · Faire des calculs dans une feuille de calcul · Saisir, intégrer et manipuler des données dans un classeur |
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Module Développer les documents textuels |
· Structurer et mettre en forme un document en tenant compte des règles d’accessibilité · Appliquer et modifier les styles · Insérer des objets (image, tableau, graphique, …) et le positionner de façon pertinente · Insérer des tables des matières et d’illustrations |
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Module Sécuriser l’environnement numérique |
· Maîtriser son identité numérique à travers le choix d'un identifiant (pseudo, adresse électronique, ...) · Connaître le principe et la pratique du déréférencement · Connaître des outils et techniques web pour mener à bien un projet (modes de financement participatif, visibilité, SEO) · Identifier les traces en ligne constitutives de l'e-réputation |
|
Module Protéger les données et la vie privée |
· Mettre en œuvre des stratégies de protection de sa vie privée et de ses données personnelles et respecter celles des autres · Évaluer la pertinence d'une collecte de données par un service en ligne et en comprendre les finalités |
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Module Protéger la santé, le bien-être et l’environnement |
· Connaître l'impact de la lumière des écrans sur le sommeil · Connaître l'impact environnemental lié aux usages numériques · Maîtriser la consommation d'énergie de ses appareils numériques · Adapter ses pratiques en ligne pour limiter leur impact environnemental |
Roches et Chronologie
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Roches et Chronologie - CM, Roches et Chronologie - TD, Roches et Chronologie - TP
L’objectif de l’UE est d’introduire plusieurs notions de base sur le calendrier géologique, les roches, les minéraux et les fossiles :
- La mesure du temps, 4ème dimension des objets géologiques, est discutée à partir des principes de la chronologie relative ;
- Les notions de minéraux et de cristaux sont présentées ;
- Ces minéraux sont les constituants des différents types de roches (magmatiques, métamorphiques, sédimentaires) dont la composition et les conditions de formation devront être comprises ;
- Les principaux fossiles, marqueurs stratigraphiques, sont également décrits.
L’UE est organisée comme suit :
- Le temps en géologie et la chronologie relative – (C : 3h – TD : 3h)
- Minéraux, roches magmatiques et métamorphiques : définitions et description macroscopique – (C : 6h – TP : 10h30)
- Roches sédimentaires, sédimentologie : définitions et description macroscopique – (C: 4h30 - TP: 4h30)
- Paléontologie – (C : 3h – TP : 3h)
Introduction à la physique générale pour SDV
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Introduction à la physique générale pour SDV - CM, Introduction à la physique générale pour SDV - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Optique géométrique :
Lumière, vue & vision, nature et vitesse de la lumière, le spectre lumineux.
Réfraction : indice de réfraction et loi de Descartes.
Formation des images : système optique, objet & image, foyers optiques.
Dioptres : relation dans un dioptre sphérique, construction d’une image à travers un dioptre sphérique, dioptres plans.
Lentilles minces, relation de conjugaison, foyers principaux objet et image, construction d’une image, grandissements transversal et angulaire, lames à faces parallèles, défauts des lentilles, association de deux lentilles minces.
Miroirs, relation de conjugaison, construction d’une image.
Instruments d’optique : l’œil, la loupe & le microscope.
Mécanique des fluides :
État fluide.
Hydrostatique : force & pression, pression dans un fluide, forces de pression sur une paroi, le théorème d’Archimède.
Effets physiologiques de la pression : solubilité des gaz dans un liquide, pressions partielles et physiologie, toxicité des gaz, limites humaines.
Notion de dynamique des fluides : cisaillement, viscosité et turbulence, l’hémodynamique.
Introduction à la chimie générale pour SDV
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Introduction à la chimie générale pour SDV - CM, Introduction à la chimie générale pour SDV - TD
- Mesures et moles
- La réaction chimique
Écologie et Écosystèmes
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Ecologie et Ecosystèmes - CM, Ecologie et Ecosystèmes - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
L’écologie est aujourd’hui au centre de réflexions globales et de prises de conscience sur l’évolution des sociétés modernes, des comportements individuels et du fonctionnement de notre planète. Cette UE présente les concepts d’écologie sur la structure de la biosphère et de son fonctionnement. Ses différentes composantes, populations et écosystèmes sont abordés et caractérisés. Enfin à la lumière des aspects fonctionnels de notre environnement, un décryptage des enjeux de l’écologie moderne est proposé afin d’appréhender la place de l’Homme et de l’impact de ses activités.
Le cours sera divisé en trois parties principales :
- Les interactions de l’individu avec son environnement, notion de facteur écologie
- Structure et fonctionnement de l’écosystème, notion de flux et de cycles biogéochimiques
- Ecologie de la population, structuration, dynamique et interactions
Biologie végétale 1
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biologie végétale 1 - CM, Biologie végétale 1 - TD, Biologie végétale 1 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Après un rappel sur l’évolution des végétaux en relation avec les contraintes exercées par le milieu, la diversité et la classification des végétaux sans fleurs (des algues jusqu’aux gymnospermes) seront décrites, avec une attention particulière sur les structures et les modes de reproduction. La diversité et la biologie des champignons seront également abordées.
Biologie animale 1
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
36h
Heures d'enseignement
CM, TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE traitera de l’ensemble du monde animal, et de sa diversité. Elle s’appuie notamment sur une description des caractéristiques propres aux grands groupes zoologiques aussi bien « invertébrés » que Vertébrés. L’étude des différents plans d’organisation sera par ailleurs complétée par des données d’ordre écologique liées au mode de vie des organismes modèles étudiés. Enfin une introduction à la biologie du développement permettra d’aborder la mise en place du plan d’organisation lors du développement embryonnaire.
Introduction à la zoologie et principes du développement embryonnaire
CHAP I- Les Métazoaires non-bilatériens:
CHAP II- Les Spiraliens
CHAP III - Les Ecdysozoaires et Euarthropodes
CHAP IV - Les Deutérostomiens : Echniodermes, Chordés
CHAP V - Les Vertébrés
Microbiologie 1
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
34,5h
Heures d'enseignement
Microbiologie - CM, Microbiologie - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
La microbiologie est une discipline qui comprend des domaines d’étude variés que ce soit en santé, en industrie ou en écologie, et s’intéresse à de nombreux organismes et entités biologiques (virus, bactéries, champignons…).
Une introduction générale permettra d’appréhender l’étendue de la discipline, de la découverte des microorganismes aux domaines de recherche actuels. Puis l’accent sera mis sur le monde bactérien. Les bactéries et l’Homme sont indissociables, beaucoup nous protègent, certaines sont pathogènes alors que d’autres nous sont très utiles. L’objectif de cette UE est d’apporter les connaissances nécessaires, de l’organisation de la cellule à la multiplication bactérienne, pour comprendre comment nous les étudions, les utilisons et les contrôlons.
Le cours est organisé en 5 chapitres :
I- Introduction à la Microbiologie
II- La Microscopie
III- La Cellule Bactérienne
IV- La Croissance Bactérienne
V- Le Contrôle des Microorganismes
Anglais L1 - S2
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce second semestre l’accent sera mis sur la compréhension écrite à partir de documents de vulgarisation scientifique et l’expression écrite.
Il s’agira d’approfondir les connaissances en langue anglaise tout en continuant à développer une langue à dominante scientifique au sens large. Les compétences grammaticales et le vocabulaire continueront à être approfondis et enrichis, essentiellement à partir de documents écrits. On demandera aux étudiants de s’investir tant sur le plan de l’écrit que de l’oral dans un but d’expression la plus personnelle et spontanée possible.
UE Transverse
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Plus d'informations à la page suivante : https://formation.univ-pau.fr/fr/scolarite/ue-transverses.html
PEP'S 1
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
12h
Heures d'enseignement
PEP'S 1
Ce travail s'inscrit dans le cadre de la démarche PEP'S "Projet d’Études et Professionnel dans le Supérieur" qui est un dispositif d'accompagnement à l’orientation sur les 3 années de licence. Le but étant d’aider l’étudiant à construire progressivement un projet d’étude et professionnel de façon fiable et réfléchit et lui permettre de personnaliser et enrichir son parcours d’étude afin faciliter son intégration post licence (poursuite d’étude ou professionnelle).
Le PEP’S 1 est le premier temps de ce travail et permet aux étudiants d’élaborer un pré-projet d’études.
Plan (simplifié) du cours :
- Etape 1 : je découvre les clés de l’orientation et ma formation
- Étape 2 : j’explore les domaines professionnels de ma formation
- Etape 3 : j’explore ma personnalité, mes atouts
- Étape 4 : je combine mes résultats pour rédiger son pré-projet
UE CMI Théâtre 1 : prendre la parole en public
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Théâtre 1 : prendre la parole en public
La pratique théâtrale, ici potentiellement axée majoritairement sur le travail d’improvisations, mais pas exclusivement, présente de multiples perspectives de développement personnel, pouvant être aisément rattachés aux perspectives professionnelles d’étudiants amenés à exercer des fonctions de responsabilité. À se présenter, aussi, tout bonnement, sur le marché du travail. Travail qu’ils auront ensuite à exercer en équipe.
Expression écrite et orale 1
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
9h
Heures d'enseignement
Expression écrite et orale
A l’arrivée à l’université, la grande majorité des étudiants a des lacunes ou des difficultés dans la maîtrise de la langue française.
Le TD d’expression française se déroule en 6 séances de 1h30 en présentiel et est évalué en fin de semestre lors d’une épreuve écrite de 1h30.
L’étudiant pourra revoir et consolider les règles de base de la grammaire, de l’orthographe et de la conjugaison.
L’objectif de ce TD est de revoir toutes les règles qui occasionnent le plus de fautes dans les copies. De plus, une séance abordera les règles de l’écriture du mail.
Structures géologiques
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Structures géologiques - CM, Structures géologiques - TD, TP
Introduction à la géologie structurale à travers la réalisation de coupes et de cartes représentant des structures géologiques simples. L'objectif général est d'acquérir les bases de la lecture et de l'interprétation des cartes géologiques.
Ce cours permet d’aborder la lecture d’une carte topographique, d’une carte géologique, d’une image satellite, et de donner les grands principes de construction d’un profil topographique et d’une coupe géologique simplifiée.
Principes de cartographie – (C 3h - TP 18h)
- positionnement sur le globe ; GPS et projections cartographiques
- lecture des cartes topographiques
- cartes géologiques : méthode des horizontales ; analyse structurale
- réalisation d'une coupe géologique à partir de la carte
Déformation des roches et schéma structural – (C 4h 30 - TD 4h30)
- repérage d'un plan dans l’espace ; monoclinal
- notions sur les failles
- notions sur les plis
- schéma structural et représentation des structures dans un plan horizontal
Étude de cas (TP terrain 6h)
- Sédimentation et tectonique dans une chaîne de montagne : sortie terrain en vallée d'Ossau.
- Réalisation d'une coupe synthétique
- Référence bibliographique principale :
- « Atlas d'initiation aux cartes et aux coupes géologiques » de Sorel et Vergely (ed. Dunod)
Chimie organique et solutions 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Chimie organique fondamentale
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD
Alcanes : structure et propriétés physiques, réactivité chimique, dérivés halogénés des alcanes, réactions radicalaires, de substitution et d’élimination ;
Introduction aux alcènes : structure et propriétés physiques, réactivité et propriétés chimiques, réactions d’additions.
Chimie des Solutions 2 SDV
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD
Anglais L2 - S3
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais L2 - S3 - TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce troisième semestre l’accent sera mis sur la compréhension écrite à partir de documents de vulgarisation scientifique, l’expression écrite et la compréhension de l’oral.
Biologie moléculaire
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biologie moléculaire - CM, Biologie moléculaire - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Enseignement des bases de la biologie moléculaire afin de pouvoir aborder les enseignements plus approfondis de biologie moléculaire mais aussi de génétique et microbiologie moléculaires :
- Nature du génome et du gène ; structure des acides nucléiques, dénaturation, hybridation, nature de l'information génétique, cartographie de restriction
- Réplication ; séquençage, PCR
- Transcription ; régulation : opérons lac et trp ; maturation des ARNm
- Traduction
Cours magistraux et TD.
Biochimie générale
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
71h
Heures d'enseignement
Biochimie générale - CM, Biochimie générale - TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Techniques en biochimie : centrifugation, chromatographie, électrophorèse.
-Interaction ligand-protéine.
-Enzymologie : les enzymes, les coenzymes, cinétique enzymatique.
-Bioénergétique
-Le catabolisme : la glycolyse, le cycle des acides tricarboxyliques, la β-oxydation, la phosphorylation oxydative.
-L’anabolisme : biosynthèse des acides gras, biosynthèse des acides aminés.
Cours magistraux, TD et TP
Biologie végétale 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39,5h
Heures d'enseignement
Biologie végétale 2 - CM, Biologie végétale 2 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Ce cours s’intéresse aux Angiospermes. A travers la description de ce groupe taxonomique il s’agit de découvrir leurs caractéristiques et de mieux comprendre comment les Angiospermes sont devenus rapidement le groupe végétal dominant et le plus divers de la flore sur terre.
Il comprend des cours magistraux et des travaux pratiques couvrant :
- La reproduction sexuée des Angiospermes : développement floral, morphologie florale, double fécondation, graines et fruits, notions d'embryogenèse, germination. Réflexion sur l'acquisition des caractères autorisant la complexité des appareils végétatifs et la conquête du milieu terrestre.
- La multiplication végétative.
- Différenciation cellulaire, notions d'organes et de tissus chez les Trachéophytes. Les méristèmes primaires et secondaires : propriétés et mode de fonctionnement.
- Caractéristiques et rôle des tissus protecteurs, de soutien, parenchymateux, conducteurs et sécréteurs. Organisation anatomique de la racine, de la tige et de la feuille.
Biologie cellulaire
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Biologie cellulaire - CM, Biologie cellulaire - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
La première partie du cours portera sur l’étude du cytosquelette (diversité et fonctions) et le fonctionnement du cycle cellulaire (contrôle et chronologie). Puis, l’apoptose ou la mort cellulaire programmée sera abordée afin de comprendre les mécanismes impliqués. L’ensemble des connaissances acquises lors de ces deux premières parties nous permettra d’aborder l’oncogenèse
Plan du cours :
1- Cytosquelette
1.1 Introduction
1.2 Les microtubules
1.3 Les microfilaments
1.4 Les filaments intermédiaires
1.5 Les drogues perturbant les cytosquelette microtubulaire
1.6 Altérations viro-induites du cytosquelette
1.7 Protéines motrices et microtubules
1.8 Centrosome
2- La division cellulaire
2.1 Phases du cycle cellulaire
2.2 La mitose
2.3 La mitose, ségrégation chromosomique et mouvements intracellulaires
3- Régulation du cycle cellulaire
3.1 Stratégie générale du cycle cellulaire
3.2 Protéines kinases et cyclines
4- Mort cellulaire programmée : l’apoptose
4.1 Introduction
4.2 Apoptose et pathologies humaines
4.3 Mécanismes de l’apoptose
4.4 Activation des procaspases
4.5 Protéines Bcl-2 et les protéines IAP (Inhibiteurs de l’apoptose)
5- Apparition d’un cancer et ses causes
5.1 Introduction
5.2 Types de cancer
5.3 Progression d’un cancer
5.4 Causes d’un cancer
6- Mécanismes moléculaires impliqués dans les cancers
6.1 Gènes impliqués dans l’oncogenèse
6.2 Comment a-t-on identifié ces gènes ?
6.3 Mécanismes moléculaires aboutissant à l’altération de ces gènes
6.4 Fonction de ces gènes
7- HPV et cancer du col utérin
8- Stade d’extension : exemple du cancer du colon
9- Angiogenèse tumorale
9.1 Introduction
9.2 Mécanismes moléculaires de l’angiogenèse
10- Invasion et dissémination tumorales
10.1 Modèles in vitro
10.2 Etudes in vivo
10.3 Mécanismes moléculaires de la diffusion métastatique
10.4 La tissu-spécificité des métastases
11- Phase terminale
12- Immunité anti-tumorale + thérapeutique anti-cancéreuse
12.1 Immunité anti-tumorale
12.2 Thérapeutique anti-cancéreuse
Cours magistraux et TD.
Anatomie Comparée et Développement de Vertébrés
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
37,5h
Heures d'enseignement
Anatomie Comparée et Développement de Vertébrés - CM, Anatomie Comparée et Développement de Vertébrés - TD, Anatomie Comparée et Développement de Vertébrés - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE présente de façon détaillée le groupe zoologique des Vertébrés. Elle permettra d’établir par une approche comparée des différentes grandes fonctions et des spécificités de chaque groupe en lien avec leur histoire évolutive (passage à la prédation, sortie des eaux). L’approche descriptive de la structure des différents appareils sera complétée par l’étude de leur mise en place au cours du développement embryonnaire et leur observation lors des travaux pratiques.
I- Histoire évolutive des Vertébrés
II- La mise en place du plan d’organisation (Chez Xenopus et Gallus)
III- Ostéologie comparée
IV- Le tégument et ses dérivés
V- Système respiratoire et cardiovasculaire
VI- Système nerveux et Urogénital.
Outils pour la modélisation en biologie 1
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Outils pour la modélisation en biologie 1 - CM, Outils pour la modélisation en biologie 1 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Le cours a comme objectif de présenter les bases de la statistique descriptive. La notion d’estimateurs de position (ex : moyenne) et de dispersion (ex : variance) sera développée ainsi que la notion de variable aléatoire. De plus, les différentes lois majeures de la statistique seront également abordées telles que la loi normale, exponentielle, géométrique, et Poisson. L’ensemble de ces notions feront l’objet de TP sous le logiciel R permettant aux étudiants de se familiariser avec la programmation statistique.
Expression écrite et oral
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
9h
Heures d'enseignement
CM, TD
L’UE Expression Ecrite et Orale L2SdV a pour objectif de donner les règles de rédaction d‘un compte-rendu expérimental tel que ceux qui peuvent être demandés à l’issue de travaux pratiques. Ces règles concernent la forme ainsi que la présentation des résultats.
PEP'S 2
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
12h
Cet enseignement non disciplinaire a pour principal objectif de rendre l’étudiant acteur de son orientation. Il oblige l’étudiant à s’interroger sur son avenir professionnel, l’incite à découvrir les réalités professionnelles en lui transmettant une méthode de recherche et de traitement de l’information, et d’aide à la décision afin de construire un projet d’études et de définir un plan d’action.
UET Changements Globaux
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Physique du globe 1
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Physique du globe 1 - CM, Physique du globe 1 - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
- La Terre dans le système solaire : dimensions, géométrie (plan écliptique, déclinaison solaire), mouvements de la Terre (rotation annuelle, diurne) et ses conséquences (saisons).
- Notions de positionnement : coordonnées géographiques, géométrie sphérique, distance entre deux points à la surface de la Terre, forme de la Terre (modèle sphérique, modèle ellipsoïde, géoïde).
- Les enveloppes externes de la Terre :
- Description physique de l'atmosphère (pression, température) et aspects dynamiques (circulation atmosphérique mondiale)
- Aspects énergétiques (rayonnement solaire, transferts radiatif), échanges énergétiques océan/atmosphère, bilan énergétique du système Terre-Soleil.
- Les enveloppes internes de la Terre :
- Modèles sismologique et pétrographie de la Terre – notion de croûte/manteau/noyau. Sources de chaleur interne, transfert de chaleur, modèle thermique.
- Modèle mécanique - notions de lithosphère/asthénosphère, plaques lithosphériques.
- Dynamique de la Terre : mouvements horizontaux (paléomagnétisme) et verticaux (isostasie).
Chimie des solutions 3
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Chimie des solutions 3 - CM, Chimie des solutions 3 - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
- Oxydo-réduction et pH,
- Notion de potentiel standard apparent,
- Complexation : définitions et influence du pH. Conséquences sur le pouvoir rédox, dosages complexométriques,
- Précipitation : définition et influence du pH. Conséquences sur le pouvoir rédox, dosages,
- Introduction aux diagrammes tension / pH : élaboration, définitions, interprétations qualitatives et quantitatives.
Anglais L2 - S4
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais L2 - S4 - TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce quatrième semestre l’accent sera mis sur la compréhension de l’oral à partir de documents de vulgarisation scientifique, et expression orale (phonétique et accentuation de mots)
Génétique
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Génétique - CM, Génétique - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Le cours reprendra les notions fondamentales en génétique (phénotypes : dominance/récessivité, gènes/environnement, épigénétique, mutation, génétique des organismes eucaryotes haploïdes), puis présentera la théorie chromosomique de l’hérédité (mitose et méïose, gènes portés par des chromosomes), le modèle mendélien (mono et dihybridisme) et l’extension de l’analyse mendélienne (allèles multiples, épistasie, gènes complémentaires). La recombinaison, la liaison génétique (distances génétiques, cartographie) seront décrites. Finalement la notion de caractères quantitatifs sera abordée. L’ensemble de ces connaissances seront illustrées dans les séances de travaux dirigés.
Microbiologie 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Microbiologie 2 - CM, Microbiologie 2 - TD, Microbiologie 2 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
L’UE de Microbiologie 2 vise à aborder le métabolisme des microorganismes.
Le cours reprendra les notions sur la diversité, structure et fonction des organismes procaryotes. Les bases théoriques en microbiologie générale, et particulièrement sur les métabolismes bactériens seront approfondies. L’ensemble de ces connaissances seront illustrées dans les séances de travaux dirigés et de travaux pratiques.
Chapitre I : Introduction et rappels
- Repères de la microbiologie: les procaryotes dans le monde du vivant
- Structures et fonctions des procaryotes: rappels
Chapitre II : Métabolismes Microbiens
- Relations métabolisme/nutrition/croissance
- Energétique et oxydo-réduction: rappels
- Production d’énergie via la respiration
- Production d’énergie via la fermentation
- La lithotrophie
- La régulation du métabolisme
Physiologie végétale 1 : Nutrition et métabolisme
ECTS
6 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
62h
Heures d'enseignement
Physiologie végétale 1 : Nutrition et métabolisme - CM, Physiologie végétale 1 : Nutrition et métabolisme - TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Nutrition carbonée : phase photochimique et cycle de Calvin ; métabolismes C3, C4 et CAM ; photorespiration ; production primaire et métabolites secondaires ; considérations écophysiologiques.
Nutrition hydrique : potentiel hydrique ; rôles de l’eau dans la plante ; mécanismes de l’absorption ; circulation et émission de l’eau par la plante ; fonctionnement stomatique.
Nutrition minérale : Absorption et rôles des principaux éléments minéraux ; assimilation et métabolisme de l’azote ; symbiose Rhizobium-légumineuses ; relations métaboliques entre nutrition minérale et processus photosynthétiques.
Physiologie animale 1
ECTS
6 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
66h
Heures d'enseignement
Physiologie animale 1 - CM, Physiologie animale 1 - TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
L’UE physiologie animale s’inscrit dans le cadre général de la biologie des organismes en continuité avec la biologie animale. Son approche consiste à étudier les grandes fonctions biologiques permettant à l’organisme animal de survivre et de se reproduire (maintien de l’homéostasie).
Les exemples concerneront l’ensemble des Métazoaires, mais les Mammifères et l’Homme où les connaissances sont bien établies seront des exemples privilégiés. Les rappels concernant la membrane plasmique permettront d’aborder la communication intercellulaire, puis le système nerveux, les organes sensoriels, et le fonctionnement des muscles. Enfin l’appareil cardio-vasculaire et la régulation des paramètres circulatoires feront l’objet d’une attention particulière.
I- Physiologie de la membrane plasmique
II- Neurophysiologie
III- Le système nerveux
IV- Les récepteurs sensoriels
V- La contraction musculaire
VI- Le système cardiovasculaire
Outils pour la modélisation en biologie 2
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Outils pour la modélisation en biologie 2 - CM, Outils pour la modélisation en biologie 2 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Le cours a comme objectif de permettre aux étudiants d’approfondir leur connaissance sur les statistiques descriptives mais également de se familiariser avec la notion de tests statistiques. Ce cours abordera plus particulièrement la notion de corrélation (Pearson et Spearman) ainsi que la régression linéaire sous sa forme simple mais également polynomiale. L’ensemble de ces notions feront l’objet de TP sous le logiciel R.
UE Transverse
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Plus d'informations à la page suivante : https://formation.univ-pau.fr/fr/scolarite/ue-transverses.html
Milieux sédimentaires 1
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Milieux sédimentaires 1 - CM, Milieux sédimentaires 1 - TP
Ce module est dédié à la présentation du système carbonate et de ces composants.
Il contient 9h de cours magistraux présentant les grands principes environnementaux de la sédimentation carbonatées, les classifications, et ce qui compose ces roches très présentes sur la terre.
Une série de TP au microscope complètent cette partie et permettent aux étudiants d’apprendre à reconnaitre les faciès carbonatés et à les associer à des conditions de dépôt, afin de reconstruire le paléo-environnement.
Une seconde partie, composée de 15h de TP, présente les différentes familles de micro et macro-fossiles composant les roches carbonatées. Ces TP développent l’aspect anatomique de ces organismes pour introduire des concepts d’écologie de vie.
Les TP permettront d’étudier la morphologie d’espèces majeures de chaque grande famille, donnant aux étudiants les clés de description de ces fossiles.
Chimie organique fonctionnelle, mécanisme réactionnel
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Chimie organique fonctionnelle, mécanisme réactionnel - CM, Chimie organique fonctionnelle, mécanisme réactionnel - TD
Principaux groupes fonctionnels en chimie organique : les alcynes, les composés aromatiques, les organométalliques, les alcools, les aldéhydes et les cétones, les acides et dérivés, les amines.
Les propriétés physiques et chimiques des grandes fonctions en chimie organique, avec en particulier les modes de préparation, de transformation et les mécanismes réactionnels mis en jeu.
UE CMI : Préparation à l'international
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
24h
Heures d'enseignement
TD
The course Preparation à l’International aims to bridge the gap between English grammar and vocabulary skills with what they will inevitably be faced with in the real world: a need to respond with spontaneity and precision in a variety of situations (personal, professional and socio professional).
In link with the spirit of innovation that is one of the CMI, the course also has the objective of encouraging students to see issues from different perspectives and think outside the box when proposing solutions.
Biologie moléculaire pratique
ECTS
3 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
55h
Heures d'enseignement
CM, TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
A travers des exemples concrets, apprentissage théorique et pratique des techniques de Biologie Moléculaire couramment utilisées dans un laboratoire.
Le cours se compose des 5 Chapitres suivants :
I. Rappels sur la composition et la structure des acides nucléiques
II. Techniques de base de Biologie Moléculaire
III. Techniques d’amplification par PCR
IV. Techniques de clonage
V. Techniques de séquençage
Virologie
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Virologie - CM, Virologie - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE est une initiation à la virologie. Les virus sont le plus souvent associés à des maladies qu’elles soient humaines, animales ou végétales. Cet aspect sera abordé, ainsi que les méthodes permettant d’étudier les virus et leur classification. De plus, l’importance des virus dans le fonctionnement des écosystèmes et l’évolution des êtres vivants sera également étudiée au travers de différents exemples. Afin de compléter le cours, les étudiants travailleront sur une publication de recherche en virologie qui sera présentée au reste de la promotion.
Plan du cours :
1- Historique et définition des virus
2- Structure des virus
3- Classification des virus
4- Cycles de multiplication des virus
5- Méthodes d’étude des virus
6- Interactions virus-virus et virus-hôte
7- Un modèle d’étude : le bactériophage
8- Défense contre les virus
9- Les provirus et les prophages
10- Les virus et le Cancer
11- Interactions virus-organismes
12- Les prions
13- Les virus végétaux et les viroïdes
14- La grippe
15- VIH-1
16- Covid19
16- Virus et environnement
Génétique bactérienne
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Génétique bactérienne - CM, Génétique bactérienne - TD
L’UE de génétique bactérienne présente les grands principes des bases moléculaires et génétiques permettant l'étude des mécanismes moléculaires chez les bactéries. Les différents types de mutations et les facteurs qui conduisent à leur apparition chez ces microorganismes ainsi que les différents mécanismes de recombinaison et transferts génétiques seront adressés. Quelques exemples des applications de la génétique bactérienne seront également présentés avec des exemples d’utilisation des différents mécanismes moléculaires vus tout au long du cours.
Anglais L3 - S5
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais L3 - S5 - TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce cinquième semestre l’accent sera mis sur une introduction à la préparation à la certification en anglais, Test of English for International Communication (TOEIC).
Le TOEIC mesure les compétences de compréhension écrite et orale pour les niveaux débutant à avancé et détermine si une personne peut communiquer en anglais efficacement et avec aisance dans un contexte professionnel.
UE Transverse
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Plus d'informations à la page suivante : https://formation.univ-pau.fr/fr/scolarite/ue-transverses.html
PEP'S 3
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
0h
Heures d'enseignement
PEP'S 3 - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Il s'agit ici de construire un projet de poursuite d’études ou professionnel, de définir votre plan d'action puis le mettre en œuvre en préparant vos candidatures.
A cet effet, le parcours en ligne PEP'S 3 est composé des trois étapes proposant chacune des pistes audio, des diaporamas ou des infographies et des activités.
Plan (simplifié) du cours :
- Introduction
- Avant de commencer : retour sur l’UE PEP’S 2 : Projet d’études et professionnel dans le supérieur en deuxième année de licence
- Connaitre ses atouts et ses compétences
- Explorer les possibles
- Plan d’action : candidater
- Que faire en cas de refus : propose des informations concernant la procédure à suivre en cas de refus d'admission en master.
Physiologie animale 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Physiologie animale 2 - CM, Physiologie animale 2 - TD, Physiologie animale 2 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE permet de compléter l’étude des grandes fonctions biologiques commencée avec l’UE physiologie animale 1. La fonction de nutrition au sens large et les échanges entre l’organisme et son environnement seront au cœur de cette UE (Prise alimentaire et digestion, respiration, Excrétion, osmorégulation, thermorégulation). L’objectif de cette UE de fin de licence est de donnée une compréhension de l’organisme dans sa globalité en appréhendant notamment l’interaction entre les systèmes. Ces interactions et le système endocrine sont abordés en conclusion.
I- Prise alimentaire et digestion
II- La respiration
III- Excrétion
IV- Thermorégulation
Physiologie végétale 2 : Croissance et Développement
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Physiologie végétale 2 : Croissance et Développement - CM, Physiologie végétale 2 : Croissance et Développement - TD, Physiologie végétale 2 : Croissance et Développement - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Ce cours présente les différentes étapes du développement des plantes à fleurs, de la plantule à la plante sénescente. L’influence des facteurs environnementaux et hormonaux contrôlant la croissance et la reproduction des végétaux supérieurs sera étudiée en insistant sur les processus cellulaires et moléculaires impliqués.
Les techniques de biotechnologie végétale (culture in vitro et utilisation des phytohormones, génie génétique, transgenèse) utilisées en amélioration des plantes sont également abordées.
Roches endogènes 1
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
36h
Heures d'enseignement
Roches endogènes 1 - CM, Roches endogènes 1 - TP
L'UE Roches endogènes 1 poursuit les objectifs de l’UE Roches et Chronologie de première année. Elle pose les principes de la reconnaissance au microscope des principaux minéraux silicatés afin de caractériser les roches magmatiques et métamorphiques.
Le cours aborde les notions indispensables sur la composition des silicates, sur leur organisation structurale et les propriétés physiques qui en résultent. Il traite aussi d’optique cristalline pour ce qu’elle va permettre d’identifier les minéraux au microscope. Le cours se termine sur la gitologie des roches magmatiques.
Les 5 séances de TP sont consacrées à l'identification des minéraux silicatés classiques des roches endogènes (minéraux ferro-magnésiens, quartz, feldspaths et feldspathoïdes, calcite). Ils abordent (1) les principes de la reconnaissance des minéraux au microscope, l’identification (2) des roches plutoniques, (3) volcaniques et (4) métamorphiques. La dernière séance est dédiée à l’examen.
Cette approche est réalisée conjointement au travail sur le terrain à Héas pour les biologistes et au Pic du Midi d’Ossau pour les géologues.
Contenu de l’enseignement :
- Cours magistral sur la structure des silicates et leur propriétés cristallines, sur l’optique cristalline et sur la gitologie des roches magmatiques (C : 13h30)
- Séance de révision des roches endogènes vues en Roches et Chronologie en S1 (TP : 1h30)
- TP de microscopie (15h)
- Étude de cas : le magmatisme d’Héas et le volcanisme d’Ossau (TP terrain : 6h, 1 jour)
Marges et Chaines de montagnes
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
36h
Heures d'enseignement
Marges et Chaines de montagnes - CM, Marges et Chaines de montagnes - TP
Cette unité d’enseignement vise à donner à l’étudiant les grandes lignes de la structuration d’une marge et d’une chaine de montagne.
On présente les grandes étapes du cycle de Wilson, les éléments géométriques des différentes marges et des chaines de montagne.
L’application de toutes ses connaissances sera faite en s’appuyant sur l’orogène pyrénéen où toutes les phases du Cycle de Wilson sont présentes, et où, de surcroit, la marge initiale présente une géométrie originale avec des éléments du manteau incorporés.
Une série de TP est prévue avec des constructions de coupes géologiques dans les Pyrénées pour approfondir des éléments géométriques vus en cours. Une journée de terrain complète les observations.
Contenu du cours :
- Le cycle de WILSON ; du rift à l’accrétion.
- Les marges océaniques classiques et volcaniques.
- Les chaines de montagnes.
- Cas d’application ; les Pyrénées. D’une marge hyper étirée à la collision.
- Cartographie – travaux pratiques. Une journée de terrain illustrant les concepts vus en cours.
Outils pour la modélisation en biologie 3
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
40h
Heures d'enseignement
Outils pour la modélisation en biologie 3 - CM, Outils pour la modélisation en biologie 3 - TD, Outils pour la modélisation en biologie 3 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Présenter la problématique des tests statistiques à partir d'exemples simples tirés de la biologie (tests d'ajustements, comparaison de moyennes et de fréquences) et leur mise en oeuvre avec le logiciel R. Les notions suivantes seront abordées :
- Fluctuations d'échantillonnage.
- Intervalles de confiance.
- Principe des tests statistiques.
- Tests d'ajustements à des lois de distribution.
- Lien entre variables (Chi2 et corrélation)
- Comparaison de moyennes.
- Comparaison de variances.
- Régression linéaire.
Biologie moléculaire 3
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biologie moléculaire 3 - CM, Biologie moléculaire 3 - TD
Approfondissement de connaissances en biologie moléculaire :
- CONFORMATION DES GENOMES
Complexité des génomes procaryotes et eucaryotes
Structure des génomes chloroplastiques et mitochondriaux
Réplication des génomes
Topoisomérases
Régulation de la réplication
- ORGANISATION DES GENOMES
Structure des gènes chez les organismes procaryotes et eucaryotes
Expression des gènes
Régulation de l'expression génique chez les organismes procaryotes et eucaryotes
- PLASTICITE GENOMIQUE
Eléments mobiles
Plasmides
Transposons
Intégrons
Immunologie
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Immunologie - CM, Immunologie - TD
- Cellules et organes du système immunitaires
- Structure et fonction des immunoglobulines
- Le complexe majeur d’histocompatibilité
- Le système du complément
- Génétique du système HLA et des immunoglobulines
- La réponse immune
- Techniques d’immunologie
Écologie des populations
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Ecologie des populations - CM, Ecologie des populations - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Après quelques rappels d’écologie générale, la population est décrite de par sa structuration mais aussi de par l’évolution de ses effectifs dans le temps. Cette dynamique peut être caractérisée par des modèles simples jusqu’à des modèles plus complexes qui prennent en compte diverses interactions comme la prédation ou la compétition. L’enjeu est de pouvoir prédire le comportement des effectifs d’une population dans le temps à partir de données initiales et de paramètres intrinsèques à la population ou de paramètres environnementaux.
Anglais L3 - S6
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais L3 - S6 - TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce sixième semestre l’accent sera mis sur l’expression orale (et écrite en fonction du niveau CECRL de l’étudiant).
Génétique des populations
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Génétique des populations - CM, Génétique des populations - TD
L’unité d’enseignement de génétique des populations apportent les bases indispensables à la compréhension du fonctionnement génétique des populations.
Il comprend des cours magistraux et des travaux dirigés couvrant :
- Fréquences alléliques, loi de Hardy-Weinberg, fréquences des hétérozygotes, structure génétique.
- Evolution moléculaire : déséquilibre de liaison, théorie neutraliste de l’évolution moléculaire, sélection, auto-stop.
- Pressions évolutives : mutation, dérive génétique, migration, sélection
- Subdivision des populations et statistiques F (statistique de Wright, effet Walhund).
- Spéciation
Travail d'initiative en Biologie
ECTS
3 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Travail d'initiative en Biologie - CM, Travail d'initiative en Biologie - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Dans cette UE l’étudiant travaillera en équipe de 2 à 4 étudiants autour d’une problématique scientifique simple. Après une phase de recherche bibliographique, cette problématique débouchera sur un travail personnel dont la nature peut varier : observation et description d’objets naturels ou artificiels, traitement de données, mise en évidence de phénomènes, expérimentation, modélisation, simulation etc. Ce travail réalisé en autonomie doit suivre une démarche scientifique quantitative permettant d’avoir un regard critique sur la production réalisée avec un minimum de moyens. L’évaluation aura lieu sous la forme d’une soutenance orale individuelle, complétée par une fiche de synthèse.
Cette UE a pour objectif la valorisation des compétences pratiques et de l’autonomie de l’étudiant vis-à-vis d’une démarche scientifique quantitative tout en développant un recul critique sur la démarche développée. Les capacités de communication lors de la soutenance et au sein du groupe seront également développées pour mener à bien ce travail.
Stage professionnel 2 mois
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Description du cours et modalités pédagogiques :
Le stage s’effectue de début avril à fin mai (8 semaines minimum) mais peut s’étendre jusqu’à fin août (24 semaines). Il se déroule en France ou à l’étranger, dans une structure d’accueil privée, publique ou parapublique avec laquelle une convention de stage est signée.
L’étudiant est mis en situation de recherche d’emploi : il effectue l’ensemble des démarches, depuis la recherche de l’entreprise d’accueil jusqu’à la signature de la convention. Il est immergé dans le monde professionnel de 8 à 24 semaines et peut établir ses premiers contacts professionnels.
Cette UE est ouverte aux étudiants des parcours BCM et BGST. Pour ces derniers, il fortement recommander d’effectuer le stage au sein d’un établissement scolaire essentielle pour les étudiants de L3 qui souhaite poursuivre leurs études en Master MEEF.
IMPORTANT : Le stage de L3 compte pour un total de 6 ECTS avec 2 ECTS de l’UE stage professionnel et 4 ECTS de l’UE outils bibliographiques – projet. Il est donc impératif de s’inscrire aux deux UE pour pouvoir valider la totalité des ECTS.
Outils bibliographiques
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
35h
Heures d'enseignement
Outils bibliographiques - Projet - TD, Outils bibliographiques - Projet - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE est associée à l’UE stage professionnel et vient sanctionner l’évaluation du stage par le rapport de stage et la présentation orale. Le but de cette UE est donc de familiariser les étudiants avec la rédaction d’un rapport de stage scientifique ou pédagogique en suivant les consignes de rédaction transmises par l’équipe pédagogiques. L’es étudiants vont également avoir l’opportunité de défendre leur stage par une présentation orale qui aura lieu environ une semaine après la fin du stage.
Cette UE est ouverte aux étudiants des parcours Biologie Cellulaire et Moléculaire (BCM) et parcours Biologie Générale et Sciences de la Terre (BGST). Pour les étudiants se destinant aux métiers de l’enseignementPour ces derniers, il fortement recommanderé que le stage soit effectué au sein d’un établissement scolaire. Un apport de connaissances sur le système éducatif et le métier d’enseignant sera apporté avant le stage.
IMPORTANT : Le stage de L3 compte pour un total de 6 ECTS avec 2 ECTS de l’UE stage professionnel et 4 ECTS de l’UE outils bibliographiques – projet. Il est donc impératif de s’inscrire aux deux UE pour pouvoir valider la totalité des ECTS.
Microbiologie environnementale
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
CM, TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Depuis l’apparition de la vie unicellulaire sur la Terre, les microorganismes ont pu coloniser la plupart des écosystèmes terrestres de l’atmosphère jusqu’à plusieurs kilomètres de profondeur dans la croute terrestre. Les microorganismes sont à la base des chaines alimentaires. Ils participent au recyclage de la matière et aux grands cycles biogéochimiques. Les buts de cette UE seront de comprendre les techniques d’études de ces microorganismes dans l’environnement, de comprendre le rôle des microorganismes dans les cycles biogéochimiques et de comprendre les interactions entre ces microorganismes mais également avec leur hôte (plante, animal) avec un focus sur l’écosystème microbien de l’Homme.
Plan du cours :
1- Introduction
1.1 Buts de l’écologie microbienne
1.2 Fonctions des microorganismes
1.3 Procaryotes : la majorité silencieuse
2- Qu’est-ce que l’écologie ?
2.1 Niveaux inférieurs d’organisation du vivant
2.2 Niveaux supérieurs d’organisation du vivant
2.3 Les niveaux d’étude de l’écologie
2.4 Les domaines d’étude de l’écologie
2.5 Notion de facteur écologique
2.6 Valence écologique et aire de répartition des microorganismes
2.7 La notion d’espèce en microbiologie
3- Etude de la biodiversité microbienne
3.1 Echantillonnage
3.2 Microscopie
3.3 Cytométrie de flux
3.4 Sélection et isolements
3.5 Méthodes moléculaires
3.6 Autres méthodes
4- Application aux tapis microbiens
4.1 Utilisation d’inhibiteurs
4.2 Fractionnement isotopique
4.3 Indices de diversité
5- Cycles biogéochimiques
5.1 Chaines alimentaires et boucle microbienne
5.2 Carbone
5.3 Azote
5.4 Soufre
5.5 Phosphore
5.6 Métaux
6- Interactions entre les microorganismes
6.1 Introduction
6.2 Neutralisme
6.3 Amensalisme
6.4 Prédation
6.5 Compétition
6.6 Parasitisme
6.7 Commensalisme
6.8 Coopération
6.9 Mutualisme
7- Le microbiote humain
Milieux sédimentaires 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Milieux sédimentaires 2 - CM, Milieux sédimentaires 2 - TD, Milieux sédimentaires 2 - TP
Cette UE a pour objectif la présentation des milieux de sédimentation détritique depuis la source (Continental) à la plaine abyssale (Marin), ainsi que la dynamique des écoulements responsables de la mise en place de ces environnements sédimentaires.
Le cours présente les différents milieux de sédimentation fluviatiles, mixtes et marins, des travaux pratiques illustrent ce cours afin d'apprendre à reconnaître les différents types de faciès et milieux de dépôts.
Le cours portera ensuite sur les paramètres régissant la formation des bassins sédimentaires (subsidence, eustatisme, apports sédimentaires). Les notions de stratigraphie sismique et séquentielle sont abordées.
La dernière partie portera sur la caractérisation physique des écoulements et processus.
Étude de la biodiversité sur le terrain
ECTS
3 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
38h
Heures d'enseignement
Projet travaux pratiques - TD, Projet travaux pratiques - TP, CM
Description du cours et modalités pédagogiques :
La démarche est basée sur une approche de terrain permettant de pratiquer la détermination d’espèces notamment en botanique et les premières notions d’écosystèmes par le prisme de l’écologie végétale.
La démarche permet de mobiliser les connaissances de biologie végétale acquises lors des deux premières années de licence : vocabulaire anatomique, cycle de développement etc pour les végétaux sans fleur et avec fleur. Ceci pour décrire et classifier les spécimens observés in situ. La pratique sur le terrain permet également d’aborder la notion d’écosystèmes au travers de la caractérisation des végétaux ainsi que les adaptations morphologiques nécessaires.
Biochimie des protéines
ECTS
6 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
34,5h
Heures d'enseignement
Biochimie des protéines - CM, Biochimie des protéines - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Solutions Aqueuses : structure de la molécule d’eau et propriétés de l’eau.
Structure des protéines.
Stabilité des protéines.
Repliement des protéines : chaperons et autres assistants du repliement.
Oxydation des protéines
Dégradation des protéines.
Enzymologie approfondie.
-Vitesse de réaction, loi de vitesse et ordre de la réaction, théorie de l’état de transition.
-Réactions à deux substrats.
-Régulation de l’activité enzymatique.
Transport à travers les membranes.
La phosphorylation oxydative.
Cours magistraux, TD et TP
Anglais L1 - S1
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce premier semestre l’accent sera mis sur la compréhension écrite à partir de documents de vulgarisation scientifique.
Évolution et Diversité
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
CM, TD
Évolution
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Evolution - CM, Evolution - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
De l'origine de la vie jusqu'à aujourd'hui, les êtres vivants ont évolué et se sont grandement diversifiés. Cette UE propose de s'intéresser aux grands concepts et mécanismes de l'évolution, aux grandes théories de l'évolution jusqu'à la caractérisation de la diversité des êtres vivants. Les objectifs de l’EC Evolution sont de donner les clés de compréhension des processus tels que la sélection naturelle de Darwin afin d'appréhender les histoires évolutives des êtres vivants et de comprendre la logique de leur classification proposée dans l’EC Diversité (domaine du vivant : bactérie, archées, eucaryotes-protistes végétaux, fungi, animaux...). Il sera aussi proposé une mise en contexte historique pour comprendre le cheminement de ces concepts et la mise en pratique d'outils pour caractériser et mesurer les traits évolutifs.
Le cours sera divisé en trois partie principales :
- Des repères historiques qui montrent le cheminement des concepts liés aux théories de l’évolution
- Comment montrer qu’il y a évolution, faits, expériences indices qui conduisent aux théories
- Mécanismes, interprétations et explications des processus à l’origine des théories de l’évolution
Diversité
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Diversité - CM, Diversité - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Dans la prolongation de l’EC Evolution, cette UE propose d’aborder la diversité résultant des processus évolutifs. Les principes et l’histoire de la classification du vivant seront abordés afin de comprendre le cadre épistémologique permettant d’appréhender la diversité. Différentes méthodes de la systématique phylogénétique seront explorées et comparées lors des travaux dirigés. Dans un second temps on donnera un aperçu de la diversité du vivant au cours des temps géologiques depuis l’origine du vivant jusqu’aux grand domaines actuels. Des exemples d’Eucaryotes unicellulaires notamment parasites ou ayant une importance écologique particulière seront abordés. Enfin cette UE constituera par ailleurs une introduction aux UE du second semestre : Microbiologie, Biologie végétale et Biologie animale.
Chapitre 1 – Classer le vivant
Chapitre 2 – Histoire de la vie sur Terre
Chapitre 3 – Les grands ensembles du vivant
Biologie cellulaire
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biologie cellulaire - CM, Biologie cellulaire - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE a pour but de présenter les bases de l’organisation des cellules, structures fondamentales du vivant.
- Définition du vivant et importance de la cellule. Méthodes microscopiques. Génome, expression génique, protéines
- Cellule procaryote : définitions, morphologies, génome, paroi cellulaire, composants externes de la paroi cellulaire, membrane plasmique, cytoplasme
- Cellule eucaryote : caractéristiques et spécialisations de la membrane plasmique, endo et exocytose
- Noyau des cellules eucaryotes : organisation nucléosomique, réplication des chromosomes, transcription chez les eucaryotes
- Reticulum endoplasmique, synthèse et exportation des protéines et des lipides par le RE, transport vésiculaire, structure et fonction de l'appareil de Golgi, lysosomes
- Organites semi-autonomes : structure et fonction des mitochondries et des chloroplastes
- Cytosquelette
- Cycles cellulaires eucaryotes (mitotique et méiotique)
Macromolécules
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Macromolécules - CM, Macromolécules - TD
Structures, propriétés et rôles biologiques des aminoacides, peptides et protéines, des oses et polyosides, des lipides, des nucléotides et acides nucléiques.
Chimie organique et des solutions pour SDV
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Chimie des solutions 1 pour SDV
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD
Chimie organique structure des molécules pour SDV
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD
Mathématiques générales
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Mathématiques générales 1 - CM, Mathématiques générales 1 - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Toutes les notions traitées dans ce cours sont abordées dans un contexte pratique, tiré de problèmes de la physique de la chimie et de modèles de la biologie. Cette approche dit permettre à l’étudiant de comprendre comment les mathématiques qui peuvent paraître théoriques sont en réalité un outil primordial pour l’ensemble des sciences et pour la biologie en particulier. Les thèmes abordés sont les suivants :
- Pourcentage, accroissement, proportionnalité et règle de trois
- Les suites numériques
- Résolution de systèmes d’équations
- Les fonctions et notion de dérivée
- Erreurs de mesure et incertitudes (moyenne, variance, écart-type, régression linéaire et moindre carrés)
- Intégrales et primitives
- Équations différentielles (chute d’un corps, modèles démographiques, modèles proie-prédateurs…)
Méthodologie du travail universitaire
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE aidera les primo-entrants à l’université à prendre leurs repères dans leur formation afin de réussir au mieux leur licence. Des méthodes élémentaires indispensables au travail d’un biologiste sont travaillées : microscopie, conversions d’unités de mesure, utilisation graphique de données expérimentales.
PIX
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
18h
Heures d'enseignement
PIX - TD
La formation vise la maîtrise des compétences de l'usage des outils numériques et bureautiques, d'internet et de travail collaboratif, indispensables aujourd’hui pour la vie étudiante et l’activité professionnelle. En parallèle, cette formation prépare à la certification PIX.
La formation s’appuie sur un cours en ligne sur la plateforme Elearn avec des tutoriels, exercices avec correction, tests de positionnements sur PIX et forum d’échanges.
Les épreuves évalueront les connaissances mais également les savoir-faire et la capacité à identifier les enjeux du numérique.
Contenus des modules :
|
Module Mener une recherche et une veille informationnelle |
· Retrouver et évaluer la source d'une information ou une image · Formuler une requête élaborée dans un moteur de recherche · Connaître Wikipedia et son processus de publication · Interpréter la présence de publicité dans les résultats d'un moteur de recherche |
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Module Traiter les données |
· Trier et filtrer des données dans une feuille de calcul · Faire des calculs dans une feuille de calcul · Saisir, intégrer et manipuler des données dans un classeur |
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Module Développer les documents textuels |
· Structurer et mettre en forme un document en tenant compte des règles d’accessibilité · Appliquer et modifier les styles · Insérer des objets (image, tableau, graphique, …) et le positionner de façon pertinente · Insérer des tables des matières et d’illustrations |
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Module Sécuriser l’environnement numérique |
· Maîtriser son identité numérique à travers le choix d'un identifiant (pseudo, adresse électronique, ...) · Connaître le principe et la pratique du déréférencement · Connaître des outils et techniques web pour mener à bien un projet (modes de financement participatif, visibilité, SEO) · Identifier les traces en ligne constitutives de l'e-réputation |
|
Module Protéger les données et la vie privée |
· Mettre en œuvre des stratégies de protection de sa vie privée et de ses données personnelles et respecter celles des autres · Évaluer la pertinence d'une collecte de données par un service en ligne et en comprendre les finalités |
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Module Protéger la santé, le bien-être et l’environnement |
· Connaître l'impact de la lumière des écrans sur le sommeil · Connaître l'impact environnemental lié aux usages numériques · Maîtriser la consommation d'énergie de ses appareils numériques · Adapter ses pratiques en ligne pour limiter leur impact environnemental |
Roches et Chronologie
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Roches et Chronologie - CM, Roches et Chronologie - TD, Roches et Chronologie - TP
L’objectif de l’UE est d’introduire plusieurs notions de base sur le calendrier géologique, les roches, les minéraux et les fossiles :
- La mesure du temps, 4ème dimension des objets géologiques, est discutée à partir des principes de la chronologie relative ;
- Les notions de minéraux et de cristaux sont présentées ;
- Ces minéraux sont les constituants des différents types de roches (magmatiques, métamorphiques, sédimentaires) dont la composition et les conditions de formation devront être comprises ;
- Les principaux fossiles, marqueurs stratigraphiques, sont également décrits.
L’UE est organisée comme suit :
- Le temps en géologie et la chronologie relative – (C : 3h – TD : 3h)
- Minéraux, roches magmatiques et métamorphiques : définitions et description macroscopique – (C : 6h – TP : 10h30)
- Roches sédimentaires, sédimentologie : définitions et description macroscopique – (C: 4h30 - TP: 4h30)
- Paléontologie – (C : 3h – TP : 3h)
Introduction à la physique générale pour SDV
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Introduction à la physique générale pour SDV - CM, Introduction à la physique générale pour SDV - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Optique géométrique :
Lumière, vue & vision, nature et vitesse de la lumière, le spectre lumineux.
Réfraction : indice de réfraction et loi de Descartes.
Formation des images : système optique, objet & image, foyers optiques.
Dioptres : relation dans un dioptre sphérique, construction d’une image à travers un dioptre sphérique, dioptres plans.
Lentilles minces, relation de conjugaison, foyers principaux objet et image, construction d’une image, grandissements transversal et angulaire, lames à faces parallèles, défauts des lentilles, association de deux lentilles minces.
Miroirs, relation de conjugaison, construction d’une image.
Instruments d’optique : l’œil, la loupe & le microscope.
Mécanique des fluides :
État fluide.
Hydrostatique : force & pression, pression dans un fluide, forces de pression sur une paroi, le théorème d’Archimède.
Effets physiologiques de la pression : solubilité des gaz dans un liquide, pressions partielles et physiologie, toxicité des gaz, limites humaines.
Notion de dynamique des fluides : cisaillement, viscosité et turbulence, l’hémodynamique.
Introduction à la chimie générale pour SDV
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Introduction à la chimie générale pour SDV - CM, Introduction à la chimie générale pour SDV - TD
- Mesures et moles
- La réaction chimique
Écologie et Écosystèmes
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Ecologie et Ecosystèmes - CM, Ecologie et Ecosystèmes - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
L’écologie est aujourd’hui au centre de réflexions globales et de prises de conscience sur l’évolution des sociétés modernes, des comportements individuels et du fonctionnement de notre planète. Cette UE présente les concepts d’écologie sur la structure de la biosphère et de son fonctionnement. Ses différentes composantes, populations et écosystèmes sont abordés et caractérisés. Enfin à la lumière des aspects fonctionnels de notre environnement, un décryptage des enjeux de l’écologie moderne est proposé afin d’appréhender la place de l’Homme et de l’impact de ses activités.
Le cours sera divisé en trois parties principales :
- Les interactions de l’individu avec son environnement, notion de facteur écologie
- Structure et fonctionnement de l’écosystème, notion de flux et de cycles biogéochimiques
- Ecologie de la population, structuration, dynamique et interactions
Biologie végétale 1
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biologie végétale 1 - CM, Biologie végétale 1 - TD, Biologie végétale 1 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Après un rappel sur l’évolution des végétaux en relation avec les contraintes exercées par le milieu, la diversité et la classification des végétaux sans fleurs (des algues jusqu’aux gymnospermes) seront décrites, avec une attention particulière sur les structures et les modes de reproduction. La diversité et la biologie des champignons seront également abordées.
Biologie animale 1
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
36h
Heures d'enseignement
CM, TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE traitera de l’ensemble du monde animal, et de sa diversité. Elle s’appuie notamment sur une description des caractéristiques propres aux grands groupes zoologiques aussi bien « invertébrés » que Vertébrés. L’étude des différents plans d’organisation sera par ailleurs complétée par des données d’ordre écologique liées au mode de vie des organismes modèles étudiés. Enfin une introduction à la biologie du développement permettra d’aborder la mise en place du plan d’organisation lors du développement embryonnaire.
Introduction à la zoologie et principes du développement embryonnaire
CHAP I- Les Métazoaires non-bilatériens:
CHAP II- Les Spiraliens
CHAP III - Les Ecdysozoaires et Euarthropodes
CHAP IV - Les Deutérostomiens : Echniodermes, Chordés
CHAP V - Les Vertébrés
Microbiologie 1
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
34,5h
Heures d'enseignement
Microbiologie - CM, Microbiologie - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
La microbiologie est une discipline qui comprend des domaines d’étude variés que ce soit en santé, en industrie ou en écologie, et s’intéresse à de nombreux organismes et entités biologiques (virus, bactéries, champignons…).
Une introduction générale permettra d’appréhender l’étendue de la discipline, de la découverte des microorganismes aux domaines de recherche actuels. Puis l’accent sera mis sur le monde bactérien. Les bactéries et l’Homme sont indissociables, beaucoup nous protègent, certaines sont pathogènes alors que d’autres nous sont très utiles. L’objectif de cette UE est d’apporter les connaissances nécessaires, de l’organisation de la cellule à la multiplication bactérienne, pour comprendre comment nous les étudions, les utilisons et les contrôlons.
Le cours est organisé en 5 chapitres :
I- Introduction à la Microbiologie
II- La Microscopie
III- La Cellule Bactérienne
IV- La Croissance Bactérienne
V- Le Contrôle des Microorganismes
Anglais L1 - S2
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce second semestre l’accent sera mis sur la compréhension écrite à partir de documents de vulgarisation scientifique et l’expression écrite.
Il s’agira d’approfondir les connaissances en langue anglaise tout en continuant à développer une langue à dominante scientifique au sens large. Les compétences grammaticales et le vocabulaire continueront à être approfondis et enrichis, essentiellement à partir de documents écrits. On demandera aux étudiants de s’investir tant sur le plan de l’écrit que de l’oral dans un but d’expression la plus personnelle et spontanée possible.
UE Transverse
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Plus d'informations à la page suivante : https://formation.univ-pau.fr/fr/scolarite/ue-transverses.html
Expression écrite et orale
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
9h
Heures d'enseignement
TD
L’UE Expression écrite vise à aborder les modalités et les approches nécessaires pour rédiger un rapport scientifique et ses différentes parties.
Le cours et TD reprendront les modalités d’organisation, structuration et rédaction d’un rapport scientifique. Ils aborderont (i) l’organisation et la description de la méthodologie expérimentale utilisée dans un travail scientifique, (ii) la présentation des données scientifiques sous forme de figures et tableaux, (iii) la description et l’interprétation des données, et (iv) la présentation des conclusions et discussions scientifiques.
PEP'S 1
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
12h
Heures d'enseignement
PEP'S 1
Ce travail s'inscrit dans le cadre de la démarche PEP'S "Projet d’Études et Professionnel dans le Supérieur" qui est un dispositif d'accompagnement à l’orientation sur les 3 années de licence. Le but étant d’aider l’étudiant à construire progressivement un projet d’étude et professionnel de façon fiable et réfléchit et lui permettre de personnaliser et enrichir son parcours d’étude afin faciliter son intégration post licence (poursuite d’étude ou professionnelle).
Le PEP’S 1 est le premier temps de ce travail et permet aux étudiants d’élaborer un pré-projet d’études.
Plan (simplifié) du cours :
- Etape 1 : je découvre les clés de l’orientation et ma formation
- Étape 2 : j’explore les domaines professionnels de ma formation
- Etape 3 : j’explore ma personnalité, mes atouts
- Étape 4 : je combine mes résultats pour rédiger son pré-projet
UE CMI Théâtre 1 : prendre la parole en public
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Théâtre 1 : prendre la parole en public
La pratique théâtrale, ici potentiellement axée majoritairement sur le travail d’improvisations, mais pas exclusivement, présente de multiples perspectives de développement personnel, pouvant être aisément rattachés aux perspectives professionnelles d’étudiants amenés à exercer des fonctions de responsabilité. À se présenter, aussi, tout bonnement, sur le marché du travail. Travail qu’ils auront ensuite à exercer en équipe.
Structures géologiques
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Structures géologiques - CM, Structures géologiques - TD, TP
Introduction à la géologie structurale à travers la réalisation de coupes et de cartes représentant des structures géologiques simples. L'objectif général est d'acquérir les bases de la lecture et de l'interprétation des cartes géologiques.
Ce cours permet d’aborder la lecture d’une carte topographique, d’une carte géologique, d’une image satellite, et de donner les grands principes de construction d’un profil topographique et d’une coupe géologique simplifiée.
Principes de cartographie – (C 3h - TP 18h)
- positionnement sur le globe ; GPS et projections cartographiques
- lecture des cartes topographiques
- cartes géologiques : méthode des horizontales ; analyse structurale
- réalisation d'une coupe géologique à partir de la carte
Déformation des roches et schéma structural – (C 4h 30 - TD 4h30)
- repérage d'un plan dans l’espace ; monoclinal
- notions sur les failles
- notions sur les plis
- schéma structural et représentation des structures dans un plan horizontal
Étude de cas (TP terrain 6h)
- Sédimentation et tectonique dans une chaîne de montagne : sortie terrain en vallée d'Ossau.
- Réalisation d'une coupe synthétique
- Référence bibliographique principale :
- « Atlas d'initiation aux cartes et aux coupes géologiques » de Sorel et Vergely (ed. Dunod)
Chimie organique et solutions 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Chimie organique fondamentale
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD
Alcanes : structure et propriétés physiques, réactivité chimique, dérivés halogénés des alcanes, réactions radicalaires, de substitution et d’élimination ;
Introduction aux alcènes : structure et propriétés physiques, réactivité et propriétés chimiques, réactions d’additions.
Chimie des Solutions 2 SDV
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD
Anglais L2 - S3
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais L2 - S3 - TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce troisième semestre l’accent sera mis sur la compréhension écrite à partir de documents de vulgarisation scientifique, l’expression écrite et la compréhension de l’oral.
Biologie moléculaire
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biologie moléculaire - CM, Biologie moléculaire - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Enseignement des bases de la biologie moléculaire afin de pouvoir aborder les enseignements plus approfondis de biologie moléculaire mais aussi de génétique et microbiologie moléculaires :
- Nature du génome et du gène ; structure des acides nucléiques, dénaturation, hybridation, nature de l'information génétique, cartographie de restriction
- Réplication ; séquençage, PCR
- Transcription ; régulation : opérons lac et trp ; maturation des ARNm
- Traduction
Cours magistraux et TD.
Biochimie générale
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
71h
Heures d'enseignement
Biochimie générale - CM, Biochimie générale - TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Techniques en biochimie : centrifugation, chromatographie, électrophorèse.
-Interaction ligand-protéine.
-Enzymologie : les enzymes, les coenzymes, cinétique enzymatique.
-Bioénergétique
-Le catabolisme : la glycolyse, le cycle des acides tricarboxyliques, la β-oxydation, la phosphorylation oxydative.
-L’anabolisme : biosynthèse des acides gras, biosynthèse des acides aminés.
Cours magistraux, TD et TP
Biologie végétale 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39,5h
Heures d'enseignement
Biologie végétale 2 - CM, Biologie végétale 2 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Ce cours s’intéresse aux Angiospermes. A travers la description de ce groupe taxonomique il s’agit de découvrir leurs caractéristiques et de mieux comprendre comment les Angiospermes sont devenus rapidement le groupe végétal dominant et le plus divers de la flore sur terre.
Il comprend des cours magistraux et des travaux pratiques couvrant :
- La reproduction sexuée des Angiospermes : développement floral, morphologie florale, double fécondation, graines et fruits, notions d'embryogenèse, germination. Réflexion sur l'acquisition des caractères autorisant la complexité des appareils végétatifs et la conquête du milieu terrestre.
- La multiplication végétative.
- Différenciation cellulaire, notions d'organes et de tissus chez les Trachéophytes. Les méristèmes primaires et secondaires : propriétés et mode de fonctionnement.
- Caractéristiques et rôle des tissus protecteurs, de soutien, parenchymateux, conducteurs et sécréteurs. Organisation anatomique de la racine, de la tige et de la feuille.
Biologie cellulaire
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Biologie cellulaire - CM, Biologie cellulaire - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
La première partie du cours portera sur l’étude du cytosquelette (diversité et fonctions) et le fonctionnement du cycle cellulaire (contrôle et chronologie). Puis, l’apoptose ou la mort cellulaire programmée sera abordée afin de comprendre les mécanismes impliqués. L’ensemble des connaissances acquises lors de ces deux premières parties nous permettra d’aborder l’oncogenèse
Plan du cours :
1- Cytosquelette
1.1 Introduction
1.2 Les microtubules
1.3 Les microfilaments
1.4 Les filaments intermédiaires
1.5 Les drogues perturbant les cytosquelette microtubulaire
1.6 Altérations viro-induites du cytosquelette
1.7 Protéines motrices et microtubules
1.8 Centrosome
2- La division cellulaire
2.1 Phases du cycle cellulaire
2.2 La mitose
2.3 La mitose, ségrégation chromosomique et mouvements intracellulaires
3- Régulation du cycle cellulaire
3.1 Stratégie générale du cycle cellulaire
3.2 Protéines kinases et cyclines
4- Mort cellulaire programmée : l’apoptose
4.1 Introduction
4.2 Apoptose et pathologies humaines
4.3 Mécanismes de l’apoptose
4.4 Activation des procaspases
4.5 Protéines Bcl-2 et les protéines IAP (Inhibiteurs de l’apoptose)
5- Apparition d’un cancer et ses causes
5.1 Introduction
5.2 Types de cancer
5.3 Progression d’un cancer
5.4 Causes d’un cancer
6- Mécanismes moléculaires impliqués dans les cancers
6.1 Gènes impliqués dans l’oncogenèse
6.2 Comment a-t-on identifié ces gènes ?
6.3 Mécanismes moléculaires aboutissant à l’altération de ces gènes
6.4 Fonction de ces gènes
7- HPV et cancer du col utérin
8- Stade d’extension : exemple du cancer du colon
9- Angiogenèse tumorale
9.1 Introduction
9.2 Mécanismes moléculaires de l’angiogenèse
10- Invasion et dissémination tumorales
10.1 Modèles in vitro
10.2 Etudes in vivo
10.3 Mécanismes moléculaires de la diffusion métastatique
10.4 La tissu-spécificité des métastases
11- Phase terminale
12- Immunité anti-tumorale + thérapeutique anti-cancéreuse
12.1 Immunité anti-tumorale
12.2 Thérapeutique anti-cancéreuse
Cours magistraux et TD.
Anatomie Comparée et Développement de Vertébrés
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
37,5h
Heures d'enseignement
Anatomie Comparée et Développement de Vertébrés - CM, Anatomie Comparée et Développement de Vertébrés - TD, Anatomie Comparée et Développement de Vertébrés - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE présente de façon détaillée le groupe zoologique des Vertébrés. Elle permettra d’établir par une approche comparée des différentes grandes fonctions et des spécificités de chaque groupe en lien avec leur histoire évolutive (passage à la prédation, sortie des eaux). L’approche descriptive de la structure des différents appareils sera complétée par l’étude de leur mise en place au cours du développement embryonnaire et leur observation lors des travaux pratiques.
I- Histoire évolutive des Vertébrés
II- La mise en place du plan d’organisation (Chez Xenopus et Gallus)
III- Ostéologie comparée
IV- Le tégument et ses dérivés
V- Système respiratoire et cardiovasculaire
VI- Système nerveux et Urogénital.
Outils pour la modélisation en biologie 1
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Outils pour la modélisation en biologie 1 - CM, Outils pour la modélisation en biologie 1 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Le cours a comme objectif de présenter les bases de la statistique descriptive. La notion d’estimateurs de position (ex : moyenne) et de dispersion (ex : variance) sera développée ainsi que la notion de variable aléatoire. De plus, les différentes lois majeures de la statistique seront également abordées telles que la loi normale, exponentielle, géométrique, et Poisson. L’ensemble de ces notions feront l’objet de TP sous le logiciel R permettant aux étudiants de se familiariser avec la programmation statistique.
Expression écrite et oral
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
9h
Heures d'enseignement
CM, TD
L’UE Expression Ecrite et Orale L2SdV a pour objectif de donner les règles de rédaction d‘un compte-rendu expérimental tel que ceux qui peuvent être demandés à l’issue de travaux pratiques. Ces règles concernent la forme ainsi que la présentation des résultats.
PEP'S 2
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Ce travail s’inscrit dans le cadre de la démarche PEP’S "Projet d’Études et Professionnel dans le Supérieur" qui est un dispositif d’accompagnement à l’orientation sur les 3 années de licence.
Le but étant d’aider l’étudiant à construire progressivement un projet d’étude et professionnel de façon fiable et réfléchit et lui permettre de personnaliser et enrichir son parcours d’étude afin faciliter son intégration post licence (poursuite d’étude ou professionnelle).
Le PEP’S 2 est le deuxième temps de ce travail et permet aux étudiants d’élaborer un projet d’études et d’identifier des actions pour compléter ses compétences.
Plan (simplifié) du cours :
- Introduction : présentation du travail et des notions de l’orientation,
- Étape 1 : Explorer les métiers de la formation,
- Étape 2 : identifier vos compétences personnelles et professionnelles,
- Étape 3 : rédiger et argumenter votre(vos) projet(s) d’étude(s) et identifier vos plans d’action.
UET Changements Globaux
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Physique du globe 1
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Physique du globe 1 - CM, Physique du globe 1 - TD
- La Terre dans le système solaire : dimensions, géométrie (plan écliptique, déclinaison solaire), mouvements de la Terre (rotation annuelle, diurne) et ses conséquences (saisons).
- Notions de positionnement : coordonnées géographiques, géométrie sphérique, distance entre deux points à la surface de la Terre, forme de la Terre (modèle sphérique, modèle ellipsoïde, géoïde).
- Les enveloppes externes de la Terre :
- Description physique de l'atmosphère (pression, température) et aspects dynamiques (circulation atmosphérique mondiale)
- Aspects énergétiques (rayonnement solaire, transferts radiatif), échanges énergétiques océan/atmosphère, bilan énergétique du système Terre-Soleil.
- Les enveloppes internes de la Terre :
- Modèles sismologique et pétrographie de la Terre – notion de croûte/manteau/noyau. Sources de chaleur interne, transfert de chaleur, modèle thermique.
- Modèle mécanique - notions de lithosphère/asthénosphère, plaques lithosphériques.
- Dynamique de la Terre : mouvements horizontaux (paléomagnétisme) et verticaux (isostasie).
Chimie des solutions 3
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Chimie des solutions 3 - CM, Chimie des solutions 3 - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
- Oxydo-réduction et pH,
- Notion de potentiel standard apparent,
- Complexation : définitions et influence du pH. Conséquences sur le pouvoir rédox, dosages complexométriques,
- Précipitation : définition et influence du pH. Conséquences sur le pouvoir rédox, dosages,
- Introduction aux diagrammes tension / pH : élaboration, définitions, interprétations qualitatives et quantitatives.
Anglais L2 - S4
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais L2 - S4 - TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce quatrième semestre l’accent sera mis sur la compréhension de l’oral à partir de documents de vulgarisation scientifique, et expression orale (phonétique et accentuation de mots)
Génétique
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Génétique - CM, Génétique - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Le cours reprendra les notions fondamentales en génétique (phénotypes : dominance/récessivité, gènes/environnement, épigénétique, mutation, génétique des organismes eucaryotes haploïdes), puis présentera la théorie chromosomique de l’hérédité (mitose et méïose, gènes portés par des chromosomes), le modèle mendélien (mono et dihybridisme) et l’extension de l’analyse mendélienne (allèles multiples, épistasie, gènes complémentaires). La recombinaison, la liaison génétique (distances génétiques, cartographie) seront décrites. Finalement la notion de caractères quantitatifs sera abordée. L’ensemble de ces connaissances seront illustrées dans les séances de travaux dirigés.
Microbiologie 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Microbiologie 2 - CM, Microbiologie 2 - TD, Microbiologie 2 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
L’UE de Microbiologie 2 vise à aborder le métabolisme des microorganismes.
Le cours reprendra les notions sur la diversité, structure et fonction des organismes procaryotes. Les bases théoriques en microbiologie générale, et particulièrement sur les métabolismes bactériens seront approfondies. L’ensemble de ces connaissances seront illustrées dans les séances de travaux dirigés et de travaux pratiques.
Chapitre I : Introduction et rappels
- Repères de la microbiologie: les procaryotes dans le monde du vivant
- Structures et fonctions des procaryotes: rappels
Chapitre II : Métabolismes Microbiens
- Relations métabolisme/nutrition/croissance
- Energétique et oxydo-réduction: rappels
- Production d’énergie via la respiration
- Production d’énergie via la fermentation
- La lithotrophie
- La régulation du métabolisme
Physiologie végétale 1 : Nutrition et métabolisme
ECTS
6 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
62h
Heures d'enseignement
Physiologie végétale 1 : Nutrition et métabolisme - CM, Physiologie végétale 1 : Nutrition et métabolisme - TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Nutrition carbonée : phase photochimique et cycle de Calvin ; métabolismes C3, C4 et CAM ; photorespiration ; production primaire et métabolites secondaires ; considérations écophysiologiques.
Nutrition hydrique : potentiel hydrique ; rôles de l’eau dans la plante ; mécanismes de l’absorption ; circulation et émission de l’eau par la plante ; fonctionnement stomatique.
Nutrition minérale : Absorption et rôles des principaux éléments minéraux ; assimilation et métabolisme de l’azote ; symbiose Rhizobium-légumineuses ; relations métaboliques entre nutrition minérale et processus photosynthétiques.
Physiologie animale 1
ECTS
6 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
66h
Heures d'enseignement
Physiologie animale 1 - CM, Physiologie animale 1 - TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
L’UE physiologie animale s’inscrit dans le cadre général de la biologie des organismes en continuité avec la biologie animale. Son approche consiste à étudier les grandes fonctions biologiques permettant à l’organisme animal de survivre et de se reproduire (maintien de l’homéostasie).
Les exemples concerneront l’ensemble des Métazoaires, mais les Mammifères et l’Homme où les connaissances sont bien établies seront des exemples privilégiés. Les rappels concernant la membrane plasmique permettront d’aborder la communication intercellulaire, puis le système nerveux, les organes sensoriels, et le fonctionnement des muscles. Enfin l’appareil cardio-vasculaire et la régulation des paramètres circulatoires feront l’objet d’une attention particulière.
I- Physiologie de la membrane plasmique
II- Neurophysiologie
III- Le système nerveux
IV- Les récepteurs sensoriels
V- La contraction musculaire
VI- Le système cardiovasculaire
Outils pour la modélisation en biologie 2
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Outils pour la modélisation en biologie 2 - CM, Outils pour la modélisation en biologie 2 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Le cours a comme objectif de permettre aux étudiants d’approfondir leur connaissance sur les statistiques descriptives mais également de se familiariser avec la notion de tests statistiques. Ce cours abordera plus particulièrement la notion de corrélation (Pearson et Spearman) ainsi que la régression linéaire sous sa forme simple mais également polynomiale. L’ensemble de ces notions feront l’objet de TP sous le logiciel R.
UE Transverse
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Plus d'informations à la page suivante : https://formation.univ-pau.fr/fr/scolarite/ue-transverses.html
Milieux sédimentaires 1
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Milieux sédimentaires 1 - CM, Milieux sédimentaires 1 - TP
Ce module est dédié à la présentation du système carbonate et de ces composants.
Il contient 9h de cours magistraux présentant les grands principes environnementaux de la sédimentation carbonatées, les classifications, et ce qui compose ces roches très présentes sur la terre.
Une série de TP au microscope complètent cette partie et permettent aux étudiants d’apprendre à reconnaitre les faciès carbonatés et à les associer à des conditions de dépôt, afin de reconstruire le paléo-environnement.
Une seconde partie, composée de 15h de TP, présente les différentes familles de micro et macro-fossiles composant les roches carbonatées. Ces TP développent l’aspect anatomique de ces organismes pour introduire des concepts d’écologie de vie.
Les TP permettront d’étudier la morphologie d’espèces majeures de chaque grande famille, donnant aux étudiants les clés de description de ces fossiles.
Chimie organique fonctionnelle, mécanisme réactionnel
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Chimie organique fonctionnelle, mécanisme réactionnel - CM, Chimie organique fonctionnelle, mécanisme réactionnel - TD
Principaux groupes fonctionnels en chimie organique : les alcynes, les composés aromatiques, les organométalliques, les alcools, les aldéhydes et les cétones, les acides et dérivés, les amines.
Les propriétés physiques et chimiques des grandes fonctions en chimie organique, avec en particulier les modes de préparation, de transformation et les mécanismes réactionnels mis en jeu.
UE CMI : Préparation à l'international
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
24h
Heures d'enseignement
TD
The course Preparation à l’International aims to bridge the gap between English grammar and vocabulary skills with what they will inevitably be faced with in the real world: a need to respond with spontaneity and precision in a variety of situations (personal, professional and socio professional).
In link with the spirit of innovation that is one of the CMI, the course also has the objective of encouraging students to see issues from different perspectives and think outside the box when proposing solutions.
Biochimie expérimentale
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
58h
Heures d'enseignement
Biochimie expérimentale - CM, TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Description des cours et TD
Méthodes analytiques
-Electrophorèse : SDS PAGE, focalisation isoélectrique, électrophorèse bi-dimensionnelle.
-Méthodes spectroscopiques : absorption UV visible, fluorescence.
-Méthodes immunologiques : marquage des anticorps, western-blot, immunoprécipitation, dosages immunologiques.
Méthodes préparatives : purification des protéines.
- Les sources de protéines : protéines recombinantes
- Extraction des protéines.
- Méthodes de séparation des protéines : chromatographie.
TP : Purification et caractérisation de la protéase chaperon Lon.
Biologie moléculaire pratique
ECTS
3 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
55h
Heures d'enseignement
CM, TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
A travers des exemples concrets, apprentissage théorique et pratique des techniques de Biologie Moléculaire couramment utilisées dans un laboratoire.
Le cours se compose des 5 Chapitres suivants :
I. Rappels sur la composition et la structure des acides nucléiques
II. Techniques de base de Biologie Moléculaire
III. Techniques d’amplification par PCR
IV. Techniques de clonage
V. Techniques de séquençage
Virologie
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Virologie - CM, Virologie - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE est une initiation à la virologie. Les virus sont le plus souvent associés à des maladies qu’elles soient humaines, animales ou végétales. Cet aspect sera abordé, ainsi que les méthodes permettant d’étudier les virus et leur classification. De plus, l’importance des virus dans le fonctionnement des écosystèmes et l’évolution des êtres vivants sera également étudiée au travers de différents exemples. Afin de compléter le cours, les étudiants travailleront sur une publication de recherche en virologie qui sera présentée au reste de la promotion.
Plan du cours :
1- Historique et définition des virus
2- Structure des virus
3- Classification des virus
4- Cycles de multiplication des virus
5- Méthodes d’étude des virus
6- Interactions virus-virus et virus-hôte
7- Un modèle d’étude : le bactériophage
8- Défense contre les virus
9- Les provirus et les prophages
10- Les virus et le Cancer
11- Interactions virus-organismes
12- Les prions
13- Les virus végétaux et les viroïdes
14- La grippe
15- VIH-1
16- Covid19
16- Virus et environnement
Génétique bactérienne
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Génétique bactérienne - CM, Génétique bactérienne - TD
L’UE de génétique bactérienne présente les grands principes des bases moléculaires et génétiques permettant l'étude des mécanismes moléculaires chez les bactéries. Les différents types de mutations et les facteurs qui conduisent à leur apparition chez ces microorganismes ainsi que les différents mécanismes de recombinaison et transferts génétiques seront adressés. Quelques exemples des applications de la génétique bactérienne seront également présentés avec des exemples d’utilisation des différents mécanismes moléculaires vus tout au long du cours.
Outils pour la modélisation en biologie 3
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
40h
Heures d'enseignement
Outils pour la modélisation en biologie 3 - CM, Outils pour la modélisation en biologie 3 - TD, Outils pour la modélisation en biologie 3 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Présenter la problématique des tests statistiques à partir d'exemples simples tirés de la biologie (tests d'ajustements, comparaison de moyennes et de fréquences) et leur mise en oeuvre avec le logiciel R. Les notions suivantes seront abordées :
- Fluctuations d'échantillonnage.
- Intervalles de confiance.
- Principe des tests statistiques.
- Tests d'ajustements à des lois de distribution.
- Lien entre variables (Chi2 et corrélation)
- Comparaison de moyennes.
- Comparaison de variances.
- Régression linéaire.
Anglais L3 - S5
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais L3 - S5 - TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce cinquième semestre l’accent sera mis sur une introduction à la préparation à la certification en anglais, Test of English for International Communication (TOEIC).
Le TOEIC mesure les compétences de compréhension écrite et orale pour les niveaux débutant à avancé et détermine si une personne peut communiquer en anglais efficacement et avec aisance dans un contexte professionnel.
UE Transverse
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Plus d'informations à la page suivante : https://formation.univ-pau.fr/fr/scolarite/ue-transverses.html
PEP'S 3
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
0h
Heures d'enseignement
PEP'S 3 - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Il s'agit ici de construire un projet de poursuite d’études ou professionnel, de définir votre plan d'action puis le mettre en œuvre en préparant vos candidatures.
A cet effet, le parcours en ligne PEP'S 3 est composé des trois étapes proposant chacune des pistes audio, des diaporamas ou des infographies et des activités.
Plan (simplifié) du cours :
- Introduction
- Avant de commencer : retour sur l’UE PEP’S 2 : Projet d’études et professionnel dans le supérieur en deuxième année de licence
- Connaitre ses atouts et ses compétences
- Explorer les possibles
- Plan d’action : candidater
- Que faire en cas de refus : propose des informations concernant la procédure à suivre en cas de refus d'admission en master.
Physiologie animale 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Physiologie animale 2 - CM, Physiologie animale 2 - TD, Physiologie animale 2 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE permet de compléter l’étude des grandes fonctions biologiques commencée avec l’UE physiologie animale 1. La fonction de nutrition au sens large et les échanges entre l’organisme et son environnement seront au cœur de cette UE (Prise alimentaire et digestion, respiration, Excrétion, osmorégulation, thermorégulation). L’objectif de cette UE de fin de licence est de donnée une compréhension de l’organisme dans sa globalité en appréhendant notamment l’interaction entre les systèmes. Ces interactions et le système endocrine sont abordés en conclusion.
I- Prise alimentaire et digestion
II- La respiration
III- Excrétion
IV- Thermorégulation
Physiologie végétale 2 : Croissance et Développement
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Physiologie végétale 2 : Croissance et Développement - CM, Physiologie végétale 2 : Croissance et Développement - TD, Physiologie végétale 2 : Croissance et Développement - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Ce cours présente les différentes étapes du développement des plantes à fleurs, de la plantule à la plante sénescente. L’influence des facteurs environnementaux et hormonaux contrôlant la croissance et la reproduction des végétaux supérieurs sera étudiée en insistant sur les processus cellulaires et moléculaires impliqués.
Les techniques de biotechnologie végétale (culture in vitro et utilisation des phytohormones, génie génétique, transgenèse) utilisées en amélioration des plantes sont également abordées.
Microbiologie pratique
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
25h
Heures d'enseignement
TP, TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Le geste microbiologique, isolement et caractérisation de souches pures, la croissance, bactéries d’intérêt sanitaire
Plan du cours :
- Méthodes de dénombrement des bactéries hétérotrophes aérobies d’un échantillon d’eau.
- Identification de souches bactériennes.
- Contrôle sanitaire d’un prélèvement d’eau.
- Croissance et activité enzymatique d’une souche bactérienne pure.
Travaux pratiques.
Chimie analytique 1
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD
- Partie 1 : Interaction rayonnement/matière,
- Partie 2 : Spectroscopiques IR : interprétation des spectres et dosage (analyse qualitative et quantitative),
- Partie 3 : Spectroscopie RMN : analyse qualitative.
Technique de programmation appliquée à la biologie
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Technique de programmation appliquée à la biologie - CM, Technique de programmation appliquée à la biologie - TD, Technique de programmation appliquée à la biologie - TP
- Introduction au développement d’un programme informatique
- Notions de bases pour l’écriture des programmes
- Compléments sur les types de données
- Fichiers
- Module, librairie, bibliothèque
UE CMI : Certification Voltaire
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Heures d'enseignement
TP
Biochimie des protéines
ECTS
6 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
34,5h
Heures d'enseignement
Biochimie des protéines - CM, Biochimie des protéines - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Solutions Aqueuses : structure de la molécule d’eau et propriétés de l’eau.
Structure des protéines.
Stabilité des protéines.
Repliement des protéines : chaperons et autres assistants du repliement.
Oxydation des protéines
Dégradation des protéines.
Enzymologie approfondie.
-Vitesse de réaction, loi de vitesse et ordre de la réaction, théorie de l’état de transition.
-Réactions à deux substrats.
-Régulation de l’activité enzymatique.
Transport à travers les membranes.
La phosphorylation oxydative.
Cours magistraux, TD et TP
Biologie moléculaire 3
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biologie moléculaire 3 - CM, Biologie moléculaire 3 - TD
Approfondissement de connaissances en biologie moléculaire :
- CONFORMATION DES GENOMES
Complexité des génomes procaryotes et eucaryotes
Structure des génomes chloroplastiques et mitochondriaux
Réplication des génomes
Topoisomérases
Régulation de la réplication
- ORGANISATION DES GENOMES
Structure des gènes chez les organismes procaryotes et eucaryotes
Expression des gènes
Régulation de l'expression génique chez les organismes procaryotes et eucaryotes
- PLASTICITE GENOMIQUE
Eléments mobiles
Plasmides
Transposons
Intégrons
Immunologie
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Immunologie - CM, Immunologie - TD
- Cellules et organes du système immunitaires
- Structure et fonction des immunoglobulines
- Le complexe majeur d’histocompatibilité
- Le système du complément
- Génétique du système HLA et des immunoglobulines
- La réponse immune
- Techniques d’immunologie
Anglais L3 - S6
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais L3 - S6 - TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce sixième semestre l’accent sera mis sur l’expression orale (et écrite en fonction du niveau CECRL de l’étudiant).
Outils Bioinformatiques
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TP
Cette unité complète les connaissances acquises en biologie moléculaire en permettant d’explorer et d’utiliser les séquences présentes dans les nombreuses bases de données.
Plusieurs outils de bioinformatique seront utilisés pour analyser ces données, notamment par l’identification de gènes, de mutations, de domaines ou motifs, pouvant permettre de proposer des fonctions aux protéines et des phénotypes aux organismes étudiés.
Le cours se compose des 4 chapitres suivants :
I- Introduction de la Bioinformatique,
II- Les Bases de Données,
III- Les Formats,
IV- L’Alignement de Séquences.
Travail d'initiative en Biologie
ECTS
3 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Travail d'initiative en Biologie - CM, Travail d'initiative en Biologie - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Dans cette UE l’étudiant travaillera en équipe de 2 à 4 étudiants autour d’une problématique scientifique simple. Après une phase de recherche bibliographique, cette problématique débouchera sur un travail personnel dont la nature peut varier : observation et description d’objets naturels ou artificiels, traitement de données, mise en évidence de phénomènes, expérimentation, modélisation, simulation etc. Ce travail réalisé en autonomie doit suivre une démarche scientifique quantitative permettant d’avoir un regard critique sur la production réalisée avec un minimum de moyens. L’évaluation aura lieu sous la forme d’une soutenance orale individuelle, complétée par une fiche de synthèse.
Cette UE a pour objectif la valorisation des compétences pratiques et de l’autonomie de l’étudiant vis-à-vis d’une démarche scientifique quantitative tout en développant un recul critique sur la démarche développée. Les capacités de communication lors de la soutenance et au sein du groupe seront également développées pour mener à bien ce travail.
Stage professionnel 2 mois
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Description du cours et modalités pédagogiques :
Le stage s’effectue de début avril à fin mai (8 semaines minimum) mais peut s’étendre jusqu’à fin août (24 semaines). Il se déroule en France ou à l’étranger, dans une structure d’accueil privée, publique ou parapublique avec laquelle une convention de stage est signée.
L’étudiant est mis en situation de recherche d’emploi : il effectue l’ensemble des démarches, depuis la recherche de l’entreprise d’accueil jusqu’à la signature de la convention. Il est immergé dans le monde professionnel de 8 à 24 semaines et peut établir ses premiers contacts professionnels.
Cette UE est ouverte aux étudiants des parcours BCM et BGST. Pour ces derniers, il fortement recommander d’effectuer le stage au sein d’un établissement scolaire essentielle pour les étudiants de L3 qui souhaite poursuivre leurs études en Master MEEF.
IMPORTANT : Le stage de L3 compte pour un total de 6 ECTS avec 2 ECTS de l’UE stage professionnel et 4 ECTS de l’UE outils bibliographiques – projet. Il est donc impératif de s’inscrire aux deux UE pour pouvoir valider la totalité des ECTS.
Outils bibliographiques
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
35h
Heures d'enseignement
Outils bibliographiques - Projet - TD, Outils bibliographiques - Projet - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE est associée à l’UE stage professionnel et vient sanctionner l’évaluation du stage par le rapport de stage et la présentation orale. Le but de cette UE est donc de familiariser les étudiants avec la rédaction d’un rapport de stage scientifique ou pédagogique en suivant les consignes de rédaction transmises par l’équipe pédagogiques. L’es étudiants vont également avoir l’opportunité de défendre leur stage par une présentation orale qui aura lieu environ une semaine après la fin du stage.
Cette UE est ouverte aux étudiants des parcours Biologie Cellulaire et Moléculaire (BCM) et parcours Biologie Générale et Sciences de la Terre (BGST). Pour les étudiants se destinant aux métiers de l’enseignementPour ces derniers, il fortement recommanderé que le stage soit effectué au sein d’un établissement scolaire. Un apport de connaissances sur le système éducatif et le métier d’enseignant sera apporté avant le stage.
IMPORTANT : Le stage de L3 compte pour un total de 6 ECTS avec 2 ECTS de l’UE stage professionnel et 4 ECTS de l’UE outils bibliographiques – projet. Il est donc impératif de s’inscrire aux deux UE pour pouvoir valider la totalité des ECTS.
Microbiologie environnementale
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
CM, TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Depuis l’apparition de la vie unicellulaire sur la Terre, les microorganismes ont pu coloniser la plupart des écosystèmes terrestres de l’atmosphère jusqu’à plusieurs kilomètres de profondeur dans la croute terrestre. Les microorganismes sont à la base des chaines alimentaires. Ils participent au recyclage de la matière et aux grands cycles biogéochimiques. Les buts de cette UE seront de comprendre les techniques d’études de ces microorganismes dans l’environnement, de comprendre le rôle des microorganismes dans les cycles biogéochimiques et de comprendre les interactions entre ces microorganismes mais également avec leur hôte (plante, animal) avec un focus sur l’écosystème microbien de l’Homme.
Plan du cours :
1- Introduction
1.1 Buts de l’écologie microbienne
1.2 Fonctions des microorganismes
1.3 Procaryotes : la majorité silencieuse
2- Qu’est-ce que l’écologie ?
2.1 Niveaux inférieurs d’organisation du vivant
2.2 Niveaux supérieurs d’organisation du vivant
2.3 Les niveaux d’étude de l’écologie
2.4 Les domaines d’étude de l’écologie
2.5 Notion de facteur écologique
2.6 Valence écologique et aire de répartition des microorganismes
2.7 La notion d’espèce en microbiologie
3- Etude de la biodiversité microbienne
3.1 Echantillonnage
3.2 Microscopie
3.3 Cytométrie de flux
3.4 Sélection et isolements
3.5 Méthodes moléculaires
3.6 Autres méthodes
4- Application aux tapis microbiens
4.1 Utilisation d’inhibiteurs
4.2 Fractionnement isotopique
4.3 Indices de diversité
5- Cycles biogéochimiques
5.1 Chaines alimentaires et boucle microbienne
5.2 Carbone
5.3 Azote
5.4 Soufre
5.5 Phosphore
5.6 Métaux
6- Interactions entre les microorganismes
6.1 Introduction
6.2 Neutralisme
6.3 Amensalisme
6.4 Prédation
6.5 Compétition
6.6 Parasitisme
6.7 Commensalisme
6.8 Coopération
6.9 Mutualisme
7- Le microbiote humain
Étude de la biodiversité sur le terrain
ECTS
3 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
38h
Heures d'enseignement
Projet travaux pratiques - TD, Projet travaux pratiques - TP, CM
Description du cours et modalités pédagogiques :
La démarche est basée sur une approche de terrain permettant de pratiquer la détermination d’espèces notamment en botanique et les premières notions d’écosystèmes par le prisme de l’écologie végétale.
La démarche permet de mobiliser les connaissances de biologie végétale acquises lors des deux premières années de licence : vocabulaire anatomique, cycle de développement etc pour les végétaux sans fleur et avec fleur. Ceci pour décrire et classifier les spécimens observés in situ. La pratique sur le terrain permet également d’aborder la notion d’écosystèmes au travers de la caractérisation des végétaux ainsi que les adaptations morphologiques nécessaires.
Génétique des populations
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Génétique des populations - CM, Génétique des populations - TD
L’unité d’enseignement de génétique des populations apportent les bases indispensables à la compréhension du fonctionnement génétique des populations.
Il comprend des cours magistraux et des travaux dirigés couvrant :
- Fréquences alléliques, loi de Hardy-Weinberg, fréquences des hétérozygotes, structure génétique.
- Evolution moléculaire : déséquilibre de liaison, théorie neutraliste de l’évolution moléculaire, sélection, auto-stop.
- Pressions évolutives : mutation, dérive génétique, migration, sélection
- Subdivision des populations et statistiques F (statistique de Wright, effet Walhund).
- Spéciation
Chimie Analytique 2 pour SDV
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Heures d'enseignement
CM, TD
Évolution et Diversité
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
CM, TD
Évolution
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Evolution - CM, Evolution - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
De l'origine de la vie jusqu'à aujourd'hui, les êtres vivants ont évolué et se sont grandement diversifiés. Cette UE propose de s'intéresser aux grands concepts et mécanismes de l'évolution, aux grandes théories de l'évolution jusqu'à la caractérisation de la diversité des êtres vivants. Les objectifs de l’EC Evolution sont de donner les clés de compréhension des processus tels que la sélection naturelle de Darwin afin d'appréhender les histoires évolutives des êtres vivants et de comprendre la logique de leur classification proposée dans l’EC Diversité (domaine du vivant : bactérie, archées, eucaryotes-protistes végétaux, fungi, animaux...). Il sera aussi proposé une mise en contexte historique pour comprendre le cheminement de ces concepts et la mise en pratique d'outils pour caractériser et mesurer les traits évolutifs.
Le cours sera divisé en trois partie principales :
- Des repères historiques qui montrent le cheminement des concepts liés aux théories de l’évolution
- Comment montrer qu’il y a évolution, faits, expériences indices qui conduisent aux théories
- Mécanismes, interprétations et explications des processus à l’origine des théories de l’évolution
Diversité
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Diversité - CM, Diversité - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Dans la prolongation de l’EC Evolution, cette UE propose d’aborder la diversité résultant des processus évolutifs. Les principes et l’histoire de la classification du vivant seront abordés afin de comprendre le cadre épistémologique permettant d’appréhender la diversité. Différentes méthodes de la systématique phylogénétique seront explorées et comparées lors des travaux dirigés. Dans un second temps on donnera un aperçu de la diversité du vivant au cours des temps géologiques depuis l’origine du vivant jusqu’aux grand domaines actuels. Des exemples d’Eucaryotes unicellulaires notamment parasites ou ayant une importance écologique particulière seront abordés. Enfin cette UE constituera par ailleurs une introduction aux UE du second semestre : Microbiologie, Biologie végétale et Biologie animale.
Chapitre 1 – Classer le vivant
Chapitre 2 – Histoire de la vie sur Terre
Chapitre 3 – Les grands ensembles du vivant
Biologie cellulaire
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biologie cellulaire - CM, Biologie cellulaire - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE a pour but de présenter les bases de l’organisation des cellules, structures fondamentales du vivant.
- Définition du vivant et importance de la cellule. Méthodes microscopiques. Génome, expression génique, protéines
- Cellule procaryote : définitions, morphologies, génome, paroi cellulaire, composants externes de la paroi cellulaire, membrane plasmique, cytoplasme
- Cellule eucaryote : caractéristiques et spécialisations de la membrane plasmique, endo et exocytose
- Noyau des cellules eucaryotes : organisation nucléosomique, réplication des chromosomes, transcription chez les eucaryotes
- Reticulum endoplasmique, synthèse et exportation des protéines et des lipides par le RE, transport vésiculaire, structure et fonction de l'appareil de Golgi, lysosomes
- Organites semi-autonomes : structure et fonction des mitochondries et des chloroplastes
- Cytosquelette
- Cycles cellulaires eucaryotes (mitotique et méiotique)
Macromolécules
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Macromolécules - CM, Macromolécules - TD
Structures, propriétés et rôles biologiques des aminoacides, peptides et protéines, des oses et polyosides, des lipides, des nucléotides et acides nucléiques.
Chimie organique et des solutions pour SDV
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Chimie des solutions 1 pour SDV
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD
Chimie organique structure des molécules pour SDV
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD
Mathématiques générales
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Mathématiques générales 1 - CM, Mathématiques générales 1 - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Toutes les notions traitées dans ce cours sont abordées dans un contexte pratique, tiré de problèmes de la physique de la chimie et de modèles de la biologie. Cette approche dit permettre à l’étudiant de comprendre comment les mathématiques qui peuvent paraître théoriques sont en réalité un outil primordial pour l’ensemble des sciences et pour la biologie en particulier. Les thèmes abordés sont les suivants :
- Pourcentage, accroissement, proportionnalité et règle de trois
- Les suites numériques
- Résolution de systèmes d’équations
- Les fonctions et notion de dérivée
- Erreurs de mesure et incertitudes (moyenne, variance, écart-type, régression linéaire et moindre carrés)
- Intégrales et primitives
- Équations différentielles (chute d’un corps, modèles démographiques, modèles proie-prédateurs…)
Anglais L1 - S1
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce premier semestre l’accent sera mis sur la compréhension écrite à partir de documents de vulgarisation scientifique.
Santé 1
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Plus d'informations sur le site de l'université partenaire de Bordeaux : https://sante.u-bordeaux.fr/Espace-etudiant/Tout-sur-vos-etudes/PASS-Parcours-Acces-Specifique-Sante
Introduction à la physique générale pour SDV
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Introduction à la physique générale pour SDV - CM, Introduction à la physique générale pour SDV - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Optique géométrique :
Lumière, vue & vision, nature et vitesse de la lumière, le spectre lumineux.
Réfraction : indice de réfraction et loi de Descartes.
Formation des images : système optique, objet & image, foyers optiques.
Dioptres : relation dans un dioptre sphérique, construction d’une image à travers un dioptre sphérique, dioptres plans.
Lentilles minces, relation de conjugaison, foyers principaux objet et image, construction d’une image, grandissements transversal et angulaire, lames à faces parallèles, défauts des lentilles, association de deux lentilles minces.
Miroirs, relation de conjugaison, construction d’une image.
Instruments d’optique : l’œil, la loupe & le microscope.
Mécanique des fluides :
État fluide.
Hydrostatique : force & pression, pression dans un fluide, forces de pression sur une paroi, le théorème d’Archimède.
Effets physiologiques de la pression : solubilité des gaz dans un liquide, pressions partielles et physiologie, toxicité des gaz, limites humaines.
Notion de dynamique des fluides : cisaillement, viscosité et turbulence, l’hémodynamique.
Méthodologie du travail universitaire
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE aidera les primo-entrants à l’université à prendre leurs repères dans leur formation afin de réussir au mieux leur licence. Des méthodes élémentaires indispensables au travail d’un biologiste sont travaillées : microscopie, conversions d’unités de mesure, utilisation graphique de données expérimentales.
Écologie et Écosystèmes
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Ecologie et Ecosystèmes - CM, Ecologie et Ecosystèmes - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
L’écologie est aujourd’hui au centre de réflexions globales et de prises de conscience sur l’évolution des sociétés modernes, des comportements individuels et du fonctionnement de notre planète. Cette UE présente les concepts d’écologie sur la structure de la biosphère et de son fonctionnement. Ses différentes composantes, populations et écosystèmes sont abordés et caractérisés. Enfin à la lumière des aspects fonctionnels de notre environnement, un décryptage des enjeux de l’écologie moderne est proposé afin d’appréhender la place de l’Homme et de l’impact de ses activités.
Le cours sera divisé en trois parties principales :
- Les interactions de l’individu avec son environnement, notion de facteur écologie
- Structure et fonctionnement de l’écosystème, notion de flux et de cycles biogéochimiques
- Ecologie de la population, structuration, dynamique et interactions
Microbiologie 1
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
34,5h
Heures d'enseignement
Microbiologie - CM, Microbiologie - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
La microbiologie est une discipline qui comprend des domaines d’étude variés que ce soit en santé, en industrie ou en écologie, et s’intéresse à de nombreux organismes et entités biologiques (virus, bactéries, champignons…).
Une introduction générale permettra d’appréhender l’étendue de la discipline, de la découverte des microorganismes aux domaines de recherche actuels. Puis l’accent sera mis sur le monde bactérien. Les bactéries et l’Homme sont indissociables, beaucoup nous protègent, certaines sont pathogènes alors que d’autres nous sont très utiles. L’objectif de cette UE est d’apporter les connaissances nécessaires, de l’organisation de la cellule à la multiplication bactérienne, pour comprendre comment nous les étudions, les utilisons et les contrôlons.
Le cours est organisé en 5 chapitres :
I- Introduction à la Microbiologie
II- La Microscopie
III- La Cellule Bactérienne
IV- La Croissance Bactérienne
V- Le Contrôle des Microorganismes
Biologie végétale 1
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biologie végétale 1 - CM, Biologie végétale 1 - TD, Biologie végétale 1 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Après un rappel sur l’évolution des végétaux en relation avec les contraintes exercées par le milieu, la diversité et la classification des végétaux sans fleurs (des algues jusqu’aux gymnospermes) seront décrites, avec une attention particulière sur les structures et les modes de reproduction. La diversité et la biologie des champignons seront également abordées.
Biologie animale 1
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
36h
Heures d'enseignement
CM, TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE traitera de l’ensemble du monde animal, et de sa diversité. Elle s’appuie notamment sur une description des caractéristiques propres aux grands groupes zoologiques aussi bien « invertébrés » que Vertébrés. L’étude des différents plans d’organisation sera par ailleurs complétée par des données d’ordre écologique liées au mode de vie des organismes modèles étudiés. Enfin une introduction à la biologie du développement permettra d’aborder la mise en place du plan d’organisation lors du développement embryonnaire.
Introduction à la zoologie et principes du développement embryonnaire
CHAP I- Les Métazoaires non-bilatériens:
CHAP II- Les Spiraliens
CHAP III - Les Ecdysozoaires et Euarthropodes
CHAP IV - Les Deutérostomiens : Echniodermes, Chordés
CHAP V - Les Vertébrés
Anglais L1 - S2
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce second semestre l’accent sera mis sur la compréhension écrite à partir de documents de vulgarisation scientifique et l’expression écrite.
Il s’agira d’approfondir les connaissances en langue anglaise tout en continuant à développer une langue à dominante scientifique au sens large. Les compétences grammaticales et le vocabulaire continueront à être approfondis et enrichis, essentiellement à partir de documents écrits. On demandera aux étudiants de s’investir tant sur le plan de l’écrit que de l’oral dans un but d’expression la plus personnelle et spontanée possible.
Santé 2
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Plus d'informations sur le site de l'université partenaire de Bordeaux : https://sante.u-bordeaux.fr/Espace-etudiant/Tout-sur-vos-etudes/PASS-Parcours-Acces-Specifique-Sante
Santé 3
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Plus d'informations sur le site de l'université partenaire de Bordeaux : https://sante.u-bordeaux.fr/Espace-etudiant/Tout-sur-vos-etudes/PASS-Parcours-Acces-Specifique-Sante
Structures géologiques
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Structures géologiques - CM, Structures géologiques - TD, TP
Introduction à la géologie structurale à travers la réalisation de coupes et de cartes représentant des structures géologiques simples. L'objectif général est d'acquérir les bases de la lecture et de l'interprétation des cartes géologiques.
Ce cours permet d’aborder la lecture d’une carte topographique, d’une carte géologique, d’une image satellite, et de donner les grands principes de construction d’un profil topographique et d’une coupe géologique simplifiée.
Principes de cartographie – (C 3h - TP 18h)
- positionnement sur le globe ; GPS et projections cartographiques
- lecture des cartes topographiques
- cartes géologiques : méthode des horizontales ; analyse structurale
- réalisation d'une coupe géologique à partir de la carte
Déformation des roches et schéma structural – (C 4h 30 - TD 4h30)
- repérage d'un plan dans l’espace ; monoclinal
- notions sur les failles
- notions sur les plis
- schéma structural et représentation des structures dans un plan horizontal
Étude de cas (TP terrain 6h)
- Sédimentation et tectonique dans une chaîne de montagne : sortie terrain en vallée d'Ossau.
- Réalisation d'une coupe synthétique
- Référence bibliographique principale :
- « Atlas d'initiation aux cartes et aux coupes géologiques » de Sorel et Vergely (ed. Dunod)
Chimie organique fondamentale et Chimie des solutions 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Chimie des Solutions 2 SDV
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD
Chimie organique fondamentale
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD
Alcanes : structure et propriétés physiques, réactivité chimique, dérivés halogénés des alcanes, réactions radicalaires, de substitution et d’élimination ;
Introduction aux alcènes : structure et propriétés physiques, réactivité et propriétés chimiques, réactions d’additions.
Biologie moléculaire
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biologie moléculaire - CM, Biologie moléculaire - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Enseignement des bases de la biologie moléculaire afin de pouvoir aborder les enseignements plus approfondis de biologie moléculaire mais aussi de génétique et microbiologie moléculaires :
- Nature du génome et du gène ; structure des acides nucléiques, dénaturation, hybridation, nature de l'information génétique, cartographie de restriction
- Réplication ; séquençage, PCR
- Transcription ; régulation : opérons lac et trp ; maturation des ARNm
- Traduction
Cours magistraux et TD.
Biochimie générale
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
71h
Heures d'enseignement
Biochimie générale - CM, Biochimie générale - TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Techniques en biochimie : centrifugation, chromatographie, électrophorèse.
-Interaction ligand-protéine.
-Enzymologie : les enzymes, les coenzymes, cinétique enzymatique.
-Bioénergétique
-Le catabolisme : la glycolyse, le cycle des acides tricarboxyliques, la β-oxydation, la phosphorylation oxydative.
-L’anabolisme : biosynthèse des acides gras, biosynthèse des acides aminés.
Cours magistraux, TD et TP
Biologie cellulaire
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Biologie cellulaire - CM, Biologie cellulaire - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
La première partie du cours portera sur l’étude du cytosquelette (diversité et fonctions) et le fonctionnement du cycle cellulaire (contrôle et chronologie). Puis, l’apoptose ou la mort cellulaire programmée sera abordée afin de comprendre les mécanismes impliqués. L’ensemble des connaissances acquises lors de ces deux premières parties nous permettra d’aborder l’oncogenèse
Plan du cours :
1- Cytosquelette
1.1 Introduction
1.2 Les microtubules
1.3 Les microfilaments
1.4 Les filaments intermédiaires
1.5 Les drogues perturbant les cytosquelette microtubulaire
1.6 Altérations viro-induites du cytosquelette
1.7 Protéines motrices et microtubules
1.8 Centrosome
2- La division cellulaire
2.1 Phases du cycle cellulaire
2.2 La mitose
2.3 La mitose, ségrégation chromosomique et mouvements intracellulaires
3- Régulation du cycle cellulaire
3.1 Stratégie générale du cycle cellulaire
3.2 Protéines kinases et cyclines
4- Mort cellulaire programmée : l’apoptose
4.1 Introduction
4.2 Apoptose et pathologies humaines
4.3 Mécanismes de l’apoptose
4.4 Activation des procaspases
4.5 Protéines Bcl-2 et les protéines IAP (Inhibiteurs de l’apoptose)
5- Apparition d’un cancer et ses causes
5.1 Introduction
5.2 Types de cancer
5.3 Progression d’un cancer
5.4 Causes d’un cancer
6- Mécanismes moléculaires impliqués dans les cancers
6.1 Gènes impliqués dans l’oncogenèse
6.2 Comment a-t-on identifié ces gènes ?
6.3 Mécanismes moléculaires aboutissant à l’altération de ces gènes
6.4 Fonction de ces gènes
7- HPV et cancer du col utérin
8- Stade d’extension : exemple du cancer du colon
9- Angiogenèse tumorale
9.1 Introduction
9.2 Mécanismes moléculaires de l’angiogenèse
10- Invasion et dissémination tumorales
10.1 Modèles in vitro
10.2 Etudes in vivo
10.3 Mécanismes moléculaires de la diffusion métastatique
10.4 La tissu-spécificité des métastases
11- Phase terminale
12- Immunité anti-tumorale + thérapeutique anti-cancéreuse
12.1 Immunité anti-tumorale
12.2 Thérapeutique anti-cancéreuse
Cours magistraux et TD.
Biologie végétale 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39,5h
Heures d'enseignement
Biologie végétale 2 - CM, Biologie végétale 2 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Ce cours s’intéresse aux Angiospermes. A travers la description de ce groupe taxonomique il s’agit de découvrir leurs caractéristiques et de mieux comprendre comment les Angiospermes sont devenus rapidement le groupe végétal dominant et le plus divers de la flore sur terre.
Il comprend des cours magistraux et des travaux pratiques couvrant :
- La reproduction sexuée des Angiospermes : développement floral, morphologie florale, double fécondation, graines et fruits, notions d'embryogenèse, germination. Réflexion sur l'acquisition des caractères autorisant la complexité des appareils végétatifs et la conquête du milieu terrestre.
- La multiplication végétative.
- Différenciation cellulaire, notions d'organes et de tissus chez les Trachéophytes. Les méristèmes primaires et secondaires : propriétés et mode de fonctionnement.
- Caractéristiques et rôle des tissus protecteurs, de soutien, parenchymateux, conducteurs et sécréteurs. Organisation anatomique de la racine, de la tige et de la feuille.
Anatomie Comparée et Développement de Vertébrés
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
37,5h
Heures d'enseignement
Anatomie Comparée et Développement de Vertébrés - CM, Anatomie Comparée et Développement de Vertébrés - TD, Anatomie Comparée et Développement de Vertébrés - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE présente de façon détaillée le groupe zoologique des Vertébrés. Elle permettra d’établir par une approche comparée des différentes grandes fonctions et des spécificités de chaque groupe en lien avec leur histoire évolutive (passage à la prédation, sortie des eaux). L’approche descriptive de la structure des différents appareils sera complétée par l’étude de leur mise en place au cours du développement embryonnaire et leur observation lors des travaux pratiques.
I- Histoire évolutive des Vertébrés
II- La mise en place du plan d’organisation (Chez Xenopus et Gallus)
III- Ostéologie comparée
IV- Le tégument et ses dérivés
V- Système respiratoire et cardiovasculaire
VI- Système nerveux et Urogénital.
Outils pour la modélisation en biologie 1
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Outils pour la modélisation en biologie 1 - CM, Outils pour la modélisation en biologie 1 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Le cours a comme objectif de présenter les bases de la statistique descriptive. La notion d’estimateurs de position (ex : moyenne) et de dispersion (ex : variance) sera développée ainsi que la notion de variable aléatoire. De plus, les différentes lois majeures de la statistique seront également abordées telles que la loi normale, exponentielle, géométrique, et Poisson. L’ensemble de ces notions feront l’objet de TP sous le logiciel R permettant aux étudiants de se familiariser avec la programmation statistique.
Anglais L2 - S3
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais L2 - S3 - TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce troisième semestre l’accent sera mis sur la compréhension écrite à partir de documents de vulgarisation scientifique, l’expression écrite et la compréhension de l’oral.
Expression écrite et oral
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
9h
Heures d'enseignement
CM, TD
L’UE Expression Ecrite et Orale L2SdV a pour objectif de donner les règles de rédaction d‘un compte-rendu expérimental tel que ceux qui peuvent être demandés à l’issue de travaux pratiques. Ces règles concernent la forme ainsi que la présentation des résultats.
PEP'S 2
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
12h
Cet enseignement non disciplinaire a pour principal objectif de rendre l’étudiant acteur de son orientation. Il oblige l’étudiant à s’interroger sur son avenir professionnel, l’incite à découvrir les réalités professionnelles en lui transmettant une méthode de recherche et de traitement de l’information, et d’aide à la décision afin de construire un projet d’études et de définir un plan d’action.
UET Changements Globaux
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Chimie des solutions 3
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Chimie des solutions 3 - CM, Chimie des solutions 3 - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
- Oxydo-réduction et pH,
- Notion de potentiel standard apparent,
- Complexation : définitions et influence du pH. Conséquences sur le pouvoir rédox, dosages complexométriques,
- Précipitation : définition et influence du pH. Conséquences sur le pouvoir rédox, dosages,
- Introduction aux diagrammes tension / pH : élaboration, définitions, interprétations qualitatives et quantitatives.
Santé
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Plus d'informations sur le site de l'université partenaire de Bordeaux : https://sante.u-bordeaux.fr/Espace-etudiant/Tout-sur-vos-etudes/PASS-Parcours-Acces-Specifique-Sante
Physique du globe 1
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Physique du globe 1 - CM, Physique du globe 1 - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
- La Terre dans le système solaire : dimensions, géométrie (plan écliptique, déclinaison solaire), mouvements de la Terre (rotation annuelle, diurne) et ses conséquences (saisons).
- Notions de positionnement : coordonnées géographiques, géométrie sphérique, distance entre deux points à la surface de la Terre, forme de la Terre (modèle sphérique, modèle ellipsoïde, géoïde).
- Les enveloppes externes de la Terre :
- Description physique de l'atmosphère (pression, température) et aspects dynamiques (circulation atmosphérique mondiale)
- Aspects énergétiques (rayonnement solaire, transferts radiatif), échanges énergétiques océan/atmosphère, bilan énergétique du système Terre-Soleil.
- Les enveloppes internes de la Terre :
- Modèles sismologique et pétrographie de la Terre – notion de croûte/manteau/noyau. Sources de chaleur interne, transfert de chaleur, modèle thermique.
- Modèle mécanique - notions de lithosphère/asthénosphère, plaques lithosphériques.
- Dynamique de la Terre : mouvements horizontaux (paléomagnétisme) et verticaux (isostasie).
Génétique
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Génétique - CM, Génétique - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Le cours reprendra les notions fondamentales en génétique (phénotypes : dominance/récessivité, gènes/environnement, épigénétique, mutation, génétique des organismes eucaryotes haploïdes), puis présentera la théorie chromosomique de l’hérédité (mitose et méïose, gènes portés par des chromosomes), le modèle mendélien (mono et dihybridisme) et l’extension de l’analyse mendélienne (allèles multiples, épistasie, gènes complémentaires). La recombinaison, la liaison génétique (distances génétiques, cartographie) seront décrites. Finalement la notion de caractères quantitatifs sera abordée. L’ensemble de ces connaissances seront illustrées dans les séances de travaux dirigés.
Microbiologie 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Microbiologie 2 - CM, Microbiologie 2 - TD, Microbiologie 2 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
L’UE de Microbiologie 2 vise à aborder le métabolisme des microorganismes.
Le cours reprendra les notions sur la diversité, structure et fonction des organismes procaryotes. Les bases théoriques en microbiologie générale, et particulièrement sur les métabolismes bactériens seront approfondies. L’ensemble de ces connaissances seront illustrées dans les séances de travaux dirigés et de travaux pratiques.
Chapitre I : Introduction et rappels
- Repères de la microbiologie: les procaryotes dans le monde du vivant
- Structures et fonctions des procaryotes: rappels
Chapitre II : Métabolismes Microbiens
- Relations métabolisme/nutrition/croissance
- Energétique et oxydo-réduction: rappels
- Production d’énergie via la respiration
- Production d’énergie via la fermentation
- La lithotrophie
- La régulation du métabolisme
Physiologie végétale 1 : Nutrition et métabolisme
ECTS
6 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
62h
Heures d'enseignement
Physiologie végétale 1 : Nutrition et métabolisme - CM, Physiologie végétale 1 : Nutrition et métabolisme - TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Nutrition carbonée : phase photochimique et cycle de Calvin ; métabolismes C3, C4 et CAM ; photorespiration ; production primaire et métabolites secondaires ; considérations écophysiologiques.
Nutrition hydrique : potentiel hydrique ; rôles de l’eau dans la plante ; mécanismes de l’absorption ; circulation et émission de l’eau par la plante ; fonctionnement stomatique.
Nutrition minérale : Absorption et rôles des principaux éléments minéraux ; assimilation et métabolisme de l’azote ; symbiose Rhizobium-légumineuses ; relations métaboliques entre nutrition minérale et processus photosynthétiques.
Physiologie animale 1
ECTS
6 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
66h
Heures d'enseignement
Physiologie animale 1 - CM, Physiologie animale 1 - TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
L’UE physiologie animale s’inscrit dans le cadre général de la biologie des organismes en continuité avec la biologie animale. Son approche consiste à étudier les grandes fonctions biologiques permettant à l’organisme animal de survivre et de se reproduire (maintien de l’homéostasie).
Les exemples concerneront l’ensemble des Métazoaires, mais les Mammifères et l’Homme où les connaissances sont bien établies seront des exemples privilégiés. Les rappels concernant la membrane plasmique permettront d’aborder la communication intercellulaire, puis le système nerveux, les organes sensoriels, et le fonctionnement des muscles. Enfin l’appareil cardio-vasculaire et la régulation des paramètres circulatoires feront l’objet d’une attention particulière.
I- Physiologie de la membrane plasmique
II- Neurophysiologie
III- Le système nerveux
IV- Les récepteurs sensoriels
V- La contraction musculaire
VI- Le système cardiovasculaire
Outils pour la modélisation en biologie 2
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Outils pour la modélisation en biologie 2 - CM, Outils pour la modélisation en biologie 2 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Le cours a comme objectif de permettre aux étudiants d’approfondir leur connaissance sur les statistiques descriptives mais également de se familiariser avec la notion de tests statistiques. Ce cours abordera plus particulièrement la notion de corrélation (Pearson et Spearman) ainsi que la régression linéaire sous sa forme simple mais également polynomiale. L’ensemble de ces notions feront l’objet de TP sous le logiciel R.
Anglais L2 - S4
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais L2 - S4 - TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce quatrième semestre l’accent sera mis sur la compréhension de l’oral à partir de documents de vulgarisation scientifique, et expression orale (phonétique et accentuation de mots)
1 UE au choix
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
UE Transverse
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Plus d'informations à la page suivante : https://formation.univ-pau.fr/fr/scolarite/ue-transverses.html
Santé
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Plus d'informations sur le site de l'université partenaire de Bordeaux : https://sante.u-bordeaux.fr/Espace-etudiant/Tout-sur-vos-etudes/PASS-Parcours-Acces-Specifique-Sante
Milieux sédimentaires 1
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Milieux sédimentaires 1 - CM, Milieux sédimentaires 1 - TP
Ce module est dédié à la présentation du système carbonate et de ces composants.
Il contient 9h de cours magistraux présentant les grands principes environnementaux de la sédimentation carbonatées, les classifications, et ce qui compose ces roches très présentes sur la terre.
Une série de TP au microscope complètent cette partie et permettent aux étudiants d’apprendre à reconnaitre les faciès carbonatés et à les associer à des conditions de dépôt, afin de reconstruire le paléo-environnement.
Une seconde partie, composée de 15h de TP, présente les différentes familles de micro et macro-fossiles composant les roches carbonatées. Ces TP développent l’aspect anatomique de ces organismes pour introduire des concepts d’écologie de vie.
Les TP permettront d’étudier la morphologie d’espèces majeures de chaque grande famille, donnant aux étudiants les clés de description de ces fossiles.
Chimie organique fonctionnelle, mécanisme réactionnel
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Chimie organique fonctionnelle, mécanisme réactionnel - CM, Chimie organique fonctionnelle, mécanisme réactionnel - TD
Principaux groupes fonctionnels en chimie organique : les alcynes, les composés aromatiques, les organométalliques, les alcools, les aldéhydes et les cétones, les acides et dérivés, les amines.
Les propriétés physiques et chimiques des grandes fonctions en chimie organique, avec en particulier les modes de préparation, de transformation et les mécanismes réactionnels mis en jeu.
Santé
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Plus d'informations sur le site de l'université partenaire de Bordeaux : https://sante.u-bordeaux.fr/Espace-etudiant/Tout-sur-vos-etudes/PASS-Parcours-Acces-Specifique-Sante
Biologie moléculaire pratique
ECTS
3 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
55h
Heures d'enseignement
CM, TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
A travers des exemples concrets, apprentissage théorique et pratique des techniques de Biologie Moléculaire couramment utilisées dans un laboratoire.
Le cours se compose des 5 Chapitres suivants :
I. Rappels sur la composition et la structure des acides nucléiques
II. Techniques de base de Biologie Moléculaire
III. Techniques d’amplification par PCR
IV. Techniques de clonage
V. Techniques de séquençage
Virologie
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Virologie - CM, Virologie - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE est une initiation à la virologie. Les virus sont le plus souvent associés à des maladies qu’elles soient humaines, animales ou végétales. Cet aspect sera abordé, ainsi que les méthodes permettant d’étudier les virus et leur classification. De plus, l’importance des virus dans le fonctionnement des écosystèmes et l’évolution des êtres vivants sera également étudiée au travers de différents exemples. Afin de compléter le cours, les étudiants travailleront sur une publication de recherche en virologie qui sera présentée au reste de la promotion.
Plan du cours :
1- Historique et définition des virus
2- Structure des virus
3- Classification des virus
4- Cycles de multiplication des virus
5- Méthodes d’étude des virus
6- Interactions virus-virus et virus-hôte
7- Un modèle d’étude : le bactériophage
8- Défense contre les virus
9- Les provirus et les prophages
10- Les virus et le Cancer
11- Interactions virus-organismes
12- Les prions
13- Les virus végétaux et les viroïdes
14- La grippe
15- VIH-1
16- Covid19
16- Virus et environnement
Génétique bactérienne
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Génétique bactérienne - CM, Génétique bactérienne - TD
L’UE de génétique bactérienne présente les grands principes des bases moléculaires et génétiques permettant l'étude des mécanismes moléculaires chez les bactéries. Les différents types de mutations et les facteurs qui conduisent à leur apparition chez ces microorganismes ainsi que les différents mécanismes de recombinaison et transferts génétiques seront adressés. Quelques exemples des applications de la génétique bactérienne seront également présentés avec des exemples d’utilisation des différents mécanismes moléculaires vus tout au long du cours.
Anglais L3 - S5
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais L3 - S5 - TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce cinquième semestre l’accent sera mis sur une introduction à la préparation à la certification en anglais, Test of English for International Communication (TOEIC).
Le TOEIC mesure les compétences de compréhension écrite et orale pour les niveaux débutant à avancé et détermine si une personne peut communiquer en anglais efficacement et avec aisance dans un contexte professionnel.
PEP'S 3
ECTS
1 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
0h
Heures d'enseignement
PEP'S 3 - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Il s'agit ici de construire un projet de poursuite d’études ou professionnel, de définir votre plan d'action puis le mettre en œuvre en préparant vos candidatures.
A cet effet, le parcours en ligne PEP'S 3 est composé des trois étapes proposant chacune des pistes audio, des diaporamas ou des infographies et des activités.
Plan (simplifié) du cours :
- Introduction
- Avant de commencer : retour sur l’UE PEP’S 2 : Projet d’études et professionnel dans le supérieur en deuxième année de licence
- Connaitre ses atouts et ses compétences
- Explorer les possibles
- Plan d’action : candidater
- Que faire en cas de refus : propose des informations concernant la procédure à suivre en cas de refus d'admission en master.
Biochimie expérimentale
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
58h
Heures d'enseignement
Biochimie expérimentale - CM, TD, TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Description des cours et TD
Méthodes analytiques
-Electrophorèse : SDS PAGE, focalisation isoélectrique, électrophorèse bi-dimensionnelle.
-Méthodes spectroscopiques : absorption UV visible, fluorescence.
-Méthodes immunologiques : marquage des anticorps, western-blot, immunoprécipitation, dosages immunologiques.
Méthodes préparatives : purification des protéines.
- Les sources de protéines : protéines recombinantes
- Extraction des protéines.
- Méthodes de séparation des protéines : chromatographie.
TP : Purification et caractérisation de la protéase chaperon Lon.
Outils pour la modélisation en biologie 3
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
40h
Heures d'enseignement
Outils pour la modélisation en biologie 3 - CM, Outils pour la modélisation en biologie 3 - TD, Outils pour la modélisation en biologie 3 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Présenter la problématique des tests statistiques à partir d'exemples simples tirés de la biologie (tests d'ajustements, comparaison de moyennes et de fréquences) et leur mise en oeuvre avec le logiciel R. Les notions suivantes seront abordées :
- Fluctuations d'échantillonnage.
- Intervalles de confiance.
- Principe des tests statistiques.
- Tests d'ajustements à des lois de distribution.
- Lien entre variables (Chi2 et corrélation)
- Comparaison de moyennes.
- Comparaison de variances.
- Régression linéaire.
1 UE au choix
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
UE Transverse
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
TD
Plus d'informations à la page suivante : https://formation.univ-pau.fr/fr/scolarite/ue-transverses.html
Santé
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Plus d'informations sur le site de l'université partenaire de Bordeaux : https://sante.u-bordeaux.fr/Espace-etudiant/Tout-sur-vos-etudes/PASS-Parcours-Acces-Specifique-Sante
Physiologie animale 2
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Physiologie animale 2 - CM, Physiologie animale 2 - TD, Physiologie animale 2 - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE permet de compléter l’étude des grandes fonctions biologiques commencée avec l’UE physiologie animale 1. La fonction de nutrition au sens large et les échanges entre l’organisme et son environnement seront au cœur de cette UE (Prise alimentaire et digestion, respiration, Excrétion, osmorégulation, thermorégulation). L’objectif de cette UE de fin de licence est de donnée une compréhension de l’organisme dans sa globalité en appréhendant notamment l’interaction entre les systèmes. Ces interactions et le système endocrine sont abordés en conclusion.
I- Prise alimentaire et digestion
II- La respiration
III- Excrétion
IV- Thermorégulation
Physiologie végétale 2 : Croissance et Développement
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Physiologie végétale 2 : Croissance et Développement - CM, Physiologie végétale 2 : Croissance et Développement - TD, Physiologie végétale 2 : Croissance et Développement - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Ce cours présente les différentes étapes du développement des plantes à fleurs, de la plantule à la plante sénescente. L’influence des facteurs environnementaux et hormonaux contrôlant la croissance et la reproduction des végétaux supérieurs sera étudiée en insistant sur les processus cellulaires et moléculaires impliqués.
Les techniques de biotechnologie végétale (culture in vitro et utilisation des phytohormones, génie génétique, transgenèse) utilisées en amélioration des plantes sont également abordées.
Microbiologie pratique
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
25h
Heures d'enseignement
TP, TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Le geste microbiologique, isolement et caractérisation de souches pures, la croissance, bactéries d’intérêt sanitaire
Plan du cours :
- Méthodes de dénombrement des bactéries hétérotrophes aérobies d’un échantillon d’eau.
- Identification de souches bactériennes.
- Contrôle sanitaire d’un prélèvement d’eau.
- Croissance et activité enzymatique d’une souche bactérienne pure.
Travaux pratiques.
Chimie analytique 1
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TD
- Partie 1 : Interaction rayonnement/matière,
- Partie 2 : Spectroscopiques IR : interprétation des spectres et dosage (analyse qualitative et quantitative),
- Partie 3 : Spectroscopie RMN : analyse qualitative.
Technique de programmation appliquée à la biologie
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Technique de programmation appliquée à la biologie - CM, Technique de programmation appliquée à la biologie - TD, Technique de programmation appliquée à la biologie - TP
- Introduction au développement d’un programme informatique
- Notions de bases pour l’écriture des programmes
- Compléments sur les types de données
- Fichiers
- Module, librairie, bibliothèque
Biochimie des protéines
ECTS
6 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
34,5h
Heures d'enseignement
Biochimie des protéines - CM, Biochimie des protéines - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Solutions Aqueuses : structure de la molécule d’eau et propriétés de l’eau.
Structure des protéines.
Stabilité des protéines.
Repliement des protéines : chaperons et autres assistants du repliement.
Oxydation des protéines
Dégradation des protéines.
Enzymologie approfondie.
-Vitesse de réaction, loi de vitesse et ordre de la réaction, théorie de l’état de transition.
-Réactions à deux substrats.
-Régulation de l’activité enzymatique.
Transport à travers les membranes.
La phosphorylation oxydative.
Cours magistraux, TD et TP
Biologie moléculaire 3
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Biologie moléculaire 3 - CM, Biologie moléculaire 3 - TD
Approfondissement de connaissances en biologie moléculaire :
- CONFORMATION DES GENOMES
Complexité des génomes procaryotes et eucaryotes
Structure des génomes chloroplastiques et mitochondriaux
Réplication des génomes
Topoisomérases
Régulation de la réplication
- ORGANISATION DES GENOMES
Structure des gènes chez les organismes procaryotes et eucaryotes
Expression des gènes
Régulation de l'expression génique chez les organismes procaryotes et eucaryotes
- PLASTICITE GENOMIQUE
Eléments mobiles
Plasmides
Transposons
Intégrons
Immunologie
ECTS
5 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Immunologie - CM, Immunologie - TD
- Cellules et organes du système immunitaires
- Structure et fonction des immunoglobulines
- Le complexe majeur d’histocompatibilité
- Le système du complément
- Génétique du système HLA et des immunoglobulines
- La réponse immune
- Techniques d’immunologie
Anglais L3 - S6
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais L3 - S6 - TD
Cette UE obligatoire vise à développer les différentes compétences langagières définies par le Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL).
Pour ce sixième semestre l’accent sera mis sur l’expression orale (et écrite en fonction du niveau CECRL de l’étudiant).
Outils Bioinformatiques
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
CM, TP
Cette unité complète les connaissances acquises en biologie moléculaire en permettant d’explorer et d’utiliser les séquences présentes dans les nombreuses bases de données.
Plusieurs outils de bioinformatique seront utilisés pour analyser ces données, notamment par l’identification de gènes, de mutations, de domaines ou motifs, pouvant permettre de proposer des fonctions aux protéines et des phénotypes aux organismes étudiés.
Le cours se compose des 4 chapitres suivants :
I- Introduction de la Bioinformatique,
II- Les Bases de Données,
III- Les Formats,
IV- L’Alignement de Séquences.
Stage professionnel 2 mois
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Description du cours et modalités pédagogiques :
Le stage s’effectue de début avril à fin mai (8 semaines minimum) mais peut s’étendre jusqu’à fin août (24 semaines). Il se déroule en France ou à l’étranger, dans une structure d’accueil privée, publique ou parapublique avec laquelle une convention de stage est signée.
L’étudiant est mis en situation de recherche d’emploi : il effectue l’ensemble des démarches, depuis la recherche de l’entreprise d’accueil jusqu’à la signature de la convention. Il est immergé dans le monde professionnel de 8 à 24 semaines et peut établir ses premiers contacts professionnels.
Cette UE est ouverte aux étudiants des parcours BCM et BGST. Pour ces derniers, il fortement recommander d’effectuer le stage au sein d’un établissement scolaire essentielle pour les étudiants de L3 qui souhaite poursuivre leurs études en Master MEEF.
IMPORTANT : Le stage de L3 compte pour un total de 6 ECTS avec 2 ECTS de l’UE stage professionnel et 4 ECTS de l’UE outils bibliographiques – projet. Il est donc impératif de s’inscrire aux deux UE pour pouvoir valider la totalité des ECTS.
Outils bibliographiques
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
35h
Heures d'enseignement
Outils bibliographiques - Projet - TD, Outils bibliographiques - Projet - TP
Description du cours et modalités pédagogiques :
Cette UE est associée à l’UE stage professionnel et vient sanctionner l’évaluation du stage par le rapport de stage et la présentation orale. Le but de cette UE est donc de familiariser les étudiants avec la rédaction d’un rapport de stage scientifique ou pédagogique en suivant les consignes de rédaction transmises par l’équipe pédagogiques. L’es étudiants vont également avoir l’opportunité de défendre leur stage par une présentation orale qui aura lieu environ une semaine après la fin du stage.
Cette UE est ouverte aux étudiants des parcours Biologie Cellulaire et Moléculaire (BCM) et parcours Biologie Générale et Sciences de la Terre (BGST). Pour les étudiants se destinant aux métiers de l’enseignementPour ces derniers, il fortement recommanderé que le stage soit effectué au sein d’un établissement scolaire. Un apport de connaissances sur le système éducatif et le métier d’enseignant sera apporté avant le stage.
IMPORTANT : Le stage de L3 compte pour un total de 6 ECTS avec 2 ECTS de l’UE stage professionnel et 4 ECTS de l’UE outils bibliographiques – projet. Il est donc impératif de s’inscrire aux deux UE pour pouvoir valider la totalité des ECTS.
Microbiologie environnementale
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
CM, TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Depuis l’apparition de la vie unicellulaire sur la Terre, les microorganismes ont pu coloniser la plupart des écosystèmes terrestres de l’atmosphère jusqu’à plusieurs kilomètres de profondeur dans la croute terrestre. Les microorganismes sont à la base des chaines alimentaires. Ils participent au recyclage de la matière et aux grands cycles biogéochimiques. Les buts de cette UE seront de comprendre les techniques d’études de ces microorganismes dans l’environnement, de comprendre le rôle des microorganismes dans les cycles biogéochimiques et de comprendre les interactions entre ces microorganismes mais également avec leur hôte (plante, animal) avec un focus sur l’écosystème microbien de l’Homme.
Plan du cours :
1- Introduction
1.1 Buts de l’écologie microbienne
1.2 Fonctions des microorganismes
1.3 Procaryotes : la majorité silencieuse
2- Qu’est-ce que l’écologie ?
2.1 Niveaux inférieurs d’organisation du vivant
2.2 Niveaux supérieurs d’organisation du vivant
2.3 Les niveaux d’étude de l’écologie
2.4 Les domaines d’étude de l’écologie
2.5 Notion de facteur écologique
2.6 Valence écologique et aire de répartition des microorganismes
2.7 La notion d’espèce en microbiologie
3- Etude de la biodiversité microbienne
3.1 Echantillonnage
3.2 Microscopie
3.3 Cytométrie de flux
3.4 Sélection et isolements
3.5 Méthodes moléculaires
3.6 Autres méthodes
4- Application aux tapis microbiens
4.1 Utilisation d’inhibiteurs
4.2 Fractionnement isotopique
4.3 Indices de diversité
5- Cycles biogéochimiques
5.1 Chaines alimentaires et boucle microbienne
5.2 Carbone
5.3 Azote
5.4 Soufre
5.5 Phosphore
5.6 Métaux
6- Interactions entre les microorganismes
6.1 Introduction
6.2 Neutralisme
6.3 Amensalisme
6.4 Prédation
6.5 Compétition
6.6 Parasitisme
6.7 Commensalisme
6.8 Coopération
6.9 Mutualisme
7- Le microbiote humain
Génétique des populations
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
Génétique des populations - CM, Génétique des populations - TD
L’unité d’enseignement de génétique des populations apportent les bases indispensables à la compréhension du fonctionnement génétique des populations.
Il comprend des cours magistraux et des travaux dirigés couvrant :
- Fréquences alléliques, loi de Hardy-Weinberg, fréquences des hétérozygotes, structure génétique.
- Evolution moléculaire : déséquilibre de liaison, théorie neutraliste de l’évolution moléculaire, sélection, auto-stop.
- Pressions évolutives : mutation, dérive génétique, migration, sélection
- Subdivision des populations et statistiques F (statistique de Wright, effet Walhund).
- Spéciation
Travail d'initiative en Biologie
ECTS
3 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Travail d'initiative en Biologie - CM, Travail d'initiative en Biologie - TD
Description du cours et modalités pédagogiques :
Dans cette UE l’étudiant travaillera en équipe de 2 à 4 étudiants autour d’une problématique scientifique simple. Après une phase de recherche bibliographique, cette problématique débouchera sur un travail personnel dont la nature peut varier : observation et description d’objets naturels ou artificiels, traitement de données, mise en évidence de phénomènes, expérimentation, modélisation, simulation etc. Ce travail réalisé en autonomie doit suivre une démarche scientifique quantitative permettant d’avoir un regard critique sur la production réalisée avec un minimum de moyens. L’évaluation aura lieu sous la forme d’une soutenance orale individuelle, complétée par une fiche de synthèse.
Cette UE a pour objectif la valorisation des compétences pratiques et de l’autonomie de l’étudiant vis-à-vis d’une démarche scientifique quantitative tout en développant un recul critique sur la démarche développée. Les capacités de communication lors de la soutenance et au sein du groupe seront également développées pour mener à bien ce travail.
Étude de la biodiversité sur le terrain
ECTS
3 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
38h
Heures d'enseignement
Projet travaux pratiques - TD, Projet travaux pratiques - TP, CM
Description du cours et modalités pédagogiques :
La démarche est basée sur une approche de terrain permettant de pratiquer la détermination d’espèces notamment en botanique et les premières notions d’écosystèmes par le prisme de l’écologie végétale.
La démarche permet de mobiliser les connaissances de biologie végétale acquises lors des deux premières années de licence : vocabulaire anatomique, cycle de développement etc pour les végétaux sans fleur et avec fleur. Ceci pour décrire et classifier les spécimens observés in situ. La pratique sur le terrain permet également d’aborder la notion d’écosystèmes au travers de la caractérisation des végétaux ainsi que les adaptations morphologiques nécessaires.
Chimie Analytique 2 pour SDV
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Heures d'enseignement
CM, TD
Admission
Droits d'inscription et tarification
Consultez les montants des droits d'inscription.
A compter de la rentrée 2023-2024, l'établissement applique les droits différenciés pour tout étudiant extra communautaire s'inscrivant pour la première fois en licence.
Par Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
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Publié le 24/06/2022 | Modifié le 28/02/2024
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