UE optionnelles
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Liste des enseignements
Au choix : 6 à 7 parmi 13
Molecular ecology
2 crédits15hTrends and challenges in microbiology
2 créditsBiological Macromolecules Characterization
2 crédits18hTrace elements biogeochemical cycles
2 crédits19,5hTraitement des eaux
2 créditsTP Traitements biologiques
2 crédits32h
Quality Assurance for Analysis
2 crédits13,5hSpeciation concepts and analysis
2 crédits19,5hAnglais M2 - S3
2 crédits19,5hFrench for foreigner - S3
2 crédits39hQualité environnementale
2 crédits16,5hImaging techniques for environmental samples and materials
2 créditsHSE
2 crédits10,5hProject
4 crédits
Molecular ecology
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
15h
Heures d'enseignement
Molecular ecology CM, Molecular ecology TD
Based on scientific article presentations, the students will acquire:
- knowledge on up to date molecular methods for the study of metagenomes, metagenomic and metranscriptomic approaches;
- Applications for the environment: microbial biomarkers and bioindicators for monitoring bio-rehabilitation processes.
Trends and challenges in microbiology
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Heures d'enseignement
Trends and challenges in microbiology CM, Trends and challenges in microbiology TD
Consideration in the development of Live Biotherapeutic Products
Regulation considerations
Live Biotherapeutic Products in human health: researches status
Live Biotherapeutic Products in plant health: Research and application status
Teaching strategies: Conferences, Directed publication research and Supervised project,
Biological Macromolecules Characterization
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
18h
Heures d'enseignement
Biological Macromolecules Characterization - CM, Biological Macromolecules Characterization - TD
Introduction into proteomics and the related modern analytical methods (including proteomic mass spectrometry) for proteome analysis of biological organisms. Brief introduction into DNA sequencing, genomics and the related analytical methods. Hot topics will be integrated such as corona virus sequencing and Covid-19 tests.
The following topics are covered:
- Peptides and proteins; their structure and functions; post-translational modifications
- DNA sequencing and genomics
- The proteomic workflow
- Sample preparation (fractionation, centrifugation, extraction, interferences, denaturation, reduction, alkylation, enzymatic digestion etc.)
- Peptide and protein separation methods, gel electrophoresis
- Proteomic mass spectrometry (ESI and MALDI, high resolution mass analyzers, tandem mass spectrometry, collision induced fragmentation)
- Data treatment (fingerprint, peptide and protein sequencing, de novo sequencing)
- Data bases
- Bottom-up and top-down approaches
- Exercises: analyses of spectra, peptide sequencing
Analysis, presentation and discussion of scientific articles
Trace elements biogeochemical cycles
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Trace elements biogeochemical cycles - CM, Trace elements biogeochemical cycles - TD
Présentation du concept de cycles et des sources et puits de polluants, des cycles aquatiques et atmosphériques, des cycles continentaux et du transport colloïdal. Illustrations via des études de cas.
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Presentation of the concept of cycles and sources and sinks of pollutants, aquatic and atmospheric cycles, continental cycles and colloidal transport. Illustrations through case studies.
Traitement des eaux
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
TP Traitements biologiques
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
32h
Heures d'enseignement
TP Traitements biologiques
Sommaire des travaux pratiques :
- Suivi d’un pilote à boues activées : bilan de fonctionnement au niveau physico-chimique et biologique,
- Suivi de la dégradation d’une charge organique dans un réacteur biologique anaérobie (méthaniseur
Quality Assurance for Analysis
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
13,5h
Heures d'enseignement
Quality Assurance for Analysis - CM, Quality Assurance for Analysis - TD
- La métrologie : définition, organisation
- Assurance qualité pour l’analyse : Principes généraux.
- Validation des méthodes analytiques au laboratoire: blancs, dopages, échantillons de contrôle qualité, étalons et matériaux de référence
- Validation externe : Cartes de contrôle, essais interlaboratoires
- Accréditation
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- Metrology : definition, organization
- General principles of quality assurance for analysis
- Laboratory validation of analytical techniques (blanks, spike, quality
- control samples, Reference materials and standards…)
- External validation: control charts, proficiency testing
- Accreditation
Plenary lectures and workgroup on publications illustrating the different items to prepare an oral presentation
Speciation concepts and analysis
Niveau d'étude
BAC +5
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Speciation concepts and analysis - CM, Speciation concepts and analysis - TD
Présentation des concepts de spéciation et fractionnement, et des méthodes et techniques permettant d’aborder ces deux volets
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Presentation of the concepts of speciation and fractionation, and the methods and techniques for dealing with these two aspects
Anglais M2 - S3
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
19,5h
Heures d'enseignement
Anglais M2 - S3 - CM, Anglais M2 - S3 - TD
- Elaboration d'un diaporama servant de support à une présentation scientifique.
- Apprentissage de vocabulaire de spécialité.
- Présentation orale de documents en rapport avec la spécialité
French for foreigner - S3
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
39h
Heures d'enseignement
French for foreigner - TP
Qualité environnementale
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
16,5h
Heures d'enseignement
Qualité environnementale - CM, Qualité environnementale - TD
1-En présentiel : management des processus
Cours
- Présentation d’une démarche de management qualité/environnementale (processus),
- Présentation simplifiée des référentiels associés,
- Présentation d’exemples illustratifs,
- Présentation d’outils d’analyse systémique, d’amélioration (audits, etc.)
TD
- TD par groupe : description complète d’une activité et de son pilotage, avec analyse des risques associés,
- Présentation aux autres groupes et discussion
2-En présentiel : analyse fonctionnelle et de la valeur
Cours
- Présentation d’une démarche d’analyse
- Présentation des référentiels associés,
- Présentation d’exemples illustratifs,
TD
- TD par groupe : mise en œuvre du processus d’analyse à travers un produit jusqu’aux solutions techniques de réponse aux fonctions identifiées,
- Présentation aux autres groupes et discussion
3-En présentiel, à chaque séance
- Questions / réponses par rapport au contenu des séances précédentes.
Imaging techniques for environmental samples and materials
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Heures d'enseignement
Imaging techniques for environmental samples and materials TD
Introduction into imaging techniques with a focus of those techniques and expertise, which are available at UPPA, presented by six experts working in UPPA labs. Applications from recent research projects will be discussed.
The following topics are covered:
- Light and electron microscopy
- Secondary ion mass spectrometry: ToF-SIMS and NanoSIMS
- X-ray techniques: X-ray tomography and Synchrotron radiation X-ray techniques
- Neutron tomography
- Laser Ablation with Inductively Coupled Plasma Mass Spectrometry (LA ICPMS)
- Principles and different modes of the techniques
- Challenges for sample preparation
- Data acquisition and data treatment
Visiting of the different imaging techniques and laboratories at UPPA.
HSE
ECTS
2 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Volume horaire
10,5h
Heures d'enseignement
Environment Health Safety (HSE) - TD
Sommaire du cours :
- Notions fondamentales en droit de l’environnement et ICPE
- Le management environnemental en entreprise : principes généraux, présentation et mise en œuvre de la norme ISO 14001
- Présentation des métiers HSE : prévention et surveillance de la pollution atmosphérique, protection des milieux aquatiques, les déchets, prévention et surveillance des nuisances sonores et des vibrations.
Project
ECTS
4 crédits
Composante
Collège Sciences et Technologies pour l’Energie et l’Environnement (STEE)
Cette unité enseignement est menée en étroite collaboration avec l’APESA, centre technologique au service de la transition écologique. Il est proposé aux étudiants, dans le cadre de ce module, de travailler en autonomie sur des sujets concrets de problématiques environnementales, un référent de l’APESA étant associé à chacun des sujets. Sur une période d’environ 3 mois (de mi-octobre à mi-janvier approximativement), les étudiants auront à :
- Rechercher les documents scientifiques sur la thématique traitée
- Rédiger un document technique de synthèse
- Restituer oralement le travail effectué